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| Registros recuperados : 175 | |
| 141. |  | ROCHA, M. I. P.; SOUZA, M. M. de; DINIZ, W. J. S.; LIMA, A. O. de; AFONSO, J.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. N. de; REGITANO, L. C. de A.; KOLTES, J. E.; NICIURA, S. C. M. Liver DNA methylation profile in Nelore cattle extremes for feed efficiency. In: WORKSHOP DO PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM GENÉTICA EVOLUTIVA E BIOLOGIA MOLECULAR, 1., 2019, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: UFSCAR, 2019. p.64| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 142. | | MELITO, G. R.; BELLO, H. J. S.; KAPRITCHKOFF, R. T. I.; FIORENTINO, M. I. M.; NICIURA, S. C. M.; MINHO, A. P.; ESTEVES, S. N.; CHAGAS, A. C. de S.; OKINO, C. H. Quantificação da expressão de genes de resposta imune local em ovinos de diferentes haplótipos da beta-globina. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA SÃO CARLOS, 15., 2023, São Carlos, SP. Anais [...]. São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Instrumentação, 2023. p. 24. (Embrapa Pecuária Sudeste. Eventos Técnicos & Científicos, 1)| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 143. | | BASSETTO, C. C.; ALBUQUERQUE, A. C. A.; LINS, J. G. G.; SILVA, N. M. M.; CHOCOBAR, M. L. E.; BELLO, H. J. S.; MENA, M. O.; NICIURA, S. C. M.; AMARANTE, A. F. T.; CHAGAS, A. C. de S. Revisiting anthelmintic resistance in sheep flocks from São Paulo State, Brazil. International Journal for Parasitology: Drugs and Drug Resistance, v. 24, apr. 2024, 100527. 8 p.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 144. | | VERÍSSIMO, C; NICIURA, S. C. M.; BARBOSA, C. P.; CHIEBAO, D. P.; COSTA, R. D.; CURCI, V. M.; MOLENTO, M. B.; NARDON, R.; OLIVEIRA, D. J.; PEREIRA, J. R.; RODRIGUES, C. F.; SILVA, G. S.; UENO, T. H. Resistência múltipla de nematoides gastrintestinais parasitos de ovinos a anti-helmínticos no estado de São Paulo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PARASITOLOGIA VETERINÁRIA, 16., Campo Grande. Anais... Campo Grande: CBPV, 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 145. | | CHAGAS, A. C. de S.; SANTOS, I. B. DOS; ALEMAN GAINZA, Y.; SOUZA, G. A. DE; ANHOLETO, L. A.; BARIONI JUNIOR, W.; ESTEVES, S. N.; NICIURA, S. C. M. Tratamento anti-helmíntico seletivo de ovinos pelo peso (TST) visando assegurar a eficácia dos fármacos desparasitantes e a segurança dos produtos. In: CONGRESSO NACIONAL DA CAPRINICULTURA, 1., 2021. Evento online: APEZ, 2021. p. 128-149.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 146. | | NICIURA, S. C. M.; FERREIRA, C. R.; PERECIN, F.; SARAIVA, N. Z.; TETZNER, T. A. D.; BORGES, J. C.; YAMAZAKI, W.; LEAL, C. L. V.; MEIRELLES, F. V.; GARCIA, J. M. Troca de carioplasto entre zigotos ativados com estrôncio ou 6-DMAP. Acta Scientiae Veterinariae, Porto Alegre, v. 35, Supl. 3, 2007. p. s1269. Edição de anais da 21a. Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Tecnologia de Embriões, Salvador, 2007.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 147. | | NICIURA, S. C. M.; MORAES, C. V.; CRUVINEL, G. G.; ALEMÁN GAINZA, Y.; ALBUQUERQUE, A. C. A. de; SANTANA, R. C. M.; THOLON, P.; TIZIOTO, P. C.; CHAGAS, A. C. de S.; ESTEVES, S. N.; BENAVIDES, M. V.; AMARANTE, A. F. T. do. Análise genômica da resistência ao monepantel e investigação epigenética em Haemonchus contortus. São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste, 2018. 94 p. (Embrapa Pecuária Sudeste. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 43).| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 148. | | SOUZA, M. M. de; NICIURA, S. C. M.; TIZIOTO, P. C.; IBELLI, A. M. G.; GASPARIN, G.; ROCHA, M. I. P.; DONATONI, F. A. B.; MALAGO JUNIOR, W.; DINIZ, W. J. S.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LIMA, A. O.; MUDADU, M. de A.; BARIONI JUNIOR, W.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Allele- and parent-of-origin-specific effects on expression of the KCNJ11 gene: a candidate for meat tenderness in cattle. Genetics and Molecular Research, v.15, n.3, aug. 2016. 15| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 149. | | SOUZA, M. M.; MOKRY, F. C.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; SOMAVILLA, A.; CESAR, A. S. M.; MORÉ, D.; MOURÃO, G.; DINIZ, W. J. S.; MUDADU, M. A.; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; ZERLOTINI NETO, A.; REGITANO, L. C. Allele specific expression analysis in bovine muscle tissue. In: ANNUAL INTERNACIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 23.; EUROPEAN CONFERENCE ON COMPUTATIONAL BIOLOGY, 14., 2015, Dublin. Posters... [S.l.]: International Society for Computacional Biology, [2015]. Não paginado. ISMB/ECCB 2015. Pôster D17.