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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia. |
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Data corrente: |
04/05/2019 |
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Data da última atualização: |
20/04/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
PASCOAL, P. V. |
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Afiliação: |
PATRÍCIA VERDUGO PASCOAL, Universidade Federal do Tocantins. |
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Título: |
Assembly, annotation and phylogenomics of Chlamydomonas biconvexa mitogenome. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
2019. |
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Páginas: |
29 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Dissertação de mestrado apresentada ao Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia da Universidade Federal do Tocantins como parte dos requisitos para obtenção do título de mestre em Biotecnologia. (Orientador: Bruno dos S. A. Figueiredo Brasil; Coorientador: Eduardo Fernandes Formighieri) |
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Conteúdo: |
Chlamydomonas biconvexa Embrapa|LBA40 is promising strain for the production of protein-rich biomass and can be grown in sugarcane vinasse, an abundant wastewater from ethanol plants. In here, the complete mitogenome of the C. biconvexa Embrapa|LBA40 strain was sequenced and analyzed in silico for gene content and phylogenetic profile. Analysis unveiled a compacted linear mitogenome with 15,74 kb of size, containing 13 genes, 10 protein-coding genes and 3 tRNAs-coding genes. Phylogenomic comparisons confirmed C. biconvexa taxonomic status within the Reinhadtinia clade of the Chlamydomonadales. |
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Palavras-Chave: |
Mitogenome. |
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Thesaurus Nal: |
Microalgae; Phylogeny. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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500 $aDissertação de mestrado apresentada ao Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia da Universidade Federal do Tocantins como parte dos requisitos para obtenção do título de mestre em Biotecnologia. (Orientador: Bruno dos S. A. Figueiredo Brasil; Coorientador: Eduardo Fernandes Formighieri)
520 $aChlamydomonas biconvexa Embrapa|LBA40 is promising strain for the production of protein-rich biomass and can be grown in sugarcane vinasse, an abundant wastewater from ethanol plants. In here, the complete mitogenome of the C. biconvexa Embrapa|LBA40 strain was sequenced and analyzed in silico for gene content and phylogenetic profile. Analysis unveiled a compacted linear mitogenome with 15,74 kb of size, containing 13 genes, 10 protein-coding genes and 3 tRNAs-coding genes. Phylogenomic comparisons confirmed C. biconvexa taxonomic status within the Reinhadtinia clade of the Chlamydomonadales.
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653 $aMitogenome
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Registro original: |
Embrapa Agroenergia (CNPAE) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
15/07/2010 |
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Data da última atualização: |
07/02/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
B - 1 |
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Autoria: |
FERREIRA, L. G.; BUSO, G. S. C.; BRONDANI, R. P. V.; BRONDANI, C.; MELO, L. C.; DEL PELOSO, M. J.; BASSINELLO, P. Z.; SIBOV, S. T.; CARNEIRO, M. S. |
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Afiliação: |
LUCIANA GOMES FERREIRA, UFSCar; GLAUCIA SALLES CORTOPASSI BUSO, CENARGEN; ROSANA PEREIRA VIANELLO BRONDANI, CNPAF; CLAUDIO BRONDANI, CNPAF; LEONARDO CUNHA MELO, CNPAF; MARIA JOSE DEL PELOSO, CNPAF; PRISCILA ZACZUK BASSINELLO, CNPAF; SERGIO TADEU SIBOV, UFG; MONALISA SAMPAIO CARNEIRO, UFSCar. |
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Título: |
Genetic map of the common bean using a breeding population derived from the Mesoamerican gene pool. |
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Ano de publicação: |
2010 |
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Fonte/Imprenta: |
Crop Breeding and Applied Biotechnology, Londrina, v. 10, n. 1, p. 1-8, Mar. 2010. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The mapping population consisted of 94 F 2 generation plants derived from a cross between the CNFC 7812 and CNFC 8056 lines, with different protein contents, 24% and 19% respectively. Seven hundred and fifty-two molecular markers were tested among the parents and four individuals from the segregant population. A total of 101 loci were used to develop the genetic map. The polymorphism rate was 8.3% and 23.2% for the microsatellite and RAPD markers, respectively. The sizes of the linkage groups ranged from 6.7 to 139.0 cM , presenting a mean of 49.4 ± 36.8. The map length was 840.7 cM and the mean group length was 45.9 cM. The average distance between the framework loci was 16.1 cM. This map was compared with international reference bean maps and results were discussed. The construction of the genetic map from parents of the same center of origin and the commercial grain type were discussed. |
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Palavras-Chave: |
Breeding program; Mapa genético do feijoeiro; Marcadores moleculares; Mesoamerican gene pools; Microsatélite; Microsatellites; Microssatélites; Molecular markers; Phaseolus vulgaris L; Pool gênico Mesoamericano; RAPD; RAPD technique. |
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Thesagro: |
Feijão; Marcador genético; Marcador molecular; Melhoramento genético vegetal; Phaseolus vulgaris. |
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Thesaurus NAL: |
Beans; Plant breeding. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/18884/1/CBABv10.pdf
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Marc: |
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245 $aGenetic map of the common bean using a breeding population derived from the Mesoamerican gene pool.
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520 $aThe mapping population consisted of 94 F 2 generation plants derived from a cross between the CNFC 7812 and CNFC 8056 lines, with different protein contents, 24% and 19% respectively. Seven hundred and fifty-two molecular markers were tested among the parents and four individuals from the segregant population. A total of 101 loci were used to develop the genetic map. The polymorphism rate was 8.3% and 23.2% for the microsatellite and RAPD markers, respectively. The sizes of the linkage groups ranged from 6.7 to 139.0 cM , presenting a mean of 49.4 ± 36.8. The map length was 840.7 cM and the mean group length was 45.9 cM. The average distance between the framework loci was 16.1 cM. This map was compared with international reference bean maps and results were discussed. The construction of the genetic map from parents of the same center of origin and the commercial grain type were discussed.
650 $aBeans
650 $aPlant breeding
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653 $aMapa genético do feijoeiro
653 $aMarcadores moleculares
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653 $aMicrosatellites
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773 $tCrop Breeding and Applied Biotechnology, Londrina$gv. 10, n. 1, p. 1-8, Mar. 2010.
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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