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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Meio Ambiente. |
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Data corrente: |
02/04/2018 |
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Data da última atualização: |
05/04/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SILVA, L. J. da; SOUZA, D. T.; GENUÁRIO, D. B.; VARGAS-HOYOS, H. A.; SANTOS, S. N.; ROSA, L. H.; ZUCCHI, T. D.; MELO, I. S. de. |
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Afiliação: |
SILVA, L. J., ESALQ-USP; DANILO TOSTA SOUZA, ESALQ-USP; DIEGO BONALDO GENUARIO, FAPESP; HAROLD ALEXANDER VARGAS-HOYOS, ESALQ-USP; SUIKINAI NOBRE SANTOS, FAPESP; LUIZ HENRIQUE ROSA, UFMG; TIAGO DOMINGUES ZUCCHI, Agrivalle; ITAMAR SOARES DE MELO, CNPMA. |
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Título: |
Rhodococcus psychrotolerans sp. nov., isolated from rhizosphere of Deschampsia antarctica. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Antonie van Leeuwenhoek, v. 111, n. 4, p. 629-636, 2018. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s10482-017-0983-7 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
A novel actinobacterium, designated strain CMAA 1533T, was isolated from the rhizosphere of Deschampsia antarctica collected at King George Island, Antarctic Peninsula. Strain CMAA 1533T was found to grow over a wide range of temperatures (4?28 °C) and pH (4?10). Macroscopically, the colonies were observed to be circular shaped, smooth, brittle and opaque-cream on most of the culture media tested. Phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequences revealed that strain CMAA 1533T belongs to the family Nocardiaceae and forms a distinct phyletic line within the genus Rhodococcus. Sequence similarity calculations indicated that the novel strain is closely related to Rhodococcus degradans CCM 4446T, Rhodococcus erythropolis NBRC 15567T and Rhodococcus triatomae DSM 44892T (? 96.9%). The organism was found to contain meso-diaminopimelic acid, galactose and arabinose in whole cell hydrolysates. Its predominant isoprenologue was identified as MK-8(H2) and the polar lipids as diphosphatidylglycerol, phosphatidylglycerol, phosphatidylethanolamine, phosphatidylinositol and phosphatidylinositol mannosides. The major fatty acids were identified as Summed feature (C16:1 ?6c and/or C16:1 ?7c), C16:0, C18:1 ?9c and 10-methyl C18:0. The G+C content of genomic DNA was determined to be 65.5 mol%. Unlike the closely related type strains, CMAA 1533T can grow at 4 °C but not at 37 °C and was able to utilise adonitol and galactose as sole carbon sources. Based on phylogenetic, chemotaxonomic and physiological data, it is concluded that strain CMAA 1533T (= NRRL B-65465T = DSM 104532T) represents a new species of the genus Rhodococcus, for which the name Rhodococcus psychrotolerans sp. nov. is proposed. MenosA novel actinobacterium, designated strain CMAA 1533T, was isolated from the rhizosphere of Deschampsia antarctica collected at King George Island, Antarctic Peninsula. Strain CMAA 1533T was found to grow over a wide range of temperatures (4?28 °C) and pH (4?10). Macroscopically, the colonies were observed to be circular shaped, smooth, brittle and opaque-cream on most of the culture media tested. Phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequences revealed that strain CMAA 1533T belongs to the family Nocardiaceae and forms a distinct phyletic line within the genus Rhodococcus. Sequence similarity calculations indicated that the novel strain is closely related to Rhodococcus degradans CCM 4446T, Rhodococcus erythropolis NBRC 15567T and Rhodococcus triatomae DSM 44892T (? 