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 150. | | SOUZA, M. M.; MOKRY, F. C.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; SOMAVILLA, A.; CESAR, A. S. M.; MORÉ, D.; MOURÃO, G.; DINIZ, W. J. S.; MUDADU, M. A.; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; ZERLOTINI, A.; REGITANO, L. C. Allele specific expression analysis in bovine muscle tissue. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 11.; BRAZILIAN SYMPOSIUM OF BIOINFORMATICS, 2015, São Paulo. Proceedings... [S.l.]: AB3C, 2015. p. 197. X-meeting 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 151. | | SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; ROCHA, M. I. P.; BRUSCADIN, J. J.; DINIZ, W. J. da S.; CARDOSO, T. F.; CESAR, A. S. M.; AFONSO, J.; ANDRADE, B. G. N.; MUDADU, M. de A.; MOKRY, F. B.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Allele-specific expression is widespread in Bos indicus muscle and affects meat quality candidate genes. Scientific Reports, v. 10, n. 1, p. 1-11, 2020. Na publicação: Adhemar Zerlotini. Article number: 10204.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 152. | | SOUZA, M. M.; NICIURA, S. C. M.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; SIQUEIRA, F.; ROSA, A. do N.; SILVA, L. O. C. da; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; MEDEIROS, S. R. de; TULLIO, R. R.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A. Association study of a cast gene snp with meat tenderness in bos indicus cattle. Archivos Latinoamericano de Producion Animal, v. 19, (supl. 1), p. 235, 2011| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 153. | | SOUZA, M. M. de; NICIURA, S. C. M.; IBELLI, A. M. G.; MEIRELLES, S. L.; ROCHA, M. I.; TIZIOTO, P. C.; GASPARIN, G.; CARVALHO, M. E.; VENERONI, G.; OLIVEIRA, P. S. N.; SIQUEIRA, F.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Bialellic expression studies of CAST gene in bovine muscle. Journal Animal Science, v. 89, (E-Suppl. 1); Journal of Dairy Science, v. 89 (E-Suppl. 1), p.277, 2011| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 154. | | BUZANSKAS, M. E.; GROSSI, D. A.; VENTURA, R. V.; SCHENKEL, F. S.; SARGOLZAEI, M.; MEIRELLES, S. L. C. O; MOKRY, F. B.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; SILVA, M. V. G. B.; NICIURA, S. C. M.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A.; MUNARI, D. P. Genome-wide association for growth traits in Canchim beef cattle. Plos One, v. 9, n. 4, e94802 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 155. | | MOKRY, F. B.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; LIMA, A. O. de; MEIRELLES, S. L. C.; SILVA, M. V. G. B.; CARDOSO, F. F.; NICIURA, S. C. M.; OLIVEIRA, M. M. de; URBINATI, I.; TULLIO, R. R.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A. Genome-wide association study for backfat thickness in Canchim beef cattle using Random Forest approach. BMC Genetics, London, v. 14, article 47, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 156. | | MOKRY, F. B.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; LIMA, A. O. de; MEIRELLES, S. L. C.; SILVA, M. V. G. B. da; CARDOSO, F. F.; OLIVEIRA, M. M. de; URBINATI, I.; NICIURA, S. C. M.; TULLIO, R. R.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A. Genome-wide association study for backfat thickness in Canchim beef cattle using Random Forest approach. BMC Genetics, London v. 14, n. 47, 2013. 11 p.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Pecuária Sul. |
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| 157. | | SOUZA, M. M.; ZERLOTINI NETO, A.; NICIURA, S. C. M.; ROCHA, M. I. P.; DINIZ, W. J.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; LIMA, A. O.; AFONSO, J.; CESAR, A. S. M; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Genome-wide distribution of allele-specific expression in Nelore steers muscle. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 11., 2018, Auckland. Proceedings... [S.l.: s.n.], 2018. 5 p. Na publicação: A. Zerlotini, L. C. A. Regitano. WCGALP 2018.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 158. | | SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; NICIURA, S. C. M.; ROCHA, M. I. P.; DINIZ, W. J.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LIMA, A. O.; AFONSO, J.; CESAR, A. S. M; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Genome-wide distribution of allele-specific expression in Nelore steers muscle. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOOCK PRODUCTION, 2018, Auckland, New Zealand. proceedings... Auckland, New Zealand: Massey University, 2018, v. 892.