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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
26/07/2022 |
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Data da última atualização: |
10/11/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CARDOSO, T. F.; BRUSCADIN, J. J.; AFONSO, J.; PETRINI, J.; ANDRADE, B. G. N.; OLIVEIRA, P. S. N. de; MALHEIROS, J. M.; ROCHA, M. I. P.; ZERLOTINI NETO, A.; FERRAZ, J. B. S.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. |
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Afiliação: |
UFSCar; ESALQ/USP; Munster Technological University; UFSCar; Federal University of Latin American Integration, Foz do Iguaçu; UFSCar; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; FZEA/USP; ESALQ/USP; ESALQ/USP; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
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Título: |
EEF1A1 transcription cofactor gene polymorphism is associated with muscle gene expression and residual feed intake in Nelore cattle. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Mammalian Genome, v. 33, n. 4, p. 619-628, Dec. 2022. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s00335-022-09959-8 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract. Cis-acting effects of noncoding variants on gene expression and regulatory molecules constitute a significant factor for phenotypic variation in complex traits. To provide new insights into the impacts of single-nucleotide polymorphisms (SNPs) on transcription factors (TFs) and transcription cofactors (TcoF) coding genes, we carried out a multi-omic analysis to identify cis-regulatory effects of SNPs on these genes? expression in muscle and describe their association with feed efficiency-related traits in Nelore cattle. As a result, we identified one SNP, the rs137256008C > T, predicted to impact the EEF1A1 gene expression (? = 3.02; P-value = 3.51E-03) and the residual feed intake trait (? = -3.47; P-value = 0.02). This SNP was predicted to modify transcription factor sites and overlaps with several QTL for feed efficiency traits. In addition, coexpression network analyses showed that animals containing the T allele of the rs137256008 SNP may be triggering changes in the gene network. Therefore, our analyses reinforce and contribute to a better understanding of the biological mechanisms underlying gene expression control of feed efficiency traits in bovines. The cis-regulatory SNP can be used as biomarker for feed efficiency in Nelore cattle. |
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Palavras-Chave: |
Cofatores de transcrição; Expressão gênica; Fatores de transcrição; Loci de característica quantitativa; Nelore cattle; Polimorfismos de nucleotídeo único. |
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Thesagro: |
Gado Nelore. |
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Thesaurus Nal: |
Gene expression; Quantitative trait loci; Single nucleotide polymorphism; Transcription (genetics); Transcription factors. |
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Categoria do assunto: |
--
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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| Registros recuperados : 9 | |
