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| Registros recuperados : 89 | |
| 41. |  | BAJAY, M. M.; ZUCCHI, M. I.; NOBREGA, M. B. de M.; KIIHL, T. A. M.; ZANOTTO, M. D.; PINHEIRO, J. B. Caracterização da diversidade do germoplasma de mamona (ricinus communis l.) utilizando marcadores microssatélites. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 4.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE OLEAGINOSAS ENERGÉTICAS, 1., 2010, João Pessoa. Inclusão social e energia: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 43. | | CIDADE, F. W.; SOUZA-CHIES, T. T. de.; BATISTA, L. A. R.; DALL´AGNOL, M.; ZUCCHI, M. I.; JUNGMANN, L.; SOUZA, A. P. Isolation and characterization of microsatellite loci in Paspalum notatum Flüggé (Poaceae). Conservation Genetics, v. 10, n.6, p.1977-1980, Dec. 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 44. | | JUNGMANN, L. J.; SOUZA, A. C. B.; PAIVA, J.; FRANCISCO, P. M.; VIGNA, B. B. Z.; VALLE, C. B. do; ZUCCHI, M. I.; SOUZA, A. P. de. Isolation and characterization of microsatellite markers for Brachiaria brizantha (Hochst. ex. A. Rich.) Stap. Conservation Genetics, v. 10, n.6, p. 1873-1876, Dec. 2009. 4 p. Technical note.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 45. | | COSTA, F. M.; SILVA, N. C. de A.; VIDAL, R.; CLEMENT, C. R.; FREITAS, F. O.; ALVES-PEREIRA, A.; PETROLI, C. D.; ZUCCHI, M. I.; VEASEY, E. A. Maize dispersal patterns associated with different types of endosperm and migration of indigenous groups in lowland South America. Annals of Botany, v. 129, p. 737-751, 2022 Na publicação: Fabio de Oliveira Freitas.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 46. | | CIDADE, F. W.; VIGNA, B. B. Z.; SOUZA, F. H. D. de; DALL´AGNOL, M.; ZUCCHI, M. I.; SOUZA-CHIES, T. T. de; SOUZA, A. P. Genetic variation in polyploid forage grass: assessing the molecular genetic variability in the Paspalum genus. BMC Genetics, v. 14, n. 50, p. 1471-2156, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 47. | | ZUCCHI, M. I.; PINHEIRO, J. B.; CHAVES. L. J.; COELHO, A. S. G.; COUTO, M. A.; MORAIS, L. K. de; VENCOVSKY, R. Genetic structure and gene flow of Eugenia dysenterica natural populations. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 40, n. 10, p. 975-980, out. 2005 Título em português: : Estrutura genética e fluxo gênico em populações naturais de cagaita.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 48. | | BRONDANI, R. P. V.; ZUCCHI, M. I.; BRONDANI, C.; RANGEL, P. H. N.; BORBA, T. C. de O.; RANGEL, P. N.; MAGALHÃES, M. R.; VENCOVSKY, R. Genetic structure of wild rice Oryza glumaepatula populations in three Brazilian biomes using microsatellite markers. Genetica, v. 125, n. 2/3, p. 115-123, Nov. 2005.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 49. | | SOUSA, A. C. B.; CARVALHO, M. A.; RAMOS, A. K. B.; CAMPOS, T.; SFORÇA, D. A.; ZUCCHI, M. I.; JANK, L.; SOUZA, A. P. Genetic studies in Centrosema pubescens benth, a tropical forage legume: the mating system, genetic variability and genetic relationships between Centrosema species. Euphytica, v. 181, p. 223-235, 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados; Embrapa Gado de Corte. |
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| 50. | | ALMEIDA, A. M. R.; SOSA-GOMEZ, D. R.; BINNECK, E.; MARIN, S. R. R.; ZUCCHI, M. I. ABDELNOOR, R. V.; SOUTO, E. R. Effect of crop rotation on specialization and genetic diversity of Macrophomina phaseolina. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 33, n. 4, p. 257-264, jul./aug. 2008.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 51. | | SOUSA, A. C. B. de; CARVALHO, M. A.; CAMPOS, T. de; SILVA, G. de T. e; ZUCCHI, M. I.; JANK, L.; SOUZA, A. P. de. Diversity and Structure Genetic of the Calopogonium mucunoides Desv. Germplasm and Assembling Core Collection. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON FORAGE BREEDING, 3., 2011, Bonito, MS. Breeding forage for climate change adaptation and mitigation - eco-efficient animal produtction: proceedings. [Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte], 2011. 1-5 1 CD-ROM| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 52. | | JUNGMANN, L.; VIGNA, B. B. Z.; PAIVA, J.; SOUSA, A. C. B.; VALLE, C. B. do; LABORDA, P. R.; ZUCCHI, M. I.; SOUZA, A. P. de. Development of microsatellite markers for Brachiaria humidicola (Rendle) Schweick. Conservation Genetics Resources, v. 1, n.1, p. 475-479, Dec. 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 53. | | SOUSA, A. C. B.; JUNGMANN, L.; CAMPOS, T. de; SFORÇA, D. A.; BOAVENTURA, L. R.; SILVA, G. M. B.; ZUCCHI, M. I.; JANK, L.; SOUZA, A. P. Development of microsatellite markers in Guineagrass (Panicum maximum Jacq.) and their transferability to other tropical forage grass species. Plant Breeding, Boon, v. 130, n. 1, p. 104-108, Feb. 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Acre; Embrapa Gado de Corte. |
