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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia; Embrapa Meio-Norte. |
Data corrente: |
11/08/2014 |
Data da última atualização: |
25/05/2022 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
RAPOSO, R. S.; SOUZA, I. G. B.; VELOSO, M. E. da C.; KOBAYASHI, A. K.; LAVIOLA, B. G.; DINIZ, F. M. |
Afiliação: |
R.S. Raposo, Universidade Federal do Ceara, Núcleo de Biologia Experimental.; I.G.B. Souza, Universidade Federal do Piauí.; MARCOS EMANUEL DA COSTA VELOSO, CPAMN; ADILSON KENJI KOBAYASHI, CNPAE; BRUNO GALVEAS LAVIOLA, CNPAE; FABIO MENDONCA DINIZ, CPAMN. |
Título: |
Development of novel simple sequence repeat markers from a genomic sequence survey database and their application for diversity assessment in Jatropha curcas germplasm from Guatemala. |
Ano de publicação: |
2014 |
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 13, n. 3, p. 6099-6106, Aug. 2014. |
DOI: |
http://dx.doi.org/10.4238/2014.August.7.25 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The last few years have seen a significant increase in the number of large-scale sequencing projects generating whole genome databases. These sequence databases can be surveyed (genome sequence survey) for tandem repeats as an alternative means to develop microsatellites for monitoring and selecting natural populations and cultivars of Jatropha curcas. A total of 100 tandem repeats were revealed from mining 368 genomic surveyed sequences available in the Kazusa DNA Research Institute database. Twenty microsatellite sequences were successfully amplified, resulting in repeatable and scorable polymerase chain reaction products. Genotyping of J. curcas accessions from the Guatemalan population revealed 18 polymorphic loci. The average number of alleles per locus was 6.9, and allelic sizes ranged from 94 to 299 bp. Expected and observed heterozygosities ranged from 0.118 to 0.906 and from 0.082 to 0.794, respectively. Polymorphic information content values ranged from 0.114 (JcSSR-34) to 0.886 (JcSSR-33) with an average of 0.627. Analysis with Micro-Checker indicated few null alleles for locus JcSSR-37 in Guatemalan populations, which may be a possible cause of its deviation from Hardy-Weinberg equilibrium, even after Bonferroni?s correction. No loci showed significant linkage disequilibrium. These microsatellite loci are expected to be valuable molecular markers in J. curcas because they show high levels of polymorphism and heterozygosity. |
Palavras-Chave: |
Biofuel; Energy crop; Genetic diversity; Microsatellites; Microssatélite; Physic nut. |
Thesagro: |
Biocombustível; Cultura energética; Euphorbiaceae; Pinhão de purga; Planta oleaginosa. |
Categoria do assunto: |
-- G Melhoramento Genético |
URL: |
https://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/bitstream/doc/1017730/1/ArtigoMarcosFabioGMR2014.pdf
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Marc: |
LEADER 02543naa a2200325 a 4500 001 2017730 005 2022-05-25 008 2014 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttp://dx.doi.org/10.4238/2014.August.7.25$2DOI 100 1 $aRAPOSO, R. S. 245 $aDevelopment of novel simple sequence repeat markers from a genomic sequence survey database and their application for diversity assessment in Jatropha curcas germplasm from Guatemala.$h[electronic resource] 260 $c2014 520 $aThe last few years have seen a significant increase in the number of large-scale sequencing projects generating whole genome databases. These sequence databases can be surveyed (genome sequence survey) for tandem repeats as an alternative means to develop microsatellites for monitoring and selecting natural populations and cultivars of Jatropha curcas. A total of 100 tandem repeats were revealed from mining 368 genomic surveyed sequences available in the Kazusa DNA Research Institute database. Twenty microsatellite sequences were successfully amplified, resulting in repeatable and scorable polymerase chain reaction products. Genotyping of J. curcas accessions from the Guatemalan population revealed 18 polymorphic loci. The average number of alleles per locus was 6.9, and allelic sizes ranged from 94 to 299 bp. Expected and observed heterozygosities ranged from 0.118 to 0.906 and from 0.082 to 0.794, respectively. Polymorphic information content values ranged from 0.114 (JcSSR-34) to 0.886 (JcSSR-33) with an average of 0.627. Analysis with Micro-Checker indicated few null alleles for locus JcSSR-37 in Guatemalan populations, which may be a possible cause of its deviation from Hardy-Weinberg equilibrium, even after Bonferroni?s correction. No loci showed significant linkage disequilibrium. These microsatellite loci are expected to be valuable molecular markers in J. curcas because they show high levels of polymorphism and heterozygosity. 650 $aBiocombustível 650 $aCultura energética 650 $aEuphorbiaceae 650 $aPinhão de purga 650 $aPlanta oleaginosa 653 $aBiofuel 653 $aEnergy crop 653 $aGenetic diversity 653 $aMicrosatellites 653 $aMicrossatélite 653 $aPhysic nut 700 1 $aSOUZA, I. G. B. 700 1 $aVELOSO, M. E. da C. 700 1 $aKOBAYASHI, A. K. 700 1 $aLAVIOLA, B. G. 700 1 $aDINIZ, F. M. 773 $tGenetics and Molecular Research, Ribeirão Preto$gv. 13, n. 3, p. 6099-6106, Aug. 2014.
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Registro original: |
Embrapa Meio-Norte (CPAMN) |
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Registro |
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Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Unidades Centrais. |
Data corrente: |
30/03/2016 |
Data da última atualização: |
30/03/2016 |
Autoria: |
LANGONI, H.; GUIMARÃES, F. F.; COSTA, E. O. da; JOAQUIM, S. F.; MENOZZI, B. D. |
Afiliação: |
HELIO LANGONI, FMVZ/UNESP; FELIPE FREITAS GUIMARÃES, FMVZ/UNESP; ELIZABETH OLIVEIRA DA COSTA, FMVZ/USP; SAMEA FERNANDES JOAQUIM, FMVZ/UNESP; BENEDITO DONIZET MENOZZI, FMVZ/UNESP. |
Título: |
Celularidade do leite e unidades formadoras de colônias nas mastites causadas por Staphylococcus coagulase positiva e coagulase negativa. |
Ano de publicação: |
2015 |
Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Veterinária Brasileira, Brasília, DF, v. 35, n. 6, p. 518-524, jun. 2015 |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
A mastite é a principal afecção do gado destinado à produção leiteira, que impacta significativamente a cadeia produtiva do leite, com reflexos ainda para a saúde pública. Estudou-se aspectos relacionados à etiologia, celularidade e de contagem bacteriana em 10 propriedades leiteiras, localizadas no Estado de São Paulo. Foram examinadas 1148 vacas em lactação, totalizando 4584 glândulas mamárias. Foram considerados os casos, em que houve isolamento de estafilococos coagulase positiva (SCP) e estafilococos coagulase negativa (SCN). Os resultados revelaram microbiota com vários patógenos e diferentes espécies de SCN (128 casos) e SCP (45), Staphylococcus aureus (90), Streptococcus agalactiae (70), Streptococcus dysgalactiae (69), Streptococcus uberis (29), Corynebacterium spp. (230), Klebsiella pneumoniae (28), Klebsiella oxytoca (2), Escherichia coli (15), Enterobacter sp. (3). Os resultados de contagem de células somáticas (CCS) relacionados aos SCP e SCN não mostraram diferenças entre as propriedades avaliadas, entretanto com diferenças significantes ao se avaliar a CCS entre os dois grupos de estafilococos, como pode ser evidenciado ao comparar SCN Discreto e SCP exuberante (P<0,01), SCP Discreto e SCP exuberante (P<0,001) e SCN moderado e SCP exuberante (P<0,01). A avaliação da CCS relacionada à intensidade da infecção, considerando-se como crescimento discreto o isolamento de até nove colônias, moderado de dez a 29 colônias e exuberante, com 30 ou mais colônias, revelou para ambos os grupos de estafilococos que quanto maior o número de unidades formadoras de colônias (UFC), a CCS é mais elevada, sendo sempre maior nos casos de SCP. Conclui-se que quando há maior número de UFC, há concomitantemente maior CCS/ mL de leite, no caso dos SCP e SCN, o que mostra relação direta da intensidade do processo infeccioso com a resposta da celularidade do leite, bem como pela relevância desses na etiologia das mastites e dos aspectos negativos tanto para a produção, quanto na qualidade do leite produzido nas propriedades. MenosA mastite é a principal afecção do gado destinado à produção leiteira, que impacta significativamente a cadeia produtiva do leite, com reflexos ainda para a saúde pública. Estudou-se aspectos relacionados à etiologia, celularidade e de contagem bacteriana em 10 propriedades leiteiras, localizadas no Estado de São Paulo. Foram examinadas 1148 vacas em lactação, totalizando 4584 glândulas mamárias. Foram considerados os casos, em que houve isolamento de estafilococos coagulase positiva (SCP) e estafilococos coagulase negativa (SCN). Os resultados revelaram microbiota com vários patógenos e diferentes espécies de SCN (128 casos) e SCP (45), Staphylococcus aureus (90), Streptococcus agalactiae (70), Streptococcus dysgalactiae (69), Streptococcus uberis (29), Corynebacterium spp. (230), Klebsiella pneumoniae (28), Klebsiella oxytoca (2), Escherichia coli (15), Enterobacter sp. (3). Os resultados de contagem de células somáticas (CCS) relacionados aos SCP e SCN não mostraram diferenças entre as propriedades avaliadas, entretanto com diferenças significantes ao se avaliar a CCS entre os dois grupos de estafilococos, como pode ser evidenciado ao comparar SCN Discreto e SCP exuberante (P<0,01), SCP Discreto e SCP exuberante (P<0,001) e SCN moderado e SCP exuberante (P<0,01). A avaliação da CCS relacionada à intensidade da infecção, considerando-se como crescimento discreto o isolamento de até nove colônias, moderado de dez a 29 colônias e exuberante, com 30 ou mais colônias, revelou ... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Cellularity; Celularidade; Estafilococos; Qualidade do leite; Unidade formadora de colônia. |
Thesaurus NAL: |
Milk quality; Plate count; Staphylococcus. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/141839/1/Celularidade-do-leite.pdf
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Marc: |
LEADER 02922naa a2200265 a 4500 001 2042204 005 2016-03-30 008 2015 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aLANGONI, H. 245 $aCelularidade do leite e unidades formadoras de colônias nas mastites causadas por Staphylococcus coagulase positiva e coagulase negativa. 260 $c2015 520 $aA mastite é a principal afecção do gado destinado à produção leiteira, que impacta significativamente a cadeia produtiva do leite, com reflexos ainda para a saúde pública. Estudou-se aspectos relacionados à etiologia, celularidade e de contagem bacteriana em 10 propriedades leiteiras, localizadas no Estado de São Paulo. Foram examinadas 1148 vacas em lactação, totalizando 4584 glândulas mamárias. Foram considerados os casos, em que houve isolamento de estafilococos coagulase positiva (SCP) e estafilococos coagulase negativa (SCN). Os resultados revelaram microbiota com vários patógenos e diferentes espécies de SCN (128 casos) e SCP (45), Staphylococcus aureus (90), Streptococcus agalactiae (70), Streptococcus dysgalactiae (69), Streptococcus uberis (29), Corynebacterium spp. (230), Klebsiella pneumoniae (28), Klebsiella oxytoca (2), Escherichia coli (15), Enterobacter sp. (3). Os resultados de contagem de células somáticas (CCS) relacionados aos SCP e SCN não mostraram diferenças entre as propriedades avaliadas, entretanto com diferenças significantes ao se avaliar a CCS entre os dois grupos de estafilococos, como pode ser evidenciado ao comparar SCN Discreto e SCP exuberante (P<0,01), SCP Discreto e SCP exuberante (P<0,001) e SCN moderado e SCP exuberante (P<0,01). A avaliação da CCS relacionada à intensidade da infecção, considerando-se como crescimento discreto o isolamento de até nove colônias, moderado de dez a 29 colônias e exuberante, com 30 ou mais colônias, revelou para ambos os grupos de estafilococos que quanto maior o número de unidades formadoras de colônias (UFC), a CCS é mais elevada, sendo sempre maior nos casos de SCP. Conclui-se que quando há maior número de UFC, há concomitantemente maior CCS/ mL de leite, no caso dos SCP e SCN, o que mostra relação direta da intensidade do processo infeccioso com a resposta da celularidade do leite, bem como pela relevância desses na etiologia das mastites e dos aspectos negativos tanto para a produção, quanto na qualidade do leite produzido nas propriedades. 650 $aMilk quality 650 $aPlate count 650 $aStaphylococcus 653 $aCellularity 653 $aCelularidade 653 $aEstafilococos 653 $aQualidade do leite 653 $aUnidade formadora de colônia 700 1 $aGUIMARÃES, F. F. 700 1 $aCOSTA, E. O. da 700 1 $aJOAQUIM, S. F. 700 1 $aMENOZZI, B. D. 773 $tPesquisa Veterinária Brasileira, Brasília, DF$gv. 35, n. 6, p. 518-524, jun. 2015
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Registro original: |
Embrapa Unidades Centrais (AI-SEDE) |
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