| 2. |  | SILVA NETO, L. de F. da; INDA, A. V.; NASCIMENTO, P. C. do; GIASSON, E.; SCHMITT, C.; CURI, N. Characterization and classification of floodplain soils in the Porto Alegre metropolitan region, RS, Brazil. Ciência e Agrotecnologia, v. 39, n. 5, p. 423-434, set./out. 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 3. | | RICCI, G. D.; SUZIN, L.; COUTINHO, G. S.; SCAPINI, L. B.; SUREK, D.; SCHMITT, C. I.; DALLA COSTA, O. A. Enriquecimento ambiental para suínos. In: SIMPÓSIO DE CIÊNCIAS DA UNESP, 7., ENCONTRO DE ZOOTECNIA DA UNESP, 9., 2012. Dracena, SP. Anais... Dracena: Unesp, 2012. Projeto/Plano de Ação: 03.08.06.008.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 4. | | RICCI, G. D.; SUZIN, L.; COUTINHO, G. S.; SCAPINI, L. B.; SUREK, D.; SCHMITT, C. I.; DALLA COSTA, O. A. Manejo do corte e desgaste dos dentes de leitões e sua influência no bem-estar animal. In: SIMPÓSIO DE CIÊNCIAS DA UNESP ? DRACENA, 7., ENCONTRO DE ZOOTECNIA DA UNESP, 9., 2012. Dracena, SP. Anais... Dracena: Unesp, 2012. Projeto/Plano de Ação: 03.08.06.008.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 5. | | AVILA, V. S. de; KRABBE, E. L.; LOPES, L. dos S.; KLEIN, C. H.; ZANOTTO, D. L.; MAIORKA, A.; COUTINHO, G. S.; SCHMITT, C. I. Ausência da ação de enzimas exógenas na mitigação do impacto poluidor da cama de frangos. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 6.; SEMINÁRIO INTEGRADO DE PESQUISA E EXTENSÃO DA UnC, 2., 2012, Concórdia. Anais... Concórdia: Embrapa Suínos e Aves, 2012. p. 165. JINC. SIPEX. Projeto/Plano de Ação: 03.12.03.100-01.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 6. | | SCHMITT, C. I.; COUTINHO, G. S.; ELLERY, E. A. C.; ZANOTTO, D. L.; AJALA, L. C.; COLDEBELLA, A.; KRABBE, E. L. Granulometria do milho na amostra natural x amostra seca. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 6.; SEMINÁRIO INTEGRADO DE PESQUISA E EXTENSÃO DA UnC, 2., 2012, Concórdia. Anais... Concórdia: Embrapa Suínos e Aves, 2012. p. 163. JINC. SIPEX. Projeto/Plano de Ação: 03.10.01.030.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 7. | | SCAPINI, L. B.; RICCI, G. D.; COUTINHO, G. S.; GURSKI, T. J.; SUZIN, L.; SUREK, D.; DALLA COSTA, O. A.; SCHMITT, C. I. Suplementação de butirato de sódio na alimentação de leitões pós-desmame. In: SIMPÓSIO DE CIÊNCIAS DA UNESP ? DRACENA, 7., ENCONTRO DE ZOOTECNIA DA UNESP, 9., 2012. Dracena, SP. Anais... Dracena: Unesp, 2012. Projeto/Plano de Ação: 03.08.06.008.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 8. | | GARDNER, T. A.; BURGESS, N. D.; AGUILAR-AMUCHASTEGUI, N.; BARLOW, J.; BERENGUER, E.; CLEMENTS, T.; DANIELSEN, F.; FERREIRA, J.; FODEN, W.; KAPOS, V.; KHAN, S. M.; LEES, A. C.; PARRY, L.; ROMAN-CUESTA, R. M.; SCHMITT, C. B.; STRANGE, N.; THEILADE, I.; VIEIRA, I. C. G. A framework for integrating biodiversity concerns into national REDD+ programmes. Biological Conservation, v. 154, p. 61-71, Oct. 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 9. | | MUSCARELLA, R.; EMILIO, T.; PHILLIPS, O. L.; LEWIS, S. L.; SLIK, F.; BAKER, W. J.; COUVREUR, T. L. P.; EISERHARDT, W. L.; SVENNING, J.-C.; AFFUM-BAFFOE, K.; AIBA, S.