96.9%). The organism was found to contain meso-diaminopimelic acid, galactose and arabinose in whole cell hydrolysates. Its predominant isoprenologue was identified as MK-8(H2) and the polar lipids as diphosphatidylglycerol, phosphatidylglycerol, phosphatidylethanolamine, phosphatidylinositol and phosphatidylinositol mannosides. The major fatty acids were identified as Summed feature (C16:1 ?6c and/or C16:1 ?7c), C16:0, C18:1 ?9c and 10-methyl C18:0. The G+C content of genomic DNA was determined to be 65.5 mol%. Unlike the closely related type strains, CMAA 1533T can grow at 4 °C but not at 37 °C and was able to utilise adonitol and galactose as sole carbon sources. Based on phylogenetic, chemotaxonomic a... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Antarctic actinomycetes; CMAA 1533T; Polyphasic approach. |
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Thesagro: |
Actinomiceto; Rizosfera. |
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Categoria do assunto: |
V Taxonomia de Organismos |
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Marc: |
LEADER 02548naa a2200277 a 4500
001 2090072
005 2018-04-05
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520 $aA novel actinobacterium, designated strain CMAA 1533T, was isolated from the rhizosphere of Deschampsia antarctica collected at King George Island, Antarctic Peninsula. Strain CMAA 1533T was found to grow over a wide range of temperatures (4?28 °C) and pH (4?10). Macroscopically, the colonies were observed to be circular shaped, smooth, brittle and opaque-cream on most of the culture media tested. Phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequences revealed that strain CMAA 1533T belongs to the family Nocardiaceae and forms a distinct phyletic line within the genus Rhodococcus. Sequence similarity calculations indicated that the novel strain is closely related to Rhodococcus degradans CCM 4446T, Rhodococcus erythropolis NBRC 15567T and Rhodococcus triatomae DSM 44892T (? 96.9%). The organism was found to contain meso-diaminopimelic acid, galactose and arabinose in whole cell hydrolysates. Its predominant isoprenologue was identified as MK-8(H2) and the polar lipids as diphosphatidylglycerol, phosphatidylglycerol, phosphatidylethanolamine, phosphatidylinositol and phosphatidylinositol mannosides. The major fatty acids were identified as Summed feature (C16:1 ?6c and/or C16:1 ?7c), C16:0, C18:1 ?9c and 10-methyl C18:0. The G+C content of genomic DNA was determined to be 65.5 mol%. Unlike the closely related type strains, CMAA 1533T can grow at 4 °C but not at 37 °C and was able to utilise adonitol and galactose as sole carbon sources. Based on phylogenetic, chemotaxonomic and physiological data, it is concluded that strain CMAA 1533T (= NRRL B-65465T = DSM 104532T) represents a new species of the genus Rhodococcus, for which the name Rhodococcus psychrotolerans sp. nov. is proposed.
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700 1 $aSOUZA, D. T.
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700 1 $aVARGAS-HOYOS, H. A.
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700 1 $aROSA, L. H.
700 1 $aZUCCHI, T. D.
700 1 $aMELO, I. S. de
773 $tAntonie van Leeuwenhoek$gv. 111, n. 4, p. 629-636, 2018.
