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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
Data corrente: |
05/07/1993 |
Data da última atualização: |
12/03/2007 |
Autoria: |
FONSECA, S. M.; KAGEYAMA, P. Y. |
Título: |
Melhoramento genetico face a producao de resina. |
Ano de publicação: |
1978 |
Fonte/Imprenta: |
IPEF. Circular Tecnica, Piracicaba, n. 36, p. 1-10, 1978. |
Idioma: |
Português |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 00345naa a2200121 a 4500 001 1284501 005 2007-03-12 008 1978 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aFONSECA, S. M. 245 $aMelhoramento genetico face a producao de resina. 260 $c1978 700 1 $aKAGEYAMA, P. Y. 773 $tIPEF. Circular Tecnica, Piracicaba$gn. 36, p. 1-10, 1978.
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Unidades Centrais. |
Data corrente: |
16/02/2012 |
Data da última atualização: |
17/04/2018 |
Autoria: |
NASCIMENTO, M.; SÁFADI, T.; SILVA, F. F. e. |
Afiliação: |
Moysés Nascimento, Universidade Federal de Viçosa, Departamento de Estatística; Thelma Sáfadi, Universidade Federal de Lavras, Departamento de Ciências Exatas; Fabyano Fonseca e Silva, Universidade Federal de Viçosa, Departamento de Estatística. |
Título: |
Aplicação da análise de agrupamento de dados de expressão gênica temporal a dados em painel. |
Ano de publicação: |
2011 |
Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 11, p. 1489-1495, nov. 2011 |
Idioma: |
Português |
Notas: |
Título em inglês: Application of cluster analysis of temporal gene expression data to panel data. |
Conteúdo: |
O objetivo deste trabalho foi determinar a melhor alternativa, entre os métodos de agrupamento hierárquico (Ward) e de otimização (Tocher), para a formação de grupos homogêneos de séries de expressão gênica, e realizar previsões quanto à expressão gênica dessas séries, a partir de pequeno número de observações temporais. Os dados utilizados referem-se à expressão de genes que atuam sobre o ciclo celular de Saccharomyces cerevisiae e corresponderam a 114 séries de expressão gênica, cada uma com dez valores de "fold-change" (medida da expressão gênica) ao longo do tempo (0, 15, 30, 45, 60, 75, 90, 105, 120 e 135 min). As estimativas dos parâmetros dos modelos autorregressivos AR(p) foram previamente ajustadas a séries individuais (de cada gene) de dados "microarray time series" e utilizadas, como variáveis, no processo de agrupamento. As previsões da expressão gênica foram feitas dentro de cada grupo formado, a partir dos ajustes no modelo AR(p) para dados em painel. O método de Ward foi o mais apropriado para a formação de grupos de genes com séries homogêneas. Uma vez obtidos esses grupos, é possível ajustar o modelo AR(2) para dados em painel e predizer a expressão gênica em um tempo futuro (135 min), a partir de um pequeno número de observações temporais (os outros nove valores de "fold-change"). |
Palavras-Chave: |
Bioinformática; Método de Tocher; Método de Ward; Microarranjo; Modelo autorregressivo; Série temporal; Tocher’s method. |
Thesaurus NAL: |
bioinformatics. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/54279/1/46n11a10.pdf
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Marc: |
LEADER 02209naa a2200253 a 4500 001 1915898 005 2018-04-17 008 2011 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aNASCIMENTO, M. 245 $aAplicação da análise de agrupamento de dados de expressão gênica temporal a dados em painel. 260 $c2011 500 $aTítulo em inglês: Application of cluster analysis of temporal gene expression data to panel data. 520 $aO objetivo deste trabalho foi determinar a melhor alternativa, entre os métodos de agrupamento hierárquico (Ward) e de otimização (Tocher), para a formação de grupos homogêneos de séries de expressão gênica, e realizar previsões quanto à expressão gênica dessas séries, a partir de pequeno número de observações temporais. Os dados utilizados referem-se à expressão de genes que atuam sobre o ciclo celular de Saccharomyces cerevisiae e corresponderam a 114 séries de expressão gênica, cada uma com dez valores de "fold-change" (medida da expressão gênica) ao longo do tempo (0, 15, 30, 45, 60, 75, 90, 105, 120 e 135 min). As estimativas dos parâmetros dos modelos autorregressivos AR(p) foram previamente ajustadas a séries individuais (de cada gene) de dados "microarray time series" e utilizadas, como variáveis, no processo de agrupamento. As previsões da expressão gênica foram feitas dentro de cada grupo formado, a partir dos ajustes no modelo AR(p) para dados em painel. O método de Ward foi o mais apropriado para a formação de grupos de genes com séries homogêneas. Uma vez obtidos esses grupos, é possível ajustar o modelo AR(2) para dados em painel e predizer a expressão gênica em um tempo futuro (135 min), a partir de um pequeno número de observações temporais (os outros nove valores de "fold-change"). 650 $abioinformatics 653 $aBioinformática 653 $aMétodo de Tocher 653 $aMétodo de Ward 653 $aMicroarranjo 653 $aModelo autorregressivo 653 $aSérie temporal 653 $aTocher’s method 700 1 $aSÁFADI, T. 700 1 $aSILVA, F. F. e 773 $tPesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF$gv. 46, n. 11, p. 1489-1495, nov. 2011
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Registro original: |
Embrapa Unidades Centrais (AI-SEDE) |
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