-I.; ALMEIDA, E. C. de; ALMEIDA, S. S. de; OLIVEIRA, E. A. de; ÁLVAREZ-DÁVILA, E.; ALVES, L. F.; ALVEZ-VALLES, C. M.; CARVALHO, F. A.; GUARIN, F. A.; ANDRADE, A.; ARAGÃO, L. E. O. C.; MURAKAMI, A. A.; ARROYO, L.; ASHTON, P. S.; CORREDOR, G. A. A.; BAKER, T. R.; CAMARGO, P. B. de; BARLOW, J.; BASTIN, J.-B.; BENGONE, N. N.; BERENGUER, E.; BERRY, N.; BLANC, L.; BÖHNING-GAESE, K.; BONAL, D.; BONGERS, F.; BRADFORD, M.; BRAMBACH, F.; BREARLEY, F. Q.; BREWER, S. W.; CAMARGO, J. L. C.; CAMPBELL, D. G.; CASTILHO, C. V. de; CASTRO, W.; CATCHPOLE, D.; CERÓN MARTÍNEZ, C. E.; CHEN, S.; CHHANG, P.; CHO, P.; CHUTIPONG, W.; CLARK, C.; COLLINS, M.; COMISKEY, J. A.; MEDINA, M. N. C.; COSTA, F. R. C.; CULMSEE, H.; DAVID-HIGUITA, H.; DAVIDAR, P.; AGUILA-PASQUEL, J. del; DERROITE, G.; Di FIORE, A.; DO, T. V.; DOUCET, J.-L.; DOURDAIN, A.; DRAKE, D. R.; ENSSLIN, A.; ERWIN, T.; EWANGO, C. E. N.; EWERS, R. M.; FAUSET, S.; FELDPAUSCH, T. R.; FERREIRA, J. N.; FERREIRA, L. V.; FISCHER, M.; FRANKLIN, J.; FREDRIKSSON, G. M.; GILLESPIE, T. W.; GILPIN, M.; GONMADJE, C.; GUNATILLEKE, A. U. N.; HAKEEM, K. R.; HALL, J. S.; HAMER, K. C.; HARRIS, D. J.; HARRISON, R. D.; HECTOR, A.; HEMP, A.; HERAULT, B.; PIZANGO, C. G. H.; CORONADO, E. N. H.; HUBAU, W.; HUSSAIN, M. S.; IBRAHIM, F.-H.; IMAI, N.; JOLY, C. A.; JOSEPH, S.; K, A.; KARTAWINATA, K.; KASSI, J.; KILEEN, T. J.; KITAYAMA, K.; KLITGARD, B. B.; KOOYMAN, R.; LABRIÈRE, N.; LARNEY, E.; LAUMONIER, Y.; LAURANCE, S. G.; LAURANCE, W. F.; LAWES, M. J.; LEVESLEY, A.; LISINGO, J.; LOVEJOY, T.; LOVETT, J. C.; LU, X.; LYKKE, A. M.; MAGNUSSON, W. E.; MAHAYANI, N. P. D.; MALHI, Y.; MANSOR, A.; PEÑA, J. L. M.; MARIMON-JUNIOR, B. H.; MARSHALL, A. R.; MELGACO, K.; BAUTISTA, C. M.; MIHINDOU, V.; MILLET, J.; MILLIKEN, W.; MOHANDASS, D.; MONTEAGUDO MENDOZA, A. L.; MUGERWA, B.; NAGAMASU, H.; NAGY, L.; SEUATURIEN, N.; NASCIMENTO, M. T.; NEILL, D. A.; MENINI NETO, L.; NILUS, R.; NÚÑEZ VARGAS, M. P.; NURTJA, E.; ARAÚJO, R. N. O. de; ONRIZAL, O.; PALACIOS, W. A.; PALACIOS-RAMOS, S.; PARREN, M.; PAUDEL, E.; MORANDI, P. S.; PENNINGTON, R. T.; PICKAVANCE, G.; PIPOLY III, J. J.; PITMAN, N. C. A.; POEDJIRAHAJOE, E.; POORTER, L.; POULSEN, J. R.; PRASAD, P. R. C.; PRIETO, A.; PUYRAVAUD, J.-P.; QIE, L.; QUESADA, C. A.; RAMÍREZ-ANGULO, H.; RAZAFIMAHAIMODISON, J. C.; REITSMA, J. M.; REQUENA-ROJAS, E. J.; CORREA, Z. R.; RODRIGUEZ, C. R.; ROOPSIND, A.; ROVERO, F.; ROZAK, A.; RUDAS LLERAS, A.; RUTISHAUSER, E.; RUTTEN, G.; PUNCHI-MANAGE, R.; SALOMÃO, R. P.; SAM, H. V.; SARKER, S. K.; SATDICHANH, M.; SCHIETTI, J.; SCHMITT, C. B.; MARIMON, B. S.; SENBETA, F.; SHARMA, L. N.; SHEIL, D.; SIERRA, R.; SILVA-ESPEJO, J. E.; SILVEIRA, M.; SONKÉ, B.; STEININGER, M. K.; STEINMETZ, R.; STÉVART, T.; SUKUMAR, R.; SULTANA, A.; SUNDERLAND, T. C. H.; SURESH, H. S.; TANG, J.; TANNER, E.; STEEGE, H. ter; TERBORGH, J. W.; THEILADE, I.; TIMBERLAKE, J.; TOORES-LEZAMA, A.; UMUNAY, P.; URIARTE, M.; GAMARRA, L. V.; BULT, M. van de; HOUT, P. van der; VASQUEZ MARTINEZ, R.; VIEIRA, I. C. G.; VIEIRA, S. A.; VILANOVA, E.; CAYO, J. V.; WANG, O.; WEBB, C. O.; WEBB, E. L.; WHITE, L.; WHITFELD, T. J. S.; WICH, S.; WILLCOCK, S.; WISER, S. K.; YOUNG, K. R.; ZAKARIA, R.; ZANG, R.; ZARTMAN, C. E.; ZO-BI, I. C.; BALSLEV, H. The global abundance of tree palms. Global Ecology and Biogeography, v. 29, p. 1495-1514, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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