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Registro original: |
Embrapa Meio Ambiente (CNPMA) |
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| Registros recuperados : 28 | |
| 3. |  | KUBOTA, T. M. K.; MILORI, D. M. B. P.; BOAS, P. R. V. Acompanhamento de árvores de citros no campo utilizando Photon-Citrus para avaliação de precocidade de diagnóstico de HLB (Greening). In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 4., 2012, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2012. p. 144. Editores técnicos: João de Mendonça Naime, Lucimara Aparecida Forato, Maria Alice Martins, Ladislau Marcelino Rabello, Rubens Bernardes Filho. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 56)| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 4. | | SPINDOLA, S. A.; KUBOTA, T. M. K.; BOAS, P. R. V.; PEREIRA, D. M. B. Mineração de dados de LIFS para classificação de doença em citros In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 8., 2016, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2016. p.29. Editores técnicos: Wilson Tadeu Lopes da Silva, José Manoel Marconcini, Maria Alice Martins, Lucimara Aparecida Forato, Paulino Ribeiro Villas Boas. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 61).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 5. | | KUBOTA, T. M. K.; MILORI, D. M. B. P.; BOAS, P. R. V.; RANULFI, A. C. Utilização do equipamento Photon-citrus para a montagem de classificadores capazes de realizar o diagnóstico de HLB (greening). In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 5., 2013, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste: Embrapa Instrumentação , 2013. p. 31 Editado por Ana Rita de Araújo Nogueira, Simone Cristina Méo Niciura. (Embrapa Pecuária Sudeste. Documentos, 110).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 6. | | KUBOTA, T. M. K.; RANULFI, A. C.; MAGALHÃES, A. B.; VILLAS-BOAS, P. R.; MILORI, D. M. B. P. Acompanhamento de árvores de citros no campo utilizando o photon-citrus para avaliação de precocidade de diagnóstico de HLB (greening). In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 6., 2014, São Carlos, SP Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2014. p. 49. Editores técnicos: João de Mendonça Naime, Caue Ribeiro, Maria Alice Martins, Elaine Cristina Paris, Paulino Ribeiro Villas Boas, Ladislau Marcelino Rabello. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 57).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 7. | | KUBOTA, T. M. K.; MILORI, D. M. B. P.; BOAS, P. R. V.; CARDINALI, M. C. do B.; FRANÇA, M. Caracterização de óptica de folhas de citros visando o diagnóstico de doenças. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 3., 2011, São Carlos. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste: Embrapa Instrumentação, 2011. p. 62. ( Embrapa Pecuária Sudeste. Documentos, 104). Editado por: Luiz Francisco Zafalon; Patricia Tholon.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 8. | | KUBOTA, T. M. K.; CARDINALI, M. C. B.; SANROS, C. H. dos; MILORI, D. M. B. P.; FERREIRA, E. J. Diagnosis of citrus greening in lemon trees using laser-induced fluorescence spectroscopy. Citrus research & technology, Cordeirópolis, v. 31, suplemento, p. 121, 2010. Proceedings of the 18 conference international organization citrus virologists, 2010, Campinas. 1CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 10. | | KUBOTA, T. M. K.; MAGALHÃES, A. B.; RANULFI, A. C.; BOAS, P. R. V.; PEREIRA, D. M. B. Estudo de imagens de fluorescência e espectroscopia de fluorescência induzida por laser (LIFS) para o diagnóstico de doença na lavoura de soja In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 8., 2016, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2016. p.30. Editores técnicos: Wilson Tadeu Lopes da Silva, José Manoel Marconcini, Maria Alice Martins, Lucimara Aparecida Forato, Paulino Ribeiro Villas Boas. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 61).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 11. | | MAGALHÃES, A. B.; KUBOTA, T. M. K.; BOAS, P. R. V.; MEYER, M. C.; MILORI, D. M. B. P. Non-destructive fluorescence spectroscopy as a phenotyping technique in soybeans. In: II Latin-American Conference on Plant Phenotyping and Phenomics for Plant Breeding, 2, 2017, São Carlos, SP. Proceedings... São Carlos: Embrapa Instrumentação, p. 54, 2017.