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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
17/10/2017 |
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Data da última atualização: |
17/10/2017 |
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Autoria: |
ROJAS, T. C. G.; MALUTA, R. P.; KOENIGKAN, L. V.; SILVEIRA, W. D. da. |
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Afiliação: |
THAÍS C. G. ROJAS, IB/Unicamp; RENATO P. MALUTA, IB/Unicamp; LUCIANO VIEIRA KOENIGKAN, CNPTIA; WANDERLEY DIAS DA SILVEIRA, IB/Unicamp. |
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Título: |
In silico phylogenetic and virulence gene profile analyses of avian pathogenic Escherichia coli genome sequences. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Veterinária Brasileira, Rio de Janeiro, v. 34, n. 2, p. 129-133, fev. 2014. |
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DOI: |
http://dx.doi.org/10.1590/S0100-736X2014000200006 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Avian pathogenic Escherichia coli (APEC) infections are responsible for significant losses in the poultry industry worldwide. A zoonotic risk has been attributed to APEC strains because they present similarities to extraintestinal pathogenic E. coli (ExPEC) associated with illness in humans, mainly urinary tract infections and neonatal meningitis. Here, we present in silico analyses with pathogenic E. coli genome sequences, including recently available APEC genomes. The phylogenetic tree, based on multi-locus sequence typing (MLST) of seven housekeeping genes, revealed high diversity in the allelic composition. Nevertheless, despite this diversity, the phylogenetic tree was able to cluster the different pathotypes together. An in silico virulence gene profile was also determined for each of these strains, through the presence or absence of 83 well-known virulence genes/traits described in pathogenic E. coli strains. The MLST phylogeny and the virulence gene profiles demonstrated a certain genetic similarity between Brazilian APEC strains, APEC isolated in the United States, UPEC (uropathogenic E. coli) and diarrheagenic strains isolated from humans. This correlation corroborates and reinforces the zoonotic potential hypothesis proposed to APEC. |
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Palavras-Chave: |
Análise in silico; Árvore filogenética; Avian pathogenic Escherichia coli; Genes associados à virulência; Multi-locus Sequence Typing; Phylogenetic tree; Tipagem de sequência multilocus; Virulence genes. |
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Thesagro: |
Escherichia Coli. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/bitstream/doc/1077504/1/APInsilicoRojasetal2014.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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| Registros recuperados : 27 | |
| 2. |  | SILVA, V. N. B.; VIEIRA, L. R.; SOUSA, C. A. F. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Morphological changes in Portulaca oleracea L. under salt stress. In: INOVAGRI INTERNATIONAL MEETING, 4.; CONGRESSO NACIONAL DE IRRIGAÇÃO E DRENAGEM, 26.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE SALINIDADE, 3., 2017, Fortaleza. Anais... Fortaleza: INOVAGRI: ABID; UFC, 2017. Não paginado.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 5. | | SANTOS, M. L.; SILVA, V. N. B.; VIEIRA, L. R.; CASARI, R. A. C. N.; SOUSA, C. A. F. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Can Setaria viridis (A 10.1) be used as model plant for validation of genes for salinity tolerance? In: INOVAGRI INTERNATIONAL MEETING, 4.; CONGRESSO NACIONAL DE IRRIGAÇÃO E DRENAGEM, 26.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE SALINIDADE, 3., 2017, Fortaleza. Anais... Fortaleza: INOVAGRI: ABID; UFC, 2017. Não paginado.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 7. | | RODRIGUES-NETO, J. C.; CORREIA, M. V.; SOUTO, A. L.; RIBEIRO, J. A. de A.; VIEIRA, L. R.; SOUZA JUNIOR, M. T.; RODRIGUES, C. M.; ABDELNUR, P. V. Metabolic fingerprinting analysis of oil palm reveals a set of differentially expressed metabolites in fatal yellowing symptomatic and non-symptomatic plants. Metabolomics, v. 14, n. 142, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 8. | | CARVALHO, C. G. I.; SANTOS, M. de L.; VIEIRA, L. R.; LOPES, A. M.; CARMONA, P. A. O.; SOUSA, C. A. F. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Morphophysiological responses of Setaria viridis to cold stress. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v.57, e02424, 2022. Título em português: Respostas morfofisiológicas de Setaria viridis ao estresse por frio.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 10. | | SANTOS, M. de L.; SILVA, V. N. B. e.; VIEIRA, L. R.; SOUSA, C. A. F. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Use of Setaria viridis (A10.1) as model plant for validation of genes for cold tolerance. In: BRAZILIAN CONGRESS OF PLANT PHYSIOLOGY, 16., 2017, São Pedro, SP. Abstract ... [S.l.]: Sociedade Brasileira de Fisiologia Vegetal, 2017. p. 108.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 11. | | YASSITEPE, J. E. de C. T.; PINTO, M. S.; VIEIRA, L. R.; BRUNO, M. H. F.; NONATO, J. V. A.; SILVA, P. A.; FERNANDES, F. R.; GERHARDT, I. R.; DANTE, R. A.; SILVA, M. J.; PAUWELS, L.; ARRUDA, P. Challenges and insights from establishing a maize transformation laboratory. In: ANNUAL MAIZE GENETICS MEETING, 66., 2024, Raleigh. Program and abstracts. Beltsville: USDA, 2024. P3.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 12. | | SALGADO, F. F.; VIEIRA, L. R.; SILVA, V. N. B.; LEAO, A. P.; GRYNBERG, P.; COSTA, M. M. do C.; TOGAWA, R. C.; SOUSA, C. A. F. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Expression analysis of miRNAs and their putative target genes confirm a preponderant role of transcription factors in the early response of oil palm plants to salinity stress. BMC Plant Biology, v. 21, n. 518, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Meio-Norte. |
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| 13. | | SALGADO, F. F.; VIEIRA, L. R.; SILVA, V. N. B.; LEAO, A. P.; GRYNBERG, P.; COSTA, M. M. do C.; TOGAWA, R. C.; SOUSA, C. A. F. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Expression analysis of miRNAs and their putative target genes confrm a preponderant role of transcription factors in the early response of oil palm plants to salinity stress. BMC Plant Biology, v. 21, 518, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 14. | | SALGADO, F. F.; VIEIRA, L. R.; SILVA, V, N. B.; LEAO, A. P.; GRYNBERG, P.; COSTA, M. M. do C.; TOGAWA, R. C.; SOUSA, C. A. F. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Prediction and identification of miRNAS in Elaeis Guinensis Jacq and analysis of their expression in oil palm plants under salinity drought stress. In: BRAZILIAN CONGRESS OF GENETICS, 67., 2022, Natal, RN. Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Genética, 2022. p. 275| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 15. | | SALGADO, F. F.; VIEIRA, L. R.; SILVA, V, N. B.; LEAO, A. P.; GRYNBERG, P.; COSTA, M. M. do C.; TOGAWA, R. C.; SOUSA, C. A. F. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Prediction and identification of miRNAS in Elaeis Guinensis Jacq and analysis of their expression in oil palm plants under salinity drought stress. In: BRAZILIAN CONGRESS OF GENETICS, 67., 2022, Natal, RN. p. 275| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 16. | | SALGADO, F. F.; SILVA, T. L. C. da; VIEIRA, L. R.; SILVA, V. N. B.; LEAO, A. P.; COSTA, M. M. do C.; TOGAWA, R. C.; SOUSA, C. A. F. de; GRYNBERG, P.; SOUZA JUNIOR, M. T. The early response of oil palm (Elaeis guineensis Jacq.) plants to water deprivation: Expression analysis of miRNAs and their putative target genes, and similarities with the response to salinity stress. Frontiers in Plant Science, n. 13, 970113, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 17. | | YASSITEPE, J. E. de C. T.; SILVA, V. C. H. da; HERNANDES-LOPES, J.; DANTE, R. A.; GERHARDT, I. R.; FERNANDES, F. R.; SILVA, P. A. da; VIEIRA, L. R.; BONATTI, V.; ARRUDA, P. Maize transformation: from plant material to the release of genetically modified and edited varieties. Frontiers in Plant Science, v. 12, p. 1-17, Oct. 2021. Article 766702.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 18. | | LOPES NETO, J. J.; ALMEIDA, T. S. DE; MEDEIROS, J. L. DE; VIEIRA, L. R.; MOREIRA, T. B.; MAIA, A. I. V.; RIBEIRO, P. R. V.; BRITO, E. S. de; FARIAS, D. F.; CARVALHO, A. F. U. Impact of bioaccessibility and bioavailability of phenolic compounds in biological systems upon the antioxidant activity of the ethanolic extract of Triplaris gardneriana seeds. Biomedicine & Pharmacotherapy, v. 88, p. 999-1007, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 19. | | BITTENCOURT, C. B.; SILVA, T. L. C. da; RODRIGUES NETO, J. C.; VIEIRA, L. R.; LEAO, A. P.; RIBEIRO, J. A. de A.; ABDELNUR, P. V.; SOUSA, C. A. F. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Insights from a multi-omics integration (MOI) study in oil palm (Elaeis gineensis Jacq.) response to abiotic stresses: part one - salinity. Plants, 11, n. 1755, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
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| 20. | | LEAO, A. P.; BITTENCOURT, C. B.; SILVA, T. L. C. da; RODRIGUES NETO, J. C.; BRAGA, I. de O.; VIEIRA, L. R.; RIBEIRO, J. A. de A.; SOUSA, C. A. F. de; ABDELNUR, P. V.; SOUZA JUNIOR, M. T. Insights from a Multi-Omics Integration (MOI) Study in Oil Palm (Elaeis gineensis Jacq.) Response to Abiotic Stresses: Part Two - Drought. Plants, 11, n. 2786, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
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