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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
Data corrente: |
14/01/2013 |
Data da última atualização: |
16/01/2013 |
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
Autoria: |
MARIN, S. R. R.; TODAKA, D.; MARUYAMA, K.; YAMAGUCHI SHINOZAKI, K.; NEPOMUCENO, A. L. |
Afiliação: |
SILVANA REGINA ROCKENBACH MARIN, CNPSO; JIRCAS; JIRCAS; JIRCAS; ALEXANDRE LIMA NEPOMUCENO, SRI. |
Título: |
Identificação de regiões promotoras de genes expressos durante déficit hídrico em cultivares de soja. |
Ano de publicação: |
2012 |
Fonte/Imprenta: |
Journal of Basic & Applied Genetics, Bueno Aires, v. 23, Suppl. 2012. Edição dos resumos do 15 Latin American Congress of Genetics; 41 Argentine Congress of Genetics, 45 Congress of the Chilean Society of Genetics; 2 Regional SAG-Litoral Meeting, Rosario, Oct. 2012. |
Páginas: |
p. 160-161. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Na produção de plantas geneticamente modificadas é importante a escolha do promotor, o qual regula a expressão do gene inserido. É necessário que ele seja compatível com a função do gene modulando a expressão em tecidos ou momentos específicos, pois a utilização de promotores constitutivos nem sempre acarreta em plantas agronomicamente produtivas. O objetivo desse trabalho foi a obtenção de sequências de regiões promotoras de genes que são ativados ou inibidos durante o estresse hídrico em soja. Foram avaliadas as cultivares MGBR-46, BR-16, Enrei e Willians-82, nos tempos zero (T0), cinco (T5) e oito (T8) dias de estresse hídrico e em controles não estressados. A validação do déficit hídrico sofrido pelas plantas e as diferenças na expressão entre as cultivares foi determinado por análises de qPCR e Northen Blot de tecidos foliares. Três genes alvos (LEA4, LEA3 e LEA8) e dois endógenos (18S e ?-Actina) foram avaliados por qPCR e selecionado o de melhor correlação entre alvo e endógeno. O gene selecionado LEA8 apresentou expressão de 3 a 5 vezes maior nos tratamentos de 5 e 8 dias de estresse hídrico em relação aos controles, porém não foi observada diferença significativa na expressão entre as cultivares. O Northen Blot do gene LEA8 detectou expressão somente nos tratamentos T5 e T8 para todas as cultivares. A cultivar BR-16 no tratamento T8 foi selecionada para análise de microarranjo utilizando chip Agilent G2534 no formato 4x 44K. Foram identificados 4570 genes up e 5435 down expressos. As sequencias foram categorizadas e identificados promotores em genes selecionados. MenosNa produção de plantas geneticamente modificadas é importante a escolha do promotor, o qual regula a expressão do gene inserido. É necessário que ele seja compatível com a função do gene modulando a expressão em tecidos ou momentos específicos, pois a utilização de promotores constitutivos nem sempre acarreta em plantas agronomicamente produtivas. O objetivo desse trabalho foi a obtenção de sequências de regiões promotoras de genes que são ativados ou inibidos durante o estresse hídrico em soja. Foram avaliadas as cultivares MGBR-46, BR-16, Enrei e Willians-82, nos tempos zero (T0), cinco (T5) e oito (T8) dias de estresse hídrico e em controles não estressados. A validação do déficit hídrico sofrido pelas plantas e as diferenças na expressão entre as cultivares foi determinado por análises de qPCR e Northen Blot de tecidos foliares. Três genes alvos (LEA4, LEA3 e LEA8) e dois endógenos (18S e ?-Actina) foram avaliados por qPCR e selecionado o de melhor correlação entre alvo e endógeno. O gene selecionado LEA8 apresentou expressão de 3 a 5 vezes maior nos tratamentos de 5 e 8 dias de estresse hídrico em relação aos controles, porém não foi observada diferença significativa na expressão entre as cultivares. O Northen Blot do gene LEA8 detectou expressão somente nos tratamentos T5 e T8 para todas as cultivares. A cultivar BR-16 no tratamento T8 foi selecionada para análise de microarranjo utilizando chip Agilent G2534 no formato 4x 44K. Foram identificados 4570 genes up e 5435 ... Mostrar Tudo |
Thesagro: |
Deficiência hídrica; Gene; Relação água-planta; Soja. |
Thesaurus Nal: |
Deficit irrigation; Genes; Plant-water relations; Soybeans. |
Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
Marc: |
LEADER 02646nam a2200265 a 4500 001 1945080 005 2013-01-16 008 2012 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aMARIN, S. R. R. 245 $aIdentificação de regiões promotoras de genes expressos durante déficit hídrico em cultivares de soja.$h[electronic resource] 260 $aJournal of Basic & Applied Genetics, Bueno Aires, v. 23, Suppl. 2012. Edição dos resumos do 15 Latin American Congress of Genetics; 41 Argentine Congress of Genetics, 45 Congress of the Chilean Society of Genetics; 2 Regional SAG-Litoral Meeting, Rosario, Oct. 2012.$c2012 300 $ap. 160-161. 520 $aNa produção de plantas geneticamente modificadas é importante a escolha do promotor, o qual regula a expressão do gene inserido. É necessário que ele seja compatível com a função do gene modulando a expressão em tecidos ou momentos específicos, pois a utilização de promotores constitutivos nem sempre acarreta em plantas agronomicamente produtivas. O objetivo desse trabalho foi a obtenção de sequências de regiões promotoras de genes que são ativados ou inibidos durante o estresse hídrico em soja. Foram avaliadas as cultivares MGBR-46, BR-16, Enrei e Willians-82, nos tempos zero (T0), cinco (T5) e oito (T8) dias de estresse hídrico e em controles não estressados. A validação do déficit hídrico sofrido pelas plantas e as diferenças na expressão entre as cultivares foi determinado por análises de qPCR e Northen Blot de tecidos foliares. Três genes alvos (LEA4, LEA3 e LEA8) e dois endógenos (18S e ?-Actina) foram avaliados por qPCR e selecionado o de melhor correlação entre alvo e endógeno. O gene selecionado LEA8 apresentou expressão de 3 a 5 vezes maior nos tratamentos de 5 e 8 dias de estresse hídrico em relação aos controles, porém não foi observada diferença significativa na expressão entre as cultivares. O Northen Blot do gene LEA8 detectou expressão somente nos tratamentos T5 e T8 para todas as cultivares. A cultivar BR-16 no tratamento T8 foi selecionada para análise de microarranjo utilizando chip Agilent G2534 no formato 4x 44K. Foram identificados 4570 genes up e 5435 down expressos. As sequencias foram categorizadas e identificados promotores em genes selecionados. 650 $aDeficit irrigation 650 $aGenes 650 $aPlant-water relations 650 $aSoybeans 650 $aDeficiência hídrica 650 $aGene 650 $aRelação água-planta 650 $aSoja 700 1 $aTODAKA, D. 700 1 $aMARUYAMA, K. 700 1 $aYAMAGUCHI SHINOZAKI, K. 700 1 $aNEPOMUCENO, A. L.