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 12. | | KUBOTA, T. M. K.; MAGALHAES, A. B.; CRISTOFANI-YALY, M.; VILAS-BOAS, P. R.; MILORI, D. M. B. P. Potencial da espectroscopia de fluorescência induzida por laser para separar variedades de laranja geneticamente parecidas. In: SIMPÓSIO NACIONAL DE INSTRUMENTAÇÃO AGROPECUÁRIA, 2014, São Carlos, SP Anais do SIAGRO: ciência, inovação e mercado 2014. São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação, 2014. p. 49-52. Editores: Carlos Manoel Pedro Vaz, Débora Marcondes Bastos Pereira Milori, Silvio Crestana. Entrada padronizada: VILLAS-BOAS, P. R.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 13. | | CAETANO, J. B.; KUBOTA, T. M. K.; RANULFI, A. C.; MAGALHÃES, A. B.; BOAS, P. R. V.; PEREIRA, D. M. B. Avaliação da variação do perfil nutricional da soja em estresse biótico (Soja louca II) utilizando a espectroscopia LIBS In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 8., 2016, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2016. p.23. Editores técnicos: Wilson Tadeu Lopes da Silva, José Manoel Marconcini, Maria Alice Martins, Lucimara Aparecida Forato, Paulino Ribeiro Villas Boas. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 61).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 14. | | SILVA, M. N. da; BOAS, P. R. V.; MILORI, D. M. B. P.; MAGALHAES, A. B.; KUBOTA, T. M. K.; YALY, M. C. Aplicação da técnica de espectroscopia de emissão de plasma induzido por laser (LIBS) na seleção de variedades de citros. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 6., 2014, São Carlos, SP Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2014. p. 31. Editores técnicos: João de Mendonça Naime, Caue Ribeiro, Maria Alice Martins, Elaine Cristina Paris, Paulino Ribeiro Villas Boas, Ladislau Marcelino Rabello. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 57). Entrada padronizada: VILLAS-BOAS, P. R.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 15. | | CARDINALI, M. C. B.; VENÂNCIO, A. L.; KUBOTA, T. M. K.; MILORI, D. M. B. P.; FERREIRA, E. J.; MARTINS, P. K.; FREITAS-ASTÚA, J. Evaluation of early diagnosis of citrus greening using laser-induced fluorescence spectroscopy. Citrus research & technology, Cordeirópolis, v. 31, suplemento, p. 108, 2010. Proceedings of the 18 conference international organization citrus virologists, 2010, Campinas. 1CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação; Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 17. | | FRANÇA E SILVA, M.; KUBOTA, T. M. K.; CARDINALI, M. C. do B.; BOAS, P. R. V.; MILORI, D. M. B. P. Utilização de espectroscopia FTIR no estudo da doença Greening dos citros. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 3., 2011, São Carlos. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste: Embrapa Instrumentação, 2011. p. 61. ( Embrapa Pecuária Sudeste. Documentos, 104). Editado por: Luiz Francisco Zafalon; Patricia Tholon.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 18. | | RANULFI, A. C.; FERREIRA, E. J.; KUBOTA, T. M. K.; SILVA, J. T. B. da; SAUCE, R. S.; BOAS, P. R. V.; MILORI, D. M. B. P. Utilização de técnicas fotônicas no estudo e caracterização de doenças em citros. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 4., 2012, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2012. p. 120. Editores técnicos: João de Mendonça Naime, Lucimara Aparecida Forato, Maria Alice Martins, Ladislau Marcelino Rabello, Rubens Bernardes Filho. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 56)| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 19. | | MAGALHÃES, A. B.; KUBOTA, T. M. K.; SILVA, M. N. da; SEILER, R. M. B.; SANTOS, J. Z. dos; RANULFI, A. C.; NOVELLI, V. M.; BASTIANEL, M.; VILLAS-BOAS, P. R.; CRISTOFANI-YALY, M.; MILORI, D. M. B. P. Application on the laser-induced breakdown spectroscopy in identification among pear sweet citrus varieties very close genetically. In: WORKSHOP SOBRE LASER EM QUÍMICA ANALÍTICA, 2., 2015, São Carlos. Livro de resumos... São Carlos: UFSCar; Embrapa Instrumentação, 2015. p. 30.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 20. | | SILVA, J. T. B. da; MENDES, M. T. do S.; ANDRADE, F. de; KUBOTA, T. M. K.; ORTEGA, T. A.; MILORI, D. M. B. P.; BOAS, P. R. V. Acurácia do diagnóstico do HLB: análise comparativa de diferentes sistemas. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 4., 2012, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2012. p. 126. Editores técnicos: João de Mendonça Naime, Lucimara Aparecida Forato, Maria Alice Martins, Ladislau Marcelino Rabello, Rubens Bernardes Filho. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 56)| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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