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| 54. | | CIDADE, F. W.; SOUZA-CHIES, T. T.; SOUZA, F. H. D. de; VALLS, J. F. M.; DALL´AGNOL, M.; ZUCCHI, M. I.; SOUZA, A. P. Paspalum L. (Poaceae, Panicoideae, Paniceae) species identification using molecular genetic evaluation. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 56., 2011, Águas de kibdoia. Anais... Águas de Lindóia: SBG, 2011| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 55. | | SOUSA, A. C. B. de; CARVALHO, M. A.; CAMPOS, T. de; SILVA, G. de T. e; ZUCCHI, M. I.; JANK, L.; ANETE PEREIRA DE SOUZA. Outcrossing Rate in Calopogonium mucunoides Desv. Based on Microsatellite Markers. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON FORAGE BREEDING, 3., 2011, Bonito, MS. Breeding forage for climate change adaptation and mitigation - eco-efficient animal produtction: proceedings. [Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte], 2011. 6-9 1 CD-ROM| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 56. | | FERREIRA, T. G. T.; PENHA, H. A.; ZUCCHI, M. I.; SANTOS, A. A.; HANAI, L. R.; JUNQUEIRA, N. T. V.; BRAGA, M. F.; VENCOVSKY, R.; VIEIRA, L. C. Outcrossing rate in sweet passion fruit based on molecular markers. Plant Breeding, v. 129, n. 6, p. 727-730, Feb. 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 57. | | SOUSA, A. C. B.; CARVALHO, M. A.; CAMPOS, T. de; SFORÇA, D. A.; ZUCCHI, M. I.; JANK, L.; SOUZA, A. P. Molecular diversity, genetic structure and mating system of Calopogonium mucunoides Desv. Genetic Resources and Crop Evolution, v. 59, n. 7, p. 1449-1464, Oct. 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 58. | | SOUSA, A. C. B.; GODOY, R.; SFORÇA, D. A.; CAMPOS, T. de; ZUCCHI, M. I.; JANK, L.; SOUZA, A. P. de. Genetic diversity analysis among pigeonpea genotypes adapted to South American regions based on microsatellite markers. Scientia Agricola, Piracicaba, v. 68, n. 4, p. 431-439, July/Aug. 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Acre; Embrapa Gado de Corte. |
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| 59. | | BELINI, C. M. B.; ZUCCHI, M. I.; BAJAY, M. M.; MARQUES, M. O. M.; FACANALI, R.; VIEIRA, M. A. R.; FIGUEIRA, G. M.; HABER, L. L. Medical and aromatic plant collection of Baccharis dracunculifolia DC. germplasm bank. Acta Horticulturae, v. 1125, p. 229-234, 2016. Edition of Proceedings of the Symposia of the V world congress on medicinal and aromatic plants and international symposia on plants, as factories of natural substances, edible and essential oils.| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 60. | | CIDADE, F. W.; SOUZA-CHIES, T. T.; SOUZA, F. H. D. de; BATISTA, L. A. R.; DALL'AGNOL, M.; VALLS, J. F. M.; ZUCCHI, M. I.; SOUZA, A. P. Microsatellite loci for Paspalum atratum (poaceae) and cross-amplification in other species. American Journal of Botany, E1-E4, 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| Registros recuperados : 89 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Acre; Embrapa Gado de Corte. |
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Data corrente: |
05/10/2011 |
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Data da última atualização: |
06/07/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 2 |
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Autoria: |
SOUSA, A. C. B.; GODOY, R.; SFORÇA, D. A.; CAMPOS, T. de; ZUCCHI, M. I.; JANK, L.; SOUZA, A. P. de. |
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Afiliação: |
Adna Cristina Barbosa de Sousa, UNICAMP; RODOLFO GODOY, CPPSE; Danilo Augusto Sforça, UNICAMP; TATIANA DE CAMPOS, CPAF-AC; Maria Imaculada Zucchi, IAC; LIANA JANK, CNPGC; Anete Pereira de Souza, UNICAMP. |
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Título: |
Genetic diversity analysis among pigeonpea genotypes adapted to South American regions based on microsatellite markers. |
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Ano de publicação: |
2011 |
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Fonte/Imprenta: |