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
Data corrente: |
22/02/2013 |
Data da última atualização: |
07/03/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
Autoria: |
CARVALHO, J. O.; MICHALCZECHEN-LACERDA, V. A.; SARTORI, R.; RODRIGUES, F. C.; BRAVIM, O.; FRANCO, M. M.; DODE, M. A. N. |
Afiliação: |
JOSE O. CARVALHO, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO; VALQUIRIA A. MICHALCZECHEN-LACERDA, UnB; ROBERTO SARTORI, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO; FERNANDA C. RODRIGUES; OTAVIO BRAVIM, UnB; MAURICIO MACHAIM FRANCO, CENARGEN; MARGOT ALVES NUNES DODE, CENARGEN. |
Título: |
The methylation patterns of the IGF2 and IGF2R genes in bovine spermatozoa are not affected by flow-cytometric sex sorting. |
Ano de publicação: |
2012 |
Fonte/Imprenta: |
Molecular Reproduction e Development, v. 79, p. 77-84, 2012. |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The objectives of this study were to investigate the effect of sexing by flow cytometry on the methylation patterns of the IGF2 and IGF2R genes. Frozen-thawed, unsorted, and sex-sorted spermsamples fromfour Nellore bulls were used. Each ejaculate was separated into three fractions: non-sexed (NS), sexed forX-sperm(SX), and sexed for Y-sperm (SY). Sperm were isolated from the extender, cryoprotectant, and other cell types by centrifugation on a 40:70%Percoll gradient, and spermpellets were used for genomic DNA isolation. DNA was used for analyses of the methylation patterns by bisul?te sequencing.Methylation status of the IGF2 and IGF2Rgeneswere evaluated by sequencing 195 and 147 individual clones, respectively. No global differences in DNAmethylation were found between NS, SX, and SY groups for the IGF2 (P¼0.09) or IGF2R genes (P¼0.38). Very speci?c methylation patterns were observed in the 25th and 26th CpG sites in the IGF2R gene. representing higher methylation in NS than in the SX and SY groups compared with the other CpG sites. Further, individual variation in methylation patterns was found among bulls. In conclusion, the sex-sorting procedure by flow cytometry did not affect the overall DNA methylation patterns of the IGF2 and IGF2R genes, although individual variation in their methyla-tion patterns among bulls was observed. |
Palavras-Chave: |
Gene IGF2; Gene IGF2R; Sexagem por citometria. |
Thesagro: |
Bovino. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/179337/1/Carvalho-et-al-2012-Molecular-Reproduction-and-Development.pdf
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Marc: |
LEADER 02074nam a2200229 a 4500 001 1950725 005 2023-03-07 008 2012 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aCARVALHO, J. O. 245 $aThe methylation patterns of the IGF2 and IGF2R genes in bovine spermatozoa are not affected by flow-cytometric sex sorting.$h[electronic resource] 260 $aMolecular Reproduction e Development, v. 79, p. 77-84$c2012 520 $aThe objectives of this study were to investigate the effect of sexing by flow cytometry on the methylation patterns of the IGF2 and IGF2R genes. Frozen-thawed, unsorted, and sex-sorted spermsamples fromfour Nellore bulls were used. Each ejaculate was separated into three fractions: non-sexed (NS), sexed forX-sperm(SX), and sexed for Y-sperm (SY). Sperm were isolated from the extender, cryoprotectant, and other cell types by centrifugation on a 40:70%Percoll gradient, and spermpellets were used for genomic DNA isolation. DNA was used for analyses of the methylation patterns by bisul?te sequencing.Methylation status of the IGF2 and IGF2Rgeneswere evaluated by sequencing 195 and 147 individual clones, respectively. No global differences in DNAmethylation were found between NS, SX, and SY groups for the IGF2 (P¼0.09) or IGF2R genes (P¼0.38). Very speci?c methylation patterns were observed in the 25th and 26th CpG sites in the IGF2R gene. representing higher methylation in NS than in the SX and SY groups compared with the other CpG sites. Further, individual variation in methylation patterns was found among bulls. In conclusion, the sex-sorting procedure by flow cytometry did not affect the overall DNA methylation patterns of the IGF2 and IGF2R genes, although individual variation in their methyla-tion patterns among bulls was observed. 650 $aBovino 653 $aGene IGF2 653 $aGene IGF2R 653 $aSexagem por citometria 700 1 $aMICHALCZECHEN-LACERDA, V. A. 700 1 $aSARTORI, R. 700 1 $aRODRIGUES, F. C. 700 1 $aBRAVIM, O. 700 1 $aFRANCO, M. M. 700 1 $aDODE, M. A. N.
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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