| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agricultura Digital. Para informações adicionais entre em contato com cnptia.biblioteca@embrapa.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
|
Data corrente: |
26/07/2022 |
|
Data da última atualização: |
10/11/2022 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
CARDOSO, T. F.; BRUSCADIN, J. J.; AFONSO, J.; PETRINI, J.; ANDRADE, B. G. N.; OLIVEIRA, P. S. N. de; MALHEIROS, J. M.; ROCHA, M. I. P.; ZERLOTINI NETO, A.; FERRAZ, J. B. S.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. |
|
Afiliação: |
UFSCar; ESALQ/USP; Munster Technological University; UFSCar; Federal University of Latin American Integration, Foz do Iguaçu; UFSCar; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; FZEA/USP; ESALQ/USP; ESALQ/USP; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
|
Título: |
EEF1A1 transcription cofactor gene polymorphism is associated with muscle gene expression and residual feed intake in Nelore cattle. |
|
Ano de publicação: |
2022 |
|
Fonte/Imprenta: |
Mammalian Genome, v. 33, n. 4, p. 619-628, Dec. 2022. |
|
DOI: |
https://doi.org/10.1007/s00335-022-09959-8 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Abstract. Cis-acting effects of noncoding variants on gene expression and regulatory molecules constitute a significant factor for phenotypic variation in complex traits. To provide new insights into the impacts of single-nucleotide polymorphisms (SNPs) on transcription factors (TFs) and transcription cofactors (TcoF) coding genes, we carried out a multi-omic analysis to identify cis-regulatory effects of SNPs on these genes? expression in muscle and describe their association with feed efficiency-related traits in Nelore cattle. As a result, we identified one SNP, the rs137256008C > T, predicted to impact the EEF1A1 gene expression (? = 3.02; P-value = 3.51E-03) and the residual feed intake trait (? = -3.47; P-value = 0.02). This SNP was predicted to modify transcription factor sites and overlaps with several QTL for feed efficiency traits. In addition, coexpression network analyses showed that animals containing the T allele of the rs137256008 SNP may be triggering changes in the gene network. Therefore, our analyses reinforce and contribute to a better understanding of the biological mechanisms underlying gene expression control of feed efficiency traits in bovines. The cis-regulatory SNP can be used as biomarker for feed efficiency in Nelore cattle. |
|
Palavras-Chave: |
Cofatores de transcrição; Expressão gênica; Fatores de transcrição; Loci de característica quantitativa; Nelore cattle; Polimorfismos de nucleotídeo único. |
|
Thesagro: |
Gado Nelore. |
|
Thesaurus Nal: |
Gene expression; Quantitative trait loci; Single nucleotide polymorphism; Transcription (genetics); Transcription factors. |
|
Categoria do assunto: |
-- G Melhoramento Genético |
|
Marc: |
LEADER 02647naa a2200421 a 4500 001 2144939 005 2022-11-10 008 2022 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s00335-022-09959-8$2DOI 100 1 $aCARDOSO, T. F. 245 $aEEF1A1 transcription cofactor gene polymorphism is associated with muscle gene expression and residual feed intake in Nelore cattle.$h[electronic resource] 260 $c2022 520 $aAbstract. Cis-acting effects of noncoding variants on gene expression and regulatory molecules constitute a significant factor for phenotypic variation in complex traits. To provide new insights into the impacts of single-nucleotide polymorphisms (SNPs) on transcription factors (TFs) and transcription cofactors (TcoF) coding genes, we carried out a multi-omic analysis to identify cis-regulatory effects of SNPs on these genes? expression in muscle and describe their association with feed efficiency-related traits in Nelore cattle. As a result, we identified one SNP, the rs137256008C > T, predicted to impact the EEF1A1 gene expression (? = 3.02; P-value = 3.51E-03) and the residual feed intake trait (? = -3.47; P-value = 0.02). This SNP was predicted to modify transcription factor sites and overlaps with several QTL for feed efficiency traits. In addition, coexpression network analyses showed that animals containing the T allele of the rs137256008 SNP may be triggering changes in the gene network. Therefore, our analyses reinforce and contribute to a better understanding of the biological mechanisms underlying gene expression control of feed efficiency traits in bovines. The cis-regulatory SNP can be used as biomarker for feed efficiency in Nelore cattle. 650 $aGene expression 650 $aQuantitative trait loci 650 $aSingle nucleotide polymorphism 650 $aTranscription (genetics) 650 $aTranscription factors 650 $aGado Nelore 653 $aCofatores de transcrição 653 $aExpressão gênica 653 $aFatores de transcrição 653 $aLoci de característica quantitativa 653 $aNelore cattle 653 $aPolimorfismos de nucleotídeo único 700 1 $aBRUSCADIN, J. J. 700 1 $aAFONSO, J. 700 1 $aPETRINI, J. 700 1 $aANDRADE, B. G. N. 700 1 $aOLIVEIRA, P. S. N. de 700 1 $aMALHEIROS, J. M. 700 1 $aROCHA, M. I. P. 700 1 $aZERLOTINI NETO, A. 700 1 $aFERRAZ, J. B. S. 700 1 $aMOURÃO, G. B. 700 1 $aCOUTINHO, L. L. 700 1 $aREGITANO, L. C. de A. 773 $tMammalian Genome$gv. 33, n. 4, p. 619-628, Dec. 2022.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 70 | |
| 4. |  | FIGUEIREDO, J. F.; PELLEGRIN, A. O.; LEITE, K. M.; LAGE, A. P. Comparacao entre diferentes preparacoes de antigenos de Campylobacter fetus subso. venerelais para utilizacao em um teste de ELISA IgA. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE VETERIONARIA, 27.; CONGRESSO PAULISTA DE VETERINARIA, 5.; CONFERENCIA ANUAL DA SOCIEDADE PAULISTA DE MEDICINA VETERINARIA, 55.; EXPOVET, 6., 2000, Aguas de Lindoia. Resumos. Aguas de Lindoia: [s.n.], 2000. p.88.| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
|   |
| 5. |  | MIRANDA, K. L.; LAGE, A. P.; MACHADO, R. P.; FIGUEIREDO, J. F.; PELLEGRIN, A. O. Comparacao entre diferentes preparacoes de antigenos de Campylobacter fetus venerealis para utilizacao em um teste de ELISA IgA. In: SEMANA DO CONHECIMENTO DA UFMG, 1.; SEMANA DE INICIACAO CIENTIFICA, 9., 2000, Belo Horizonte. Resumos. Belo Horizonte: UFMG, 2000. p.30.| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
|   |
| 12. |  | PELEGRIN, A. O.; FIGUEIREDO, J. F.; BARBOSA, E. F.; LEITE, R. C.; LAGE, A. P. Immunoblotting para deteccao de imunoglobulina A anti-Campylobacter fetus em muco cervico-vaginal de femeas bovinas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE VETERIONARIA, 27.; CONGRESSO PAULISTA DE VETERINARIA, 5.; CONFERENCIA ANUAL DA SOCIEDADE PAULISTA DE MEDICINA VETERINARIA, 55.; EXPOVET, 6., 2000, Aguas de Lindoia. Resumos. Aguas de Lindoia: [s.n.], 2000. p.78.| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
|   |
| 17. |  | FÓSCOLO, C. B.; PELLEGRIN, A. O.; LEITE, R. C.; STYNEN, A. P. R.; LAGE, A. P. Vaccination of bulls against bovine genital campylobacteriosis: a therapeutic approach. Animal Reproduction, v. 2, n. 2, p.122-127, apr./jun., 2005.| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
|   |
| 18. |  | RODRIGUES, R. O.; HERRMANN, G. P.; HEINEMANN, M. B.; LAGE, A. P.; LOPES, L. B.; MOREIRA, E. C. Comparação entre a imunidade induzida em bovinos vacinados com bacterinas polivalentes comerciais e uma monovalente experimental. Pesquisa Veterinária Brasileira, Rio de Janeiro, v. 31, n. 1, p. 10-16, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
|    |
| 19. |  | PELLEGRIN, A. O.; LEITE, R. C.; LAGE, A. P.; FIGUEIREDO, J.; STANCIOLI, E. F. B.; SERENO, J. R. B. Ensaio imunoenzimatico e "imunoblotting" para deteccao de imunoglobulinas a anti- Campylobacter fetus em muco cervico- vaginal de femeas bovinas. In: SEMANA DA POS-GRADUACAO DA UFMG, 3., 2002, Belo Horizonte. Anais... Belo Horizonte: UFMG, 2002. nao paginado.| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
|   |
| 20. |  | REINATO, A. P. R.; FOSCOLO, C. B.; PELLEGRIN, A. O.; CANELLA FILHO, C.; FIGUEIREDO, J. F.; LAGE, A. P. Frequencia de campilobacteriose genital bovina em rebanhos leiteiros do Estado de Minas Gerais. In: ENCONTRO DE PESQUISA DA ESCOLA DE VETERINARIA, 16., 1998, Belo Horizonte. Anais... Belo Horizonte: UFMG-Escola de Veterinaria, 1998. p.87| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
|   |
| Registros recuperados : 70 | |
|
| Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|