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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
17/10/2017 |
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Data da última atualização: |
17/10/2017 |
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Autoria: |
ROJAS, T. C. G.; MALUTA, R. P.; KOENIGKAN, L. V.; SILVEIRA, W. D. da. |
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Afiliação: |
THAÍS C. G. ROJAS, IB/Unicamp; RENATO P. MALUTA, IB/Unicamp; LUCIANO VIEIRA KOENIGKAN, CNPTIA; WANDERLEY DIAS DA SILVEIRA, IB/Unicamp. |
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Título: |
In silico phylogenetic and virulence gene profile analyses of avian pathogenic Escherichia coli genome sequences. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Veterinária Brasileira, Rio de Janeiro, v. 34, n. 2, p. 129-133, fev. 2014. |
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DOI: |
http://dx.doi.org/10.1590/S0100-736X2014000200006 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Avian pathogenic Escherichia coli (APEC) infections are responsible for significant losses in the poultry industry worldwide. A zoonotic risk has been attributed to APEC strains because they present similarities to extraintestinal pathogenic E. coli (ExPEC) associated with illness in humans, mainly urinary tract infections and neonatal meningitis. Here, we present in silico analyses with pathogenic E. coli genome sequences, including recently available APEC genomes. The phylogenetic tree, based on multi-locus sequence typing (MLST) of seven housekeeping genes, revealed high diversity in the allelic composition. Nevertheless, despite this diversity, the phylogenetic tree was able to cluster the different pathotypes together. An in silico virulence gene profile was also determined for each of these strains, through the presence or absence of 83 well-known virulence genes/traits described in pathogenic E. coli strains. The MLST phylogeny and the virulence gene profiles demonstrated a certain genetic similarity between Brazilian APEC strains, APEC isolated in the United States, UPEC (uropathogenic E. coli) and diarrheagenic strains isolated from humans. This correlation corroborates and reinforces the zoonotic potential hypothesis proposed to APEC. |
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Palavras-Chave: |
Análise in silico; Árvore filogenética; Avian pathogenic Escherichia coli; Genes associados à virulência; Multi-locus Sequence Typing; Phylogenetic tree; Tipagem de sequência multilocus; Virulence genes. |
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Thesagro: |
Escherichia Coli. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/bitstream/doc/1077504/1/APInsilicoRojasetal2014.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Meio-Norte. |
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Data corrente: |
08/08/2013 |
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Data da última atualização: |
13/12/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
BARBOSA, D. R. e S.; OLIVEIRA, J. V. de; SILVA, P. H. S. da; BREDA, M. O.; SANTANA, M. F. de. |
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Afiliação: |
DOUGLAS RAFAEL E SILVA BARBOSA, UFRPE; JOSÉ VARGAS DE OLIVEIRA, UFRPE; PAULO HENRIQUE SOARES DA SILVA, CPAMN; MARIANA OLIVEIRA BREDA, UFRPE; MAURICÉA FIDELIS DE SANTANA, UFRPE. |
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Título: |
Influência de cultivares de feijão-caupi no crescimento populacional de Callosobruchus maculatus (FABR., 1775) (Coleoptera: Chrysomelidae: Bruchinae). |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 3., 2013, Recife. Feijão-Caupi como alternativa sustentável para os sistemas produtivos familiares e empresariais. Recife: IPA, 2013. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
CONAC 2012. Disponível em: http://www.conac2012.org/resumos/pdf/241a.pdf. Acesso em: 08 ago. 2013. |
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Conteúdo: |
Na região Nordeste do Brasil a cultura do feijão-caupi tem grande importância socioeconômica, exercendo função no suprimento das necessidades nutricionais e fixação de mão-de-obra. Dentre as pragas que atacam os grãos de feijão-caupi durante o armazenamento, destaca-se Callosobruchus maculatus, por provocar perdas quantitativas e qualitativas. O controle deste inseto é feito principalmente com inseticidas sintéticos, no entanto, com os problemas decorrentes da intoxicação de aplicadores e seleção de insetos resistentes, formas alternativas de controle têm sido buscadas. Neste contexto, o objetivo deste trabalho foi avaliar a influência de cultivares de caupi no crescimento populacional de C. maculatus. Para realização do experimento utilizou-se cultivares de caupi provenientes da Embrapa Semiárido: BRS Guariba, BRS Maratoã, BRS Milênio, BRS Paraguaçu e BRS Pujante, além da testemunha Sempre Verde. Realizou-se teste sem chance de escolha, avaliando-se número de insetos emergidos e a taxa instantânea de crescimento populacional. A cultivar BRS Pujante apresentou os melhores resultados em relação aos parâmetros biológicos testados, apresentando possivelmente resistência do tipo antibiose. |
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Palavras-Chave: |
Controle alternativo; Grãos armazenados. |
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Thesagro: |
Caruncho; Vigna Unguiculata. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/bitstream/doc/963586/1/241a.pdf
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Marc: |
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520 $aNa região Nordeste do Brasil a cultura do feijão-caupi tem grande importância socioeconômica, exercendo função no suprimento das necessidades nutricionais e fixação de mão-de-obra. Dentre as pragas que atacam os grãos de feijão-caupi durante o armazenamento, destaca-se Callosobruchus maculatus, por provocar perdas quantitativas e qualitativas. O controle deste inseto é feito principalmente com inseticidas sintéticos, no entanto, com os problemas decorrentes da intoxicação de aplicadores e seleção de insetos resistentes, formas alternativas de controle têm sido buscadas. Neste contexto, o objetivo deste trabalho foi avaliar a influência de cultivares de caupi no crescimento populacional de C. maculatus. Para realização do experimento utilizou-se cultivares de caupi provenientes da Embrapa Semiárido: BRS Guariba, BRS Maratoã, BRS Milênio, BRS Paraguaçu e BRS Pujante, além da testemunha Sempre Verde. Realizou-se teste sem chance de escolha, avaliando-se número de insetos emergidos e a taxa instantânea de crescimento populacional. A cultivar BRS Pujante apresentou os melhores resultados em relação aos parâmetros biológicos testados, apresentando possivelmente resistência do tipo antibiose.
650 $aCaruncho
650 $aVigna Unguiculata
653 $aControle alternativo
653 $aGrãos armazenados
700 1 $aOLIVEIRA, J. V. de
700 1 $aSILVA, P. H. S. da
700 1 $aBREDA, M. O.
700 1 $aSANTANA, M. F. de
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Registro original: |
Embrapa Meio-Norte (CPAMN) |
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