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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia; Embrapa Meio-Norte. |
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Data corrente: |
11/08/2014 |
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Data da última atualização: |
25/05/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
RAPOSO, R. S.; SOUZA, I. G. B.; VELOSO, M. E. da C.; KOBAYASHI, A. K.; LAVIOLA, B. G.; DINIZ, F. M. |
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Afiliação: |
R.S. Raposo, Universidade Federal do Ceara, Núcleo de Biologia Experimental.; I.G.B. Souza, Universidade Federal do Piauí.; MARCOS EMANUEL DA COSTA VELOSO, CPAMN; ADILSON KENJI KOBAYASHI, CNPAE; BRUNO GALVEAS LAVIOLA, CNPAE; FABIO MENDONCA DINIZ, CPAMN. |
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Título: |
Development of novel simple sequence repeat markers from a genomic sequence survey database and their application for diversity assessment in Jatropha curcas germplasm from Guatemala. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 13, n. 3, p. 6099-6106, Aug. 2014. |
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DOI: |
http://dx.doi.org/10.4238/2014.August.7.25 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The last few years have seen a significant increase in the number of large-scale sequencing projects generating whole genome databases. These sequence databases can be surveyed (genome sequence survey) for tandem repeats as an alternative means to develop microsatellites for monitoring and selecting natural populations and cultivars of Jatropha curcas. A total of 100 tandem repeats were revealed from mining 368 genomic surveyed sequences available in the Kazusa DNA Research Institute database. Twenty microsatellite sequences were successfully amplified, resulting in repeatable and scorable polymerase chain reaction products. Genotyping of J. curcas accessions from the Guatemalan population revealed 18 polymorphic loci. The average number of alleles per locus was 6.9, and allelic sizes ranged from 94 to 299 bp. Expected and observed heterozygosities ranged from 0.118 to 0.906 and from 0.082 to 0.794, respectively. Polymorphic information content values ranged from 0.114 (JcSSR-34) to 0.886 (JcSSR-33) with an average of 0.627. Analysis with Micro-Checker indicated few null alleles for locus JcSSR-37 in Guatemalan populations, which may be a possible cause of its deviation from Hardy-Weinberg equilibrium, even after Bonferroni?s correction. No loci showed significant linkage disequilibrium. These microsatellite loci are expected to be valuable molecular markers in J. curcas because they show high levels of polymorphism and heterozygosity. |
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Palavras-Chave: |
Biofuel; Energy crop; Genetic diversity; Microsatellites; Microssatélite; Physic nut. |
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Thesagro: |
Biocombustível; Cultura energética; Euphorbiaceae; Pinhão de purga; Planta oleaginosa. |
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Categoria do assunto: |
--
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/bitstream/doc/1017730/1/ArtigoMarcosFabioGMR2014.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Meio-Norte (CPAMN) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agricultura Digital. Para informações adicionais entre em contato com cnptia.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
04/03/2010 |
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Data da última atualização: |
08/04/2010 |
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Tipo da produção científica: |
Software |
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Autoria: |
OLIVEIRA, L. H. M. de. |
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Afiliação: |
LEANDRO HENRIQUE M DE OLIVEIRA, CNPTIA. |
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Título: |
e-Termos: Compilação Automática de Córpus (Módulo 1). Versão 1.0. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2009. |
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Descrição Física: |
1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Desenvolvido em parceria entre a Embrapa Informática Agropecuária (CNPTIA), Universidade de São Paulo (USP Campus de São Carlos, SP) e Universidade Federal de São Carlos (UFSCar), representados pelos laboratórios de pesquisa LabInfo (Laboratório de Organização e Tratamento da Informação Eletrônica), NILC (Núcleo Interinstitucional de Lingüística Computacional) e o GETerm (Grupo de Estudos e Pesquisas em Terminológicos), localizados nas três instituições, respectivamente. o Sistema e-Termos busca propor soluções para viabilização da pesquisa e da prática terminológica, por meio da ampla utilização de um ambiente computacional colaborativo baseado na Web. O e-Termos divide a gestão terminológica em 6 Módulos de software a partir da interação colaborativa dos usuários. O Módulo 1 trata da Compilação Automática de Córpus e é responsável pela compilação automática do córpus utilizando um conjunto de palavras-chave, para a consulta e coleta de textos usando portais de busca na Internet. |
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Palavras-Chave: |
Coleta de textos; Compilação automática do córpus; Consulta de textos; E-Termos. |
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Thesagro: |
Terminologia. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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520 $aDesenvolvido em parceria entre a Embrapa Informática Agropecuária (CNPTIA), Universidade de São Paulo (USP Campus de São Carlos, SP) e Universidade Federal de São Carlos (UFSCar), representados pelos laboratórios de pesquisa LabInfo (Laboratório de Organização e Tratamento da Informação Eletrônica), NILC (Núcleo Interinstitucional de Lingüística Computacional) e o GETerm (Grupo de Estudos e Pesquisas em Terminológicos), localizados nas três instituições, respectivamente. o Sistema e-Termos busca propor soluções para viabilização da pesquisa e da prática terminológica, por meio da ampla utilização de um ambiente computacional colaborativo baseado na Web. O e-Termos divide a gestão terminológica em 6 Módulos de software a partir da interação colaborativa dos usuários. O Módulo 1 trata da Compilação Automática de Córpus e é responsável pela compilação automática do córpus utilizando um conjunto de palavras-chave, para a consulta e coleta de textos usando portais de busca na Internet.
650 $aTerminologia
653 $aColeta de textos
653 $aCompilação automática do córpus
653 $aConsulta de textos
653 $aE-Termos
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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