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 159. | | VERÍSSIMO, C. J.; NICIURA, S. C. M.; ALBERTI, A. L.; RODRIGUES, C. F. C.; BARBOSA, C. M. P.; CHIEBAO, D. F.; CARDOSO, D.; SILVA, G. S. da; PEREIRA, J. R.; MARGATHO, L. F. F.; COSTA, R. L. D. da; NARDON, R. F.; UENO, T. E. H.; CURCI, V. L. L. M.; MOLENTO, M. B. Multidrug and multispecies resistance in sheep flocks from São Paulo state, Brazil. Veterinary Parasitology, v. 187, p. 209-216, 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 160. | | SOUZA, M. M.; ZERLOTINI NETO, A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; SOMAVILLA, A. L.; MOKRY, F. B.; CESAR, A. S. M.; DINIZ, W. J. S.; MUDADU, M. de A.; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Monoallelic expression of NNAT gene in Nelore steers skeletal muscle. In:WORLD CONGRESS OF GENETICS APPLIED TO LIVESTOK PRODUCTION, 10; . 2014, Vancouver. Proceedings... Vancouver: American Society of animal Science, 2014| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| Registros recuperados : 175 | |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agricultura Digital. Para informações adicionais entre em contato com cnptia.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
05/02/2019 |
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Data da última atualização: |
21/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
ROCHA, M. I. P.; SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LIMA, A. O. de; AFONSO, J.; DINIZ, W. J. da S.; BUSS, C. E.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.; NICIURA, S. C. M. |
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Afiliação: |
MARINA IBELLI PEREIRA ROCHA, UFSCar; MARCELA MARIA DE SOUZA, UFSCar; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; POLYANA CRISTINE TIZIOTO, Esalq/USP; PRISCILA SILVA NEUBERN DE OLIVEIRA, Bolsista CPPSE; ANDRESSA OLIVEIRA DE LIMA, UFSCar; JULIANA AFONSO, UFSCar; WELLISON JARLES DA SILVA DINIZ, UFSCar; CARLOS EDUARDO BUSS, UFSCar; LUIZ LEHMANN COUTINHO, Esalq/USP; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; SIMONE CRISTINA MEO NICIURA, CPPSE. |
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Título: |
LDHB gene has allele-specific expression in liver of Nelore cattle extremes for feed efficiency. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
In: WORKSHOP ON OMICS STRATEGIES APPLIED TO LIVESTOCK SCIENCE, 1., 2017, Piracicaba, SP. Proceedings... São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste, 2017. |
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Páginas: |
p. 25. |
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Série: |
(Embrapa Pecuária Sudeste. Documentos, 125). |
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ISSN: |
1980-6841 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Editores: Luiz Lehmann Coutinho, Luciana C. de A. Regitano, Gerson Barreto Mourão, Aline Silva Mello Cesar, Bárbara Silva Vignato, Mirele Daiana Poleti, Wellison Jarles da Silva Diniz. |
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Conteúdo: |
Feed efficiency is a multi-factorial trait of a large economic importance for cattle. Although previous studies reported gene expression differences associated with this trait the contribution of allele-specific expression (ASE) remains largely unknown. In this study, we analyzed ASE in liver samples of 30 Nelore cattle steers in two genetically divergent groups for residual feed intake (RFI) searching for genes with ASE linked to feed efficiency. Based on genotype data obtained using the Illumina BovineHD BeadChip, we computed the frequency of reads from RNA-seq data mapped to each allele of heterozygous individuals and applied a binomial test to identify loci of ASE. We detected significant differences in expression among alleles for seven SNPs (single nucleotide polymorphisms) that were tested significantly in >90% of the samples. Amid them, we selected the LDHB gene that has been previously associated with feed efficiency in chickens. The LDHB gene carries out functions in carbohydrate, carboxylic acid and oxidation-reduction metabolic processes important for glycolysis. These biological processes were associated with feed efficiency and cell energy balance in previous studies. Since the SNP found on LDHB is located at 3?UTR, we studied whether a putative microRNA binding site near or at the SNP site could
exist and account for the regulation of gene expression. We found that the Bta-miR-139 binds at the SNP site of LDHB. This miRNA was also identified by the group in a previous study with expressed microRNA in the liver. Thus, we theorized that the BtamiR-139 miRNA affects the expression of the LDHB gene and may contribute to ASE. Therefore, these results complement our understanding of the ASE profile of the LDHB gene and contribute to explain more accurately the differences in gene expression identified in Nelore steers genetically divergent for RFI. MenosFeed efficiency is a multi-factorial trait of a large economic importance for cattle. Although previous studies reported gene expression differences associated with this trait the contribution of allele-specific expression (ASE) remains largely unknown. In this study, we analyzed ASE in liver samples of 30 Nelore cattle steers in two genetically divergent groups for residual feed intake (RFI) searching for genes with ASE linked to feed efficiency. Based on genotype data obtained using the Illumina BovineHD BeadChip, we computed the frequency of reads from RNA-seq data mapped to each allele of heterozygous individuals and applied a binomial test to identify loci of ASE. We detected significant differences in expression among alleles for seven SNPs (single nucleotide polymorphisms) that were tested significantly in >90% of the samples. Amid them, we selected the LDHB gene that has been previously associated with feed efficiency in chickens. The LDHB gene carries out functions in carbohydrate, carboxylic acid and oxidation-reduction metabolic processes important for glycolysis. These biological processes were associated with feed efficiency and cell energy balance in previous studies. Since the SNP found on LDHB is located at 3?UTR, we studied whether a putative microRNA binding site near or at the SNP site could
exist and account for the regulation of gene expression. We found that the Bta-miR-139 binds at the SNP site of LDHB. This miRNA was also identified by the group in a ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Differential expression; Residual feed intake. |
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Thesagro: |
Gado de Corte. |
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Thesaurus NAL: |
cattle; microRNA. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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260 $aIn: WORKSHOP ON OMICS STRATEGIES APPLIED TO LIVESTOCK SCIENCE, 1., 2017, Piracicaba, SP. Proceedings... São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste$c2017
300 $ap. 25.
490 $a(Embrapa Pecuária Sudeste. Documentos, 125).
500 $aEditores: Luiz Lehmann Coutinho, Luciana C. de A. Regitano, Gerson Barreto Mourão, Aline Silva Mello Cesar, Bárbara Silva Vignato, Mirele Daiana Poleti, Wellison Jarles da Silva Diniz.
520 $aFeed efficiency is a multi-factorial trait of a large economic importance for cattle. Although previous studies reported gene expression differences associated with this trait the contribution of allele-specific expression (ASE) remains largely unknown. In this study, we analyzed ASE in liver samples of 30 Nelore cattle steers in two genetically divergent groups for residual feed intake (RFI) searching for genes with ASE linked to feed efficiency. Based on genotype data obtained using the Illumina BovineHD BeadChip, we computed the frequency of reads from RNA-seq data mapped to each allele of heterozygous individuals and applied a binomial test to identify loci of ASE. We detected significant differences in expression among alleles for seven SNPs (single nucleotide polymorphisms) that were tested significantly in >90% of the samples. Amid them, we selected the LDHB gene that has been previously associated with feed efficiency in chickens. The LDHB gene carries out functions in carbohydrate, carboxylic acid and oxidation-reduction metabolic processes important for glycolysis. These biological processes were associated with feed efficiency and cell energy balance in previous studies. Since the SNP found on LDHB is located at 3?UTR, we studied whether a putative microRNA binding site near or at the SNP site could exist and account for the regulation of gene expression. We found that the Bta-miR-139 binds at the SNP site of LDHB. This miRNA was also identified by the group in a previous study with expressed microRNA in the liver. Thus, we theorized that the BtamiR-139 miRNA affects the expression of the LDHB gene and may contribute to ASE. Therefore, these results complement our understanding of the ASE profile of the LDHB gene and contribute to explain more accurately the differences in gene expression identified in Nelore steers genetically divergent for RFI.
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Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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