Scientia Agricola, Piracicaba, v. 68, n. 4, p. 431-439, July/Aug. 2011. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The pigeonpea [Cajanus cajan (L) Millspaugh] is one of the most important perennial legume crops utilized in the food, fodder, soil conservation, crop-livestock integrated systems, reclaiming of degraded pastures and symbiotic nitrogen fixation. Microsatellite markers were used to estimate the genetic diversity of 77 pigeonpea genotypes selected from the germplasm collections at Embrapa Cattle-Southeast and, to evaluate their transferability to Phaseolus vulgaris and Vigna unguiculata species. The number of alleles per locus ranged from 2 to12, with an average of 5.1 alleles. The PIC values ranged from 0.11 to 0.80 (average 0.49) and the D values from 0.23 to 0.91 (average 0.58). The averages of observed and expected heterozygosity were 0.25 and 0.47, respectively, showing a deficit in heterozygosity. A model-based Bayesian approach implemented in the software STRUCTURE was used to assign genotypes into clusters. A dendrogram was constructed based on the modified Roger's genetic distances using a neighbor-joining method (NJ). A total of four clusters were assembled by STRUCTURE and a strong tendency of correspondence between the Bayesian clusters in the NJ tree was observed. The genetic distance ranged from 0.09 to 0.62 (average 0.37), showing a low genetic diversity in the pigeonpea genotypes. Transferability of pigeonpea-specific microsatellites revealed a cross-amplification and the presence of polymorphic alleles in P. vulgaris and V. unguiculata. |
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Palavras-Chave: |
Análisis estadístico; Bayesian inference; Diversidade genética; Frijoles; Guandul; Inferência bayesiana; Marcadores genéticos; Microssatélite; Simulación por computadora; Sofware Structure; Variación genética. |
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Thesagro: |
Cajanus cajan; Feijão; Feijão de corda; Guandu; Marcador genético; Marcador molecular; Método estatístico; Modelo de simulação; Phaseolus vulgaris; Polimorfismo genético; Variação genética; Vigna unguiculata. |
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Thesaurus NAL: |
Beans; Computer simulation; Genetic markers; Genetic polymorphism; Genetic variation; Pigeon peas; Statistical analysis. |
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Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/56519/1/23954.pdf
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Marc: |
LEADER 03075naa a2200553 a 4500
001 1902585
005 2021-07-06
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100 1 $aSOUSA, A. C. B.
245 $aGenetic diversity analysis among pigeonpea genotypes adapted to South American regions based on microsatellite markers.
260 $c2011
520 $aThe pigeonpea [Cajanus cajan (L) Millspaugh] is one of the most important perennial legume crops utilized in the food, fodder, soil conservation, crop-livestock integrated systems, reclaiming of degraded pastures and symbiotic nitrogen fixation. Microsatellite markers were used to estimate the genetic diversity of 77 pigeonpea genotypes selected from the germplasm collections at Embrapa Cattle-Southeast and, to evaluate their transferability to Phaseolus vulgaris and Vigna unguiculata species. The number of alleles per locus ranged from 2 to12, with an average of 5.1 alleles. The PIC values ranged from 0.11 to 0.80 (average 0.49) and the D values from 0.23 to 0.91 (average 0.58). The averages of observed and expected heterozygosity were 0.25 and 0.47, respectively, showing a deficit in heterozygosity. A model-based Bayesian approach implemented in the software STRUCTURE was used to assign genotypes into clusters. A dendrogram was constructed based on the modified Roger's genetic distances using a neighbor-joining method (NJ). A total of four clusters were assembled by STRUCTURE and a strong tendency of correspondence between the Bayesian clusters in the NJ tree was observed. The genetic distance ranged from 0.09 to 0.62 (average 0.37), showing a low genetic diversity in the pigeonpea genotypes. Transferability of pigeonpea-specific microsatellites revealed a cross-amplification and the presence of polymorphic alleles in P. vulgaris and V. unguiculata.
650 $aBeans
650 $aComputer simulation
650 $aGenetic markers
650 $aGenetic polymorphism
650 $aGenetic variation
650 $aPigeon peas
650 $aStatistical analysis
650 $aCajanus cajan
650 $aFeijão
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650 $aMarcador genético
650 $aMarcador molecular
650 $aMétodo estatístico
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650 $aVigna unguiculata
653 $aAnálisis estadístico
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653 $aMarcadores genéticos
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700 1 $aGODOY, R.
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700 1 $aJANK, L.
700 1 $aSOUZA, A. P. de
773 $tScientia Agricola, Piracicaba$gv. 68, n. 4, p. 431-439, July/Aug. 2011.
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Registro original: |
Embrapa Acre (CPAF-AC) |
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