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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
Data corrente: |
11/12/2018 |
Data da última atualização: |
05/02/2019 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; GEISTLINGER, L.; TIZIOTO, P. C.; TAYLOR, J. F.; ROCHA, M. I. P.; DINIZ, W. J. S.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. |
Afiliação: |
MARCELA M. DE SOUZA, UFSCar; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; LUDWIG GEISTLINGER, CPPSE; POLYANA C. TIZIOTO, NGS Genomic Solution; JEREMY F. TAYLOR, University of Missouri; MARINA I. P. ROCHA, UFSCar; WELLISON J. S. DINIZ, UFSCar; LUIZ L. COUTINHO, USP; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
Título: |
A comprehensive manually-curated compendium of bovine transcription factors. |
Ano de publicação: |
2018 |
Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 8, p. 1-12, 2018. |
DOI: |
10.1038/s41598-018-32146-2 |
Idioma: |
Inglês |
Notas: |
Article number: 13747. Na publicação: Adhemar Zerlotini, Luciana C. A. Regitano. |
Conteúdo: |
Transcription factors (TFs) are pivotal regulatory proteins that control gene expression in a contextdependent and tissue-specific manner. In contrast to human, where comprehensive curated TF collections exist, bovine TFs are only rudimentary recorded and characterized. In this article, we present a manually-curated compendium of 865 sequence-specific DNA-binding bovines TFs, which we analyzed for domain family distribution, evolutionary conservation, and tissue-specific expression. In addition, we provide a list of putative transcription cofactors derived from known interactions with the identified TFs. Since there is a general lack of knowledge concerning the regulation of gene expression in cattle, the curated list of TF should provide a basis for an improved comprehension of regulatory mechanisms that are specific to the species. |
Palavras-Chave: |
DNA bovine; DNA bovino; Expressão gênica; Gene expression in cattle. |
Thesaurus Nal: |
Gene expression regulation. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/189042/1/AP-Comprehensive-Adhemar-etal.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/188184/1/ComprehensiveManuallyCurated.pdf
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Marc: |
LEADER 01793naa a2200301 a 4500 001 2102174 005 2019-02-05 008 2018 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1038/s41598-018-32146-2$2DOI 100 1 $aSOUZA, M. M. de 245 $aA comprehensive manually-curated compendium of bovine transcription factors.$h[electronic resource] 260 $c2018 500 $aArticle number: 13747. Na publicação: Adhemar Zerlotini, Luciana C. A. Regitano. 520 $aTranscription factors (TFs) are pivotal regulatory proteins that control gene expression in a contextdependent and tissue-specific manner. In contrast to human, where comprehensive curated TF collections exist, bovine TFs are only rudimentary recorded and characterized. In this article, we present a manually-curated compendium of 865 sequence-specific DNA-binding bovines TFs, which we analyzed for domain family distribution, evolutionary conservation, and tissue-specific expression. In addition, we provide a list of putative transcription cofactors derived from known interactions with the identified TFs. Since there is a general lack of knowledge concerning the regulation of gene expression in cattle, the curated list of TF should provide a basis for an improved comprehension of regulatory mechanisms that are specific to the species. 650 $aGene expression regulation 653 $aDNA bovine 653 $aDNA bovino 653 $aExpressão gênica 653 $aGene expression in cattle 700 1 $aZERLOTINI NETO, A. 700 1 $aGEISTLINGER, L. 700 1 $aTIZIOTO, P. C. 700 1 $aTAYLOR, J. F. 700 1 $aROCHA, M. I. P. 700 1 $aDINIZ, W. J. S. 700 1 $aCOUTINHO, L. L. 700 1 $aREGITANO, L. C. de A. 773 $tScientific Reports$gv. 8, p. 1-12, 2018.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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9. | | DINIZ, W. J. S.; MAZZONI, G.; COUTINHO; BANERJEE, P.; GEISTLINGER, L.; CESAR, A. S. M.; BERTOLINI. F.; AFONSO, J.; OLIVEIRA, P. S. N.; TIZIOTO, P. C.; KADARMIDEEN, H. N.; REGITANO, L. C. de A. Detection of Co-expressed pathway modules associated with mineral concentration and meat quality in nelore cattle. Frontiers in genetics, v. 10, n. 210, p. 1-12, 2019.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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10. | | ROCHA, M. I. P.; SOUZA, M. M. de; DINIZ, W. J. S.; LIMA, A. O. de; AFONSO, J.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. N. de; REGITANO, L. C. de A.; KOLTES, J. E.; NICIURA, S. C. M. Liver DNA methylation profile in Nelore cattle extremes for feed efficiency. In: WORKSHOP DO PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM GENÉTICA EVOLUTIVA E BIOLOGIA MOLECULAR, 1., 2019, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: UFSCAR, 2019. p.64Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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