|
|
| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Soja. Para informações adicionais entre em contato com valeria.cardoso@embrapa.br. |
Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
Data corrente: |
11/01/2018 |
Data da última atualização: |
11/01/2018 |
Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
Autoria: |
RINCÃO, M. P. |
Afiliação: |
AUTOR. |
Título: |
Transcriptoma in planta de Phakopsora pachyrhizi e caracterização funcional de genes envolvidos em mecanismos basais de sobrevivência e patogenicidade. |
Ano de publicação: |
2017 |
Fonte/Imprenta: |
2017. |
Páginas: |
212 p. |
Idioma: |
Português |
Notas: |
Tese (Doutorado) - Universidade Estadual de Londrina, Londrina. Orientador: Prof. Dr. Ricardo Vilela Abdelnoor. Co-orientadora: Dra. Francismar Correa Marcelino-Guimarães. |
Conteúdo: |
O Brasil é o segundo maior produtor mundial de soja (Glycine max (L) Merrill), produto responsável por metade da produção agrícola nacional. Entretanto, a produção dessa importante oleaginosa é afetada, dentre outros fatores, pela ação do fungo Phakopsora pachyrhizi (Sydow & P. Sydow), causador da doença conhecida como ferrugem-asiática da soja (FAS). Por ser um fungo biotrófico obrigatório, o estudo de P. pachyrhizi é limitado ao seu contato com o hospedeiro durante o processo de infecção. Neste sentido, este trabalho utilizou a técnica de microdissecção a laser da lesão foliar, associada ao sequenciamento de alto desempenho, para a obtenção de sequências de transcritos do patógeno durante a interação com genótipos resistente e suscetível de soja (PI561356 e BRS 231, respectivamente). Os resultados obtidos através do sequenciamento do transcriptoma do fungo compreendem a identificação de 36.350 unisequências de P. pachyrhizi, que forneceram uma visão geral dos mecanismos moleculares e rotas biológicas ativas no patógeno aos dez dias após a infecção em soja, como metabolismo energético e de ácidos nucleicos, síntese proteica, além de processos de transcrição, biossíntese e transporte. Transcritos relacionados a processos de exocitose, sinalização de vias metabólicas, dentre outros, se apresentaram enriquecidos entre os genótipos resistente e suscetível utilizados neste trabalho em relação ao transcriptoma obtido de P. pachyrhizi. Adicionalmente, transcritos relacionados a processos de metilação, transporte de sulfato, e resposta a espécies reativas de oxigênio, entre outros, também foram enriquecidos entre diferentes estruturas e fases de infecção do fungo como esporos germinados, apressório, haustório e lesão foliar. Análises OrthoMCL comparando as unisequências geradas a partir do genoma de outras 15 espécies de fungos e oomicetos, incluindo outras espécies de ferrugens, identificaram famílias multigênicas conservadas entre as espécies analisadas, bem como famílias comuns a fungos causadores de ferrugens, e famílias encontradas exclusivamente em P. pachyrhizi, com destaque para famílias relacionadas a sinalização de vias metabólicas e transportadores de membrana. A predição de elementos de transposição ativos entre os 36.350 transcritos, identificou diferentes famílias de retrotransposons e de transposons de DNA, e análises de RTqPCR confirmaram os níveis de expressão de genes específicos observados no sequenciamento de alto desempenho. Adicionalmente, sete genes potencialmente envolvidos em processos de sobrevivência e patogenicidade de P. pachyrhizi, selecionados a partir do transcriptoma do fungo e de análises in silico, foram caracterizados funcionalmente via silenciamento gênico por RNA interferente. Mediante a utilização da tecnologia de silenciamento gênico induzido pelo hospedeiro (Host-Induced Gene Silencing - HIGS), construções utilizando 12 plasmídeos baseados no genoma do vírus do mosqueado do feijoeiro (Bean pod mottle vírus - BPMV) foram obtidas para os sete genes do fungo previamente selecionados. As construções HIGS-BPMV foram inseridas em plantas suscetíveis de soja, e posteriormente inoculadas com P. pachyrhizi. Os resultados obtidos revelaram redução significativa nos níveis de transcritos e na patogenicidade do fungo para três dos sete genes silenciados. Os resultados obtidos neste trabalho contribuem com o aumento do conhecimento sobre o transcriptoma do fungo P. pachyrhizi, demostram a existência de uma maquinaria de silenciamento ativa nesse patógeno, e, consequentemente, que o silenciamento gênico baseado na técnica de HIGS-BPMV constitui uma ferramenta viável na caracterização funcional de genes do fungo, sendo identificados pelo menos três genes que ocasionaram reduções significativas na patogenicidade quando silenciados. MenosO Brasil é o segundo maior produtor mundial de soja (Glycine max (L) Merrill), produto responsável por metade da produção agrícola nacional. Entretanto, a produção dessa importante oleaginosa é afetada, dentre outros fatores, pela ação do fungo Phakopsora pachyrhizi (Sydow & P. Sydow), causador da doença conhecida como ferrugem-asiática da soja (FAS). Por ser um fungo biotrófico obrigatório, o estudo de P. pachyrhizi é limitado ao seu contato com o hospedeiro durante o processo de infecção. Neste sentido, este trabalho utilizou a técnica de microdissecção a laser da lesão foliar, associada ao sequenciamento de alto desempenho, para a obtenção de sequências de transcritos do patógeno durante a interação com genótipos resistente e suscetível de soja (PI561356 e BRS 231, respectivamente). Os resultados obtidos através do sequenciamento do transcriptoma do fungo compreendem a identificação de 36.350 unisequências de P. pachyrhizi, que forneceram uma visão geral dos mecanismos moleculares e rotas biológicas ativas no patógeno aos dez dias após a infecção em soja, como metabolismo energético e de ácidos nucleicos, síntese proteica, além de processos de transcrição, biossíntese e transporte. Transcritos relacionados a processos de exocitose, sinalização de vias metabólicas, dentre outros, se apresentaram enriquecidos entre os genótipos resistente e suscetível utilizados neste trabalho em relação ao transcriptoma obtido de P. pachyrhizi. Adicionalmente, transcritos relacionados a pr... Mostrar Tudo |
Thesagro: |
Doença de planta; Ferrugem; Fungo; Phakopsora pachyrhizi; Soja. |
Thesaurus Nal: |
Microbial growth; Plant diseases and disorders; Soybean rust. |
Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
Marc: |
LEADER 04783nam a2200229 a 4500 001 2085100 005 2018-01-11 008 2017 bl uuuu m 00u1 u #d 100 1 $aRINCÃO, M. P. 245 $aTranscriptoma in planta de Phakopsora pachyrhizi e caracterização funcional de genes envolvidos em mecanismos basais de sobrevivência e patogenicidade.$h[electronic resource] 260 $a2017.$c2017 300 $a212 p. 500 $aTese (Doutorado) - Universidade Estadual de Londrina, Londrina. Orientador: Prof. Dr. Ricardo Vilela Abdelnoor. Co-orientadora: Dra. Francismar Correa Marcelino-Guimarães. 520 $aO Brasil é o segundo maior produtor mundial de soja (Glycine max (L) Merrill), produto responsável por metade da produção agrícola nacional. Entretanto, a produção dessa importante oleaginosa é afetada, dentre outros fatores, pela ação do fungo Phakopsora pachyrhizi (Sydow & P. Sydow), causador da doença conhecida como ferrugem-asiática da soja (FAS). Por ser um fungo biotrófico obrigatório, o estudo de P. pachyrhizi é limitado ao seu contato com o hospedeiro durante o processo de infecção. Neste sentido, este trabalho utilizou a técnica de microdissecção a laser da lesão foliar, associada ao sequenciamento de alto desempenho, para a obtenção de sequências de transcritos do patógeno durante a interação com genótipos resistente e suscetível de soja (PI561356 e BRS 231, respectivamente). Os resultados obtidos através do sequenciamento do transcriptoma do fungo compreendem a identificação de 36.350 unisequências de P. pachyrhizi, que forneceram uma visão geral dos mecanismos moleculares e rotas biológicas ativas no patógeno aos dez dias após a infecção em soja, como metabolismo energético e de ácidos nucleicos, síntese proteica, além de processos de transcrição, biossíntese e transporte. Transcritos relacionados a processos de exocitose, sinalização de vias metabólicas, dentre outros, se apresentaram enriquecidos entre os genótipos resistente e suscetível utilizados neste trabalho em relação ao transcriptoma obtido de P. pachyrhizi. Adicionalmente, transcritos relacionados a processos de metilação, transporte de sulfato, e resposta a espécies reativas de oxigênio, entre outros, também foram enriquecidos entre diferentes estruturas e fases de infecção do fungo como esporos germinados, apressório, haustório e lesão foliar. Análises OrthoMCL comparando as unisequências geradas a partir do genoma de outras 15 espécies de fungos e oomicetos, incluindo outras espécies de ferrugens, identificaram famílias multigênicas conservadas entre as espécies analisadas, bem como famílias comuns a fungos causadores de ferrugens, e famílias encontradas exclusivamente em P. pachyrhizi, com destaque para famílias relacionadas a sinalização de vias metabólicas e transportadores de membrana. A predição de elementos de transposição ativos entre os 36.350 transcritos, identificou diferentes famílias de retrotransposons e de transposons de DNA, e análises de RTqPCR confirmaram os níveis de expressão de genes específicos observados no sequenciamento de alto desempenho. Adicionalmente, sete genes potencialmente envolvidos em processos de sobrevivência e patogenicidade de P. pachyrhizi, selecionados a partir do transcriptoma do fungo e de análises in silico, foram caracterizados funcionalmente via silenciamento gênico por RNA interferente. Mediante a utilização da tecnologia de silenciamento gênico induzido pelo hospedeiro (Host-Induced Gene Silencing - HIGS), construções utilizando 12 plasmídeos baseados no genoma do vírus do mosqueado do feijoeiro (Bean pod mottle vírus - BPMV) foram obtidas para os sete genes do fungo previamente selecionados. As construções HIGS-BPMV foram inseridas em plantas suscetíveis de soja, e posteriormente inoculadas com P. pachyrhizi. Os resultados obtidos revelaram redução significativa nos níveis de transcritos e na patogenicidade do fungo para três dos sete genes silenciados. Os resultados obtidos neste trabalho contribuem com o aumento do conhecimento sobre o transcriptoma do fungo P. pachyrhizi, demostram a existência de uma maquinaria de silenciamento ativa nesse patógeno, e, consequentemente, que o silenciamento gênico baseado na técnica de HIGS-BPMV constitui uma ferramenta viável na caracterização funcional de genes do fungo, sendo identificados pelo menos três genes que ocasionaram reduções significativas na patogenicidade quando silenciados. 650 $aMicrobial growth 650 $aPlant diseases and disorders 650 $aSoