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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
31/07/2009 |
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Data da última atualização: |
10/07/2025 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
ROLLA, A. A. P.; BENEVENTI, M. A.; FUGANTI, R.; MARIN, S. R. R.; FARIAS, J. R. B.; BINNECK, E.; ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO, F. C. |
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Afiliação: |
AMANDA A. PAIVA ROLLA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE LONRINA; M. A. BENEVENTI, UNIVERSIDADE FEDERAL DO RIO GRANDE DO SUL; RENATA FUGANTI; SILVANA REGINA ROCKENBACH MARIN, CNPSO; JOSE RENATO BOUCAS FARIAS, CNPSO; ELISEU BINNECK, CNPSO; RICARDO VILELA ABDELNOOR, CNPSO; ALEXANDRE LIMA NEPOMUCENO, CNPSO; FRANCISMAR CORREA MARCELINO, CNPSO. |
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Título: |
Desenvolvimento e validação de um método de determinação do número de cópias de transgenes no genoma da soja por quantificação relativa por QPCR. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 5.; MERCOSOJA 2009, Goiânia. Anais... Londrina: Embrapa Soja, 2009. Seção trabalhos, t. 168. 1 CD-ROM. Editado por Adilson de Oliveira Júnior, Odilon Ferreira Saraiva, Clara Beatriz Hoffmann Campo, César de Castro. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
A caracterização molecular de plantas geneticamente modificadas (PGMs) quanto ao número de cópias do transgene em seu genoma, bem como do sítio de inserção, permite inferir sobre a estabilidade do genoma receptor após a transformação gênica. Este trabalho teve como principal objetivo avaliar a eficácia e exatidão da quantificação do número de cópias de transgenes no genoma da soja utilizando à metodologia de PCR quantitativo (qPCR), comparado a técnica pioneira de Southern blotting. Foram testados dois sistemas de quantificação por qPCR que empregam a quantificação relativa: o método do 2-∆∆Ct, previamente descrito para estudos de expressão gênica, e o apresentado neste trabalho que propõe a utilização da própria referência endógena, o gene lectina, com calibrador, sendo necessário o ajuste da fórmula para 2-∆Ct/2. Neste caso, como o gene lectina apresenta uma cópia por genoma haplóide, enquanto as plantas GM geradas são hemizigotas para cada lócus onde qual o transgene se inseriu, o resultado final de número de cópias do transgene comparado ao número de cópias do gene lectina deve ser divido por 2. A exatidão de cada sistema foi determinada por comparações com a técnica de Southern blotting. Quatro eventos PGM contendo o gene DREB1A, tiveram o número de cópias do transgene quantificados via qPCR por quantificação relativa. De acordo com os resultados três eventos tiveram o número de cópias dos cassetes determinados pelas duas metodologias de quantificação por qPCR e confirmados por Southern blotting. Somente um evento apresentou número de cópias superior por Southern blotting em relação ao qPCR. Os resultados demonstram a potencialidade da técnica na caracterização molecular em programas que desenvolvem plantas GM em larga escala, devido praticidade, rapidez e exatidão. MenosA caracterização molecular de plantas geneticamente modificadas (PGMs) quanto ao número de cópias do transgene em seu genoma, bem como do sítio de inserção, permite inferir sobre a estabilidade do genoma receptor após a transformação gênica. Este trabalho teve como principal objetivo avaliar a eficácia e exatidão da quantificação do número de cópias de transgenes no genoma da soja utilizando à metodologia de PCR quantitativo (qPCR), comparado a técnica pioneira de Southern blotting. Foram testados dois sistemas de quantificação por qPCR que empregam a quantificação relativa: o método do 2-∆∆Ct, previamente descrito para estudos de expressão gênica, e o apresentado neste trabalho que propõe a utilização da própria referência endógena, o gene lectina, com calibrador, sendo necessário o ajuste da fórmula para 2-∆Ct/2. Neste caso, como o gene lectina apresenta uma cópia por genoma haplóide, enquanto as plantas GM geradas são hemizigotas para cada lócus onde qual o transgene se inseriu, o resultado final de número de cópias do transgene comparado ao número de cópias do gene lectina deve ser divido por 2. A exatidão de cada sistema foi determinada por comparações com a técnica de Southern blotting. Quatro eventos PGM contendo o gene DREB1A, tiveram o número de cópias do transgene quantificados via qPCR por quantificação relativa. De acordo com os resultados três eventos tiveram o número de cópias dos cassetes determinados pelas duas metodologias de quantificação por qPCR e confirm... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Eventos GM; Número de cópias; PCR quantitativo. |
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Thesagro: |
Genoma; Planta Transgênica; Soja. |
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Thesaurus Nal: |
Polymerase chain reaction; Southern blotting. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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520 $aA caracterização molecular de plantas geneticamente modificadas (PGMs) quanto ao número de cópias do transgene em seu genoma, bem como do sítio de inserção, permite inferir sobre a estabilidade do genoma receptor após a transformação gênica. Este trabalho teve como principal objetivo avaliar a eficácia e exatidão da quantificação do número de cópias de transgenes no genoma da soja utilizando à metodologia de PCR quantitativo (qPCR), comparado a técnica pioneira de Southern blotting. Foram testados dois sistemas de quantificação por qPCR que empregam a quantificação relativa: o método do 2-∆∆Ct, previamente descrito para estudos de expressão gênica, e o apresentado neste trabalho que propõe a utilização da própria referência endógena, o gene lectina, com calibrador, sendo necessário o ajuste da fórmula para 2-∆Ct/2. Neste caso, como o gene lectina apresenta uma cópia por genoma haplóide, enquanto as plantas GM geradas são hemizigotas para cada lócus onde qual o transgene se inseriu, o resultado final de número de cópias do transgene comparado ao número de cópias do gene lectina deve ser divido por 2. A exatidão de cada sistema foi determinada por comparações com a técnica de Southern blotting. Quatro eventos PGM contendo o gene DREB1A, tiveram o número de cópias do transgene quantificados via qPCR por quantificação relativa. De acordo com os resultados três eventos tiveram o número de cópias dos cassetes determinados pelas duas metodologias de quantificação por qPCR e confirmados por Southern blotting. Somente um evento apresentou número de cópias superior por Southern blotting em relação ao qPCR. Os resultados demonstram a potencialidade da técnica na caracterização molecular em programas que desenvolvem plantas GM em larga escala, devido praticidade, rapidez e exatidão.
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
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Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 7 | |
| 2. |  | BATISTELA, M. J.; BUENO, A. de F.; CORBO, E.; HIDALGO, G.; NISHIKAWA, M. A. N.; SILVA, L.; BUENO, R. C. O. de F.; SILVA, R. de B. Efeito da desfolha para a cultura da soja Glycine max. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 23., 2010, Natal. [Anais...]. Natal: Emparn: Sociedade Brasileira de Entomologia, 2010. 1 p. Ref. OR59.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 3. | | BATISTELA, M. J.; BUENO, A. de F.; CORBO, E.; HIDALGO, G.; SILVA, L.; NISHIKAWA, M. A. N.; BUENO, R. C. O. de F.; BRITO, R. Efeito de diferentes estratégias de manejo de pragas na produtividade da cultura da soja Glycine max. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 23., 2010, Natal. [Anais...]. Natal: Emparn: Sociedade Brasileira de Entomologia, 2010. Poster 1680.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 4. | | BUENO, A. de F.; BATISTELA, M. J.; BUENO, R. C. O. de F.; FRANCA-NETO, J. B.; NISHIKAWA, M. A. N.; LIBÉRIO FILHO, A. Effects of integrated pest management, biological control and prophylactic use of insecticides on the management and sustainability of soybean. Crop Protection, v. 30, n. 7, p. 937-945, jul. 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 5. | | BUENO, A. de F.; BATISTELA, M. J.; MOSCARDI, F.; BUENO, R. C. O. de F.; NISHIKAWA, M.; HIDALGO, G.; SILVA, L.; GARCIA, A.; CORBO, E.; SILVA, R. B. Níveis de desfolha tolerados na cultura da soja sem a ocorrência de prejuízos à produtividade. Londrina: Embrapa Soja, 2010. 11 p. il. (Embrapa Soja. Circular Técnica, 79).| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 6. | | BUENO, A. F.; BATISTELA, M. J.; MOSCARDI, F.; BUENO, R. C. O. F.; NISHIKAWA, M. A.; HIDALGO, G.; SILVA, L.; GARCIA, A.; CORBO, E.; SILVA, R. B. Quanto tolerar de desfolha na cultura da soja antes de iniciar o controle de pragas? In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 31., 2010, Brasília, DF. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 71-74. Editores técnicos: Adilson de Oliveira Junior, Odilon Ferreira Saraiva, Regina Maria Villas Bôas de Campo Leite, César de Castro, Jussara Flores de Oliveira Arbues, Wellington Cavalcanti.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 7. | | BATISTELA, M. J.; BUENO, A. de F.; NISHIKAWA, M. A. N.; BUENO, R. C. O. de F.; HIDALGO, G.; SILVA, L.; CORBO, E.; SILVA, R. B. Re-evaluation of leaf-lamina consumer thresholds for IPM decisions in short-season soybeans using artificial defoliation. Crop Protection, v. 32, p. 7-11, Feb. 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| Registros recuperados : 7 | |
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