02209naa a2200253 a 450000100080000000500110000800800410001910000190006024501020007926000090018150001040019052013670029465000190166165300200168065300220170065300200172265300170174265300270175965300200178665300220180670000160182870000190184477300920186319158982018-04-17 2011 bl uuuu u00u1 u #d1 aNASCIMENTO, M. aAplicação da análise de agrupamento de dados de expressão gênica temporal a dados em painel. c2011 aTítulo em inglês: Application of cluster analysis of temporal gene expression data to panel data. aO objetivo deste trabalho foi determinar a melhor alternativa, entre os métodos de agrupamento hierárquico (Ward) e de otimização (Tocher), para a formação de grupos homogêneos de séries de expressão gênica, e realizar previsões quanto à expressão gênica dessas séries, a partir de pequeno número de observações temporais. Os dados utilizados referem-se à expressão de genes que atuam sobre o ciclo celular de Saccharomyces cerevisiae e corresponderam a 114 séries de expressão gênica, cada uma com dez valores de "fold-change" (medida da expressão gênica) ao longo do tempo (0, 15, 30, 45, 60, 75, 90, 105, 120 e 135 min). As estimativas dos parâmetros dos modelos autorregressivos AR(p) foram previamente ajustadas a séries individuais (de cada gene) de dados "microarray time series" e utilizadas, como variáveis, no processo de agrupamento. As previsões da expressão gênica foram feitas dentro de cada grupo formado, a partir dos ajustes no modelo AR(p) para dados em painel. O método de Ward foi o mais apropriado para a formação de grupos de genes com séries homogêneas. Uma vez obtidos esses grupos, é possível ajustar o modelo AR(2) para dados em painel e predizer a expressão gênica em um tempo futuro (135 min), a partir de um pequeno número de observações temporais (os outros nove valores de "fold-change"). abioinformatics aBioinformática aMétodo de Tocher aMétodo de Ward aMicroarranjo aModelo autorregressivo aSérie temporal aTocher’s method1 aSÁFADI, T.1 aSILVA, F. F. e tPesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DFgv. 46, n. 11, p. 1489-1495, nov. 2011