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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
Data corrente: |
31/03/2022 |
Data da última atualização: |
31/03/2022 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
GOLDONI, I.; IBELLI, A. M. G.; FERNANDES, L. T.; PEIXOTO, J. de O.; HUL, L. M.; CANTAO, M. E.; GOUVEIA, J. J. de S.; LEDUR, M. C. |
Afiliação: |
IARA GOLDONI, Unicentro/Guarapuava; ADRIANA MERCIA GUARATINI IBELLI, CNPSA; LANA LANA TEIXEIRA FERNANDES; JANE DE OLIVEIRA PEIXOTO, CNPSA; LLUDMILA MUDRI HUL, Unicentro/Guarapuava; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; JOÃO JOSÉ DE SIMONI GOUVEIA, UNIVASF; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA. |
Título: |
Comprehensive analyses of bone and cartilage transcriptomes evince ion transport, inflammation and cartilage development-related genes involved in chickens femoral head separation. |
Ano de publicação: |
2022 |
Fonte/Imprenta: |
Animals, v. 12, n. 788, 2022. |
DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.indcrop.2022.114800 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Abstract: Femoral head separation (FHS) is usually a subclinical condition characterized by the detachment of articular cartilage from the bone. In this study, a comprehensive analysis identifying shared and exclusive expression profiles, biological processes (BP) and variants related to FHS in the femoral articular cartilage and growth plate in chickens was performed through RNA sequencing analysis. Thirty-six differentially expressed (DE) genes were shared between femoral articular cartilage (AC) and growth plate (GP) tissues. Out of those, 23 genes were enriched in BP related to ion transport, translation factors and immune response. Seventy genes were DE exclusively in the AC and 288 in the GP. Among the BP of AC, the response against bacteria can be highlighted, and for the GP tissue, the processes related to chondrocyte differentiation and cartilage development stand out. When the chicken DE genes were compared to other datasets, eight genes (SLC4A1, RHAG, ANK1, MKNK2, SPTB, ADA, C7 and EPB420) were shared between chickens and humans. Furthermore, 89 variants, including missense in the SPATS2L, PRKAB1 and TRIM25 genes, were identified between groups. Therefore, those genes should be more explored to validate them as candidates to FHS/FHN in chickens and humans. |
Palavras-Chave: |
Análise integrada; Expressão genetica; Inflammatory response; Integrated analysis; Necrose da cabeça femoral; Polimorfismos de nucleotídeo único; Resposta inflamatória; SNPs. |
Thesaurus Nal: |
Gene expression; Single nucleotide polymorphism. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 02411naa a2200337 a 4500 001 2141675 005 2022-03-31 008 2022 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1016/j.indcrop.2022.114800$2DOI 100 1 $aGOLDONI, I. 245 $aComprehensive analyses of bone and cartilage transcriptomes evince ion transport, inflammation and cartilage development-related genes involved in chickens femoral head separation.$h[electronic resource] 260 $c2022 520 $aAbstract: Femoral head separation (FHS) is usually a subclinical condition characterized by the detachment of articular cartilage from the bone. In this study, a comprehensive analysis identifying shared and exclusive expression profiles, biological processes (BP) and variants related to FHS in the femoral articular cartilage and growth plate in chickens was performed through RNA sequencing analysis. Thirty-six differentially expressed (DE) genes were shared between femoral articular cartilage (AC) and growth plate (GP) tissues. Out of those, 23 genes were enriched in BP related to ion transport, translation factors and immune response. Seventy genes were DE exclusively in the AC and 288 in the GP. Among the BP of AC, the response against bacteria can be highlighted, and for the GP tissue, the processes related to chondrocyte differentiation and cartilage development stand out. When the chicken DE genes were compared to other datasets, eight genes (SLC4A1, RHAG, ANK1, MKNK2, SPTB, ADA, C7 and EPB420) were shared between chickens and humans. Furthermore, 89 variants, including missense in the SPATS2L, PRKAB1 and TRIM25 genes, were identified between groups. Therefore, those genes should be more explored to validate them as candidates to FHS/FHN in chickens and humans. 650 $aGene expression 650 $aSingle nucleotide polymorphism 653 $aAnálise integrada 653 $aExpressão genetica 653 $aInflammatory response 653 $aIntegrated analysis 653 $aNecrose da cabeça femoral 653 $aPolimorfismos de nucleotídeo único 653 $aResposta inflamatória 653 $aSNPs 700 1 $aIBELLI, A. M. G. 700 1 $aFERNANDES, L. T. 700 1 $aPEIXOTO, J. de O. 700 1 $aHUL, L. M. 700 1 $aCANTAO, M. E. 700 1 $aGOUVEIA, J. J. de S. 700 1 $aLEDUR, M. C. 773 $tAnimals$gv. 12, n. 788, 2022.
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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Registro |
Volume |
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URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Uva e Vinho. |
Data corrente: |
16/11/2020 |
Data da última atualização: |
01/07/2021 |
Tipo da produção científica: |
Circular Técnica |
Autoria: |
BOTTON, M.; NONDILLO, A.; GOMES, C. B.; MELO, G. W. B. de; GARRIDO, L. da R.; ALMANÇA, M. A. K. |
Afiliação: |
MARCOS BOTTON, CNPUV; ALINE NONDILLO, Doutora em Ciências Biológicas, Professora do Instituto Federal do Rio Grande do Sul, Bento Gonçalves; CESAR BAUER GOMES, CPACT; GEORGE WELLINGTON BASTOS DE MELO, CNPUV; LUCAS DA RESSURREICAO GARRIDO, CNPUV; MARCUS ANDRÉ KURTZ ALMANÇA, engenheiro agrônomo, Doutor em Fitotecnia, Professor do Instituto Federal do Rio Grande do Sul, Bento Gonçalves, RS. |
Título: |
Fatores associados ao declínio e morte de plantas de videira identificados em áreas infestadas pela pérola-da-terra no Rio Grande do Sul. |
Ano de publicação: |
2020 |
Fonte/Imprenta: |
Bento Gonçalves: Embrapa Uva e Vinho, nov. 2020. |
Páginas: |
20 |
Série: |
(Embrapa Uva e Vinho. Circular Técnica, 153). |
ISSN: |
1808-6810 |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Historicamente, o declínio e a morte de plantas de videira foi associado somente à presença da cochonilha pérola-da-terra. Nesta publicação são apresentadas informações sobre fatores associados ao declínio e morte de plantas de videira em áreas com histórico de infestação da cochonilha em vinhedos no Rio Grande do Sul. Merece destaque a ocorrência de fungos de raízes e do tronco da videira, nematóides fitopatogênicos e os teores de concentração de cobre no solo. |
Palavras-Chave: |
Declínio; Fitopatogênicos; Fungos de raízes; Fungos de tronco; Morte de plantas; Morte de videiras; Pérola-da-terra; Videira. |
Thesagro: |
Cobre; Cochonilha; Doença de Planta; Fungo; Nematóide; Perola da Terra. |
Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/224219/1/CircTec-153-o.pdf
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Marc: |
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Embrapa Uva e Vinho (CNPUV) |
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