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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
Data corrente: |
11/12/2018 |
Data da última atualização: |
05/02/2019 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; GEISTLINGER, L.; TIZIOTO, P. C.; TAYLOR, J. F.; ROCHA, M. I. P.; DINIZ, W. J. S.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. |
Afiliação: |
MARCELA M. DE SOUZA, UFSCar; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; LUDWIG GEISTLINGER, CPPSE; POLYANA C. TIZIOTO, NGS Genomic Solution; JEREMY F. TAYLOR, University of Missouri; MARINA I. P. ROCHA, UFSCar; WELLISON J. S. DINIZ, UFSCar; LUIZ L. COUTINHO, USP; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
Título: |
A comprehensive manually-curated compendium of bovine transcription factors. |
Ano de publicação: |
2018 |
Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 8, p. 1-12, 2018. |
DOI: |
10.1038/s41598-018-32146-2 |
Idioma: |
Inglês |
Notas: |
Article number: 13747. Na publicação: Adhemar Zerlotini, Luciana C. A. Regitano. |
Conteúdo: |
Transcription factors (TFs) are pivotal regulatory proteins that control gene expression in a contextdependent and tissue-specific manner. In contrast to human, where comprehensive curated TF collections exist, bovine TFs are only rudimentary recorded and characterized. In this article, we present a manually-curated compendium of 865 sequence-specific DNA-binding bovines TFs, which we analyzed for domain family distribution, evolutionary conservation, and tissue-specific expression. In addition, we provide a list of putative transcription cofactors derived from known interactions with the identified TFs. Since there is a general lack of knowledge concerning the regulation of gene expression in cattle, the curated list of TF should provide a basis for an improved comprehension of regulatory mechanisms that are specific to the species. |
Palavras-Chave: |
DNA bovine; DNA bovino; Expressão gênica; Gene expression in cattle. |
Thesaurus Nal: |
Gene expression regulation. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/189042/1/AP-Comprehensive-Adhemar-etal.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/188184/1/ComprehensiveManuallyCurated.pdf
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Marc: |
LEADER 01793naa a2200301 a 4500 001 2102174 005 2019-02-05 008 2018 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1038/s41598-018-32146-2$2DOI 100 1 $aSOUZA, M. M. de 245 $aA comprehensive manually-curated compendium of bovine transcription factors.$h[electronic resource] 260 $c2018 500 $aArticle number: 13747. Na publicação: Adhemar Zerlotini, Luciana C. A. Regitano. 520 $aTranscription factors (TFs) are pivotal regulatory proteins that control gene expression in a contextdependent and tissue-specific manner. In contrast to human, where comprehensive curated TF collections exist, bovine TFs are only rudimentary recorded and characterized. In this article, we present a manually-curated compendium of 865 sequence-specific DNA-binding bovines TFs, which we analyzed for domain family distribution, evolutionary conservation, and tissue-specific expression. In addition, we provide a list of putative transcription cofactors derived from known interactions with the identified TFs. Since there is a general lack of knowledge concerning the regulation of gene expression in cattle, the curated list of TF should provide a basis for an improved comprehension of regulatory mechanisms that are specific to the species. 650 $aGene expression regulation 653 $aDNA bovine 653 $aDNA bovino 653 $aExpressão gênica 653 $aGene expression in cattle 700 1 $aZERLOTINI NETO, A. 700 1 $aGEISTLINGER, L. 700 1 $aTIZIOTO, P. C. 700 1 $aTAYLOR, J. F. 700 1 $aROCHA, M. I. P. 700 1 $aDINIZ, W. J. S. 700 1 $aCOUTINHO, L. L. 700 1 $aREGITANO, L. C. de A. 773 $tScientific Reports$gv. 8, p. 1-12, 2018.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Registros recuperados : 57 | |
6. | | MELO, A. L. de; SOUZA, M. M. de; REGITANO, L. C. de A. Identificação de possíveis causas de expressão alelo-específica em músculo de novilhos da raça Nelore. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA SÃO CARLOS, 10., 2018, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação; Embrapa Pecuária Sudeste, 2018. p. 43. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 68). Editores técnicos: Daniel Souza Corrêa, Elaine Cristina Paris, Maria Alice Martins, Paulino Ribeiro Villas Boas, Wilson Tadeu Lopes da Silva.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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7. | | SILVA, A. F. da; SILVA, C. da; SOUZA, M. M. de; TARDIN, F. D.; BEHLING, M.; MAY, A. Comportamento produtivo de sorgo sacarino em função do arranjo de plantas, no município de Sinop-MT. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 30.; SIMPÓSIO SOBRE LEPDÓPTEROS COMUNS A MILHO, SOJA E ALGODÃO, 1., 2014, Salvador. Eficiência nas cadeias produtivas e o abastecimento global: resumos expandidos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2014. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril; Embrapa Milho e Sorgo. |
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9. | | SILVA, C. da; SOUZA, M. M. de; FILIMBERTI, E. L.; VALE, W. G. do; SILVA, A. F. da. Períodos de interferência de plantas daninhas na cultura do sorgo sacarino In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 2.,2013, Sinop. Anais... Sinop, MT: Embrapa Agrossilvipastoril, 2013. 1 CD.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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11. | | SOUZA, M. M. de; SILVA, C. da; FILIMBERTI, E. L.; WISNIEWSKI, P. E. V.; BONALDO, S. M.; SILVA, A. F. da. Avaliação de doenças foliares em híbridos de milho, em segunda safra em SINOP- MT In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 2.,2013, Sinop. Anais... Sinop, MT: Embrapa Agrossilvipastoril, 2013. 1 CD.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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12. | | SILVA, A. F. da; GONTIJO NETO, M. M.; SOUZA, M. M. de; FILIMBERTI, E. L.; JOANELLA, G. K.; SILVA, C. da; TARDIN, F. D. Avaliação de desempenho de cultivares de milho em função da densidade de semeadura, no munícipio de Sinop-MT. In: SEMINÁRIO NACIONAL [DE] MILHO SAFRINHA, 12., 2013, Dourados. Estabilidade e produtividade: anais. Brasília, DF: Embrapa; Dourados: Embrapa Agropecuária Oeste, 2013. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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13. | | SILVA, A. F. da; GONTIJO NETO, M. M.; TARDIN, F. D.; FILIMBERTI, E. L.; SOUZA, M. M. de; JOANELLA, G. K.; CESAR DA SILVA. Avaliação de desempenho de cultivares de milho safrinha no município de Sinop-MT. In: SEMINÁRIO NACIONAL [DE] MILHO SAFRINHA, 12., 2013, Dourados. Estabilidade e produtividade: anais. Brasília, DF: Embrapa; Dourados: Embrapa Agropecuária Oeste, 2013.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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14. | | JOANELLA, G. K.; SOUZA, M. M. de; SILVA, C. da; FILIMBERTI, E. L.; SPAZIANI, C.; TARDIN, F. D.; MAY, A.; SILVA, A. F. da. Adequação de épocas de semeadura de sorgo sacarino no município de Sinop- MT. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGRONOMIA, 28., 2013, Cuiabá. Segurança alimentar e nutricional: anais. Cuiabá: CONFAEAB: AEAMT, 2013. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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15. | | SILVA, A. F. da; BEHLING, M.; SILVA, C. da; FILIMBERTI, E. L.; SOUZA, M. M. de; JOANELLA, G. K.; SILVA, A. J. M. da; GONTIJO NETO, M. M. Adequação de populações de braquiária em consórcio com milho safrinha em espaçamento reduzido In: SEMINÁRIO NACIONAL MILHO SAFRINHA, 12., 2013, Dourados. Anais... Dourados, MS: Embrapa, 2013.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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16. | | SILVA, A. F. da; BEHLING, M.; SILVA, C. da; FILIMBERTI, E. L.; SOUZA, M. M. de; JOANELLA, G. K.; SILVA, A. J. M. da; GONTIJO NETO, M. M. Adequação de populações de braquiária em consórcio com milho safrinha em espaçamento reduzido. In: SEMINÁRIO NACIONAL [DE] MILHO SAFRINHA, 12., 2013, Dourados. Estabilidade e produtividade: anais. Brasília, DF: Embrapa; Dourados: Embrapa Agropecuária Oeste, 2013. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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17. | | DINIZ, W. J. da S.; TIZIOTO, P. C.; MOKRY, F. B.; MUDADU, M. de A.; SOUZA, M. M. de; REGITANO, L. C. de A. Análise de haplótipos em QTL associado ao conteúdo de ferro no músculo de bovinos Nelore. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 6., 2014, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2014. p. 28. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 57) Editores técnicos: João de Mendonça Naime, Caue Ribeiro, Maria Alice Martins, Elaine Cristina Paris, Paulino Ribeiro Villas Boas, Ladislau Marcelino Rabello.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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18. | | WISNIEWSKI, P. E. V.; SOUZA, M. M. de; MENDOZA, M. A.; RAMOS JUNIOR, E. U.; REIS, F. L. F. dos; SPERA, S. T. Arranjos de plantas no desenvolvimento e no rendimento de grãos de soja, no município de SINOP-MT In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 2.,2013, Sinop. Anais... Sinop, MT: Embrapa Agrossilvipastoril, 2013. 1 CD.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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19. | | FILIMBERTI, E. L.; SOUZA, M. M. de; SILVA, C. da; JOANELLA, G. K.; PETTER, F. A.; TARDIN, F. D.; MAY, A.; SILVA, A. F. da. Comportamento produtivo de sorgo sacarino em função do arranjo de plantas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGRONOMIA, 28., 2013, Cuiabá. Segurança alimentar e nutricional: anais. Cuiabá: CONFAEAB: AEAMT, 2013. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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20. | | FILIMBERTI, E. L.; SOUZA, M. M. de; SILVA, C. da S.; TIESEN, C. M. A.; TARDIN, F. D.; SILVA, A. F. da. Comportamento produtivo de sorgo sacarino em função do arranjo de plantas In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 2.,2013, Sinop. Anais... Sinop, MT: Embrapa Agrossilvipastoril, 2013. 1 CD.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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