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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
26/07/2022 |
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Data da última atualização: |
10/11/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CARDOSO, T. F.; BRUSCADIN, J. J.; AFONSO, J.; PETRINI, J.; ANDRADE, B. G. N.; OLIVEIRA, P. S. N. de; MALHEIROS, J. M.; ROCHA, M. I. P.; ZERLOTINI NETO, A.; FERRAZ, J. B. S.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. |
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Afiliação: |
UFSCar; ESALQ/USP; Munster Technological University; UFSCar; Federal University of Latin American Integration, Foz do Iguaçu; UFSCar; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; FZEA/USP; ESALQ/USP; ESALQ/USP; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
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Título: |
EEF1A1 transcription cofactor gene polymorphism is associated with muscle gene expression and residual feed intake in Nelore cattle. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Mammalian Genome, v. 33, n. 4, p. 619-628, Dec. 2022. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s00335-022-09959-8 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract. Cis-acting effects of noncoding variants on gene expression and regulatory molecules constitute a significant factor for phenotypic variation in complex traits. To provide new insights into the impacts of single-nucleotide polymorphisms (SNPs) on transcription factors (TFs) and transcription cofactors (TcoF) coding genes, we carried out a multi-omic analysis to identify cis-regulatory effects of SNPs on these genes? expression in muscle and describe their association with feed efficiency-related traits in Nelore cattle. As a result, we identified one SNP, the rs137256008C > T, predicted to impact the EEF1A1 gene expression (? = 3.02; P-value = 3.51E-03) and the residual feed intake trait (? = -3.47; P-value = 0.02). This SNP was predicted to modify transcription factor sites and overlaps with several QTL for feed efficiency traits. In addition, coexpression network analyses showed that animals containing the T allele of the rs137256008 SNP may be triggering changes in the gene network. Therefore, our analyses reinforce and contribute to a better understanding of the biological mechanisms underlying gene expression control of feed efficiency traits in bovines. The cis-regulatory SNP can be used as biomarker for feed efficiency in Nelore cattle. |
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Palavras-Chave: |
Cofatores de transcrição; Expressão gênica; Fatores de transcrição; Loci de característica quantitativa; Nelore cattle; Polimorfismos de nucleotídeo único. |
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Thesagro: |
Gado Nelore. |
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Thesaurus Nal: |
Gene expression; Quantitative trait loci; Single nucleotide polymorphism; Transcription (genetics); Transcription factors. |
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Categoria do assunto: |
--
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
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Tipo/Formato |
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Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 52 | |
| 14. |  | STUEPP, C. A.; BITENCOURT, J. de; WENDLING, I.; KOEHLER, H. S.; ZUFFELLATO-RIBAS, K. C. Age of stock plants, seasons and iba effect on vegetative propagation of Ilex paraguariensis. Revista Árvore, Viçosa, MG, v. 41, n. 2, e410204, Jun. 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 15. | | WENDLING, I.; STUEPP, C. A.; SANTIN, D.; ZUFFELLATO-RIBAS, K. C. Clonal forestry of Araucaria angustifolia: plants produced by grafting and cuttings can be used for wood production. Revista Árvore, Viçosa, MG, v. 41, n. 1, e410117, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 17. | | WENDLING, I.; CONSTANTINO, V.; STUEPP, C. A.; ZANETTE, F.; DOBNER JUNIOR, M. Descritores para a proteção de cultivares de araucária. Colombo: Embrapa Florestas, 2022. 25 p. (Embrapa Florestas. Comunicado técnico, 480) Selo ODS 2, 8, 10, 12, 15 e 17.| Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 18. | | LUZ, A. da; NEIVERT, D. D.; WENDLING, I.; DUARTE, M. M.; STUEPP, C. A. Desempenho inicial de clones de erva-mate em teste clonal de campo. In: SEMINÁRIO ERVA-MATE XXI, 3., 2024, Curitiba, PR. Avanços científicos, tecnológicos e de mercado: anais [...]. Colombo: Embrapa Florestas, 2025. p. 51. (Embrapa Florestas. Eventos técnicos & científicos, 4).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| Registros recuperados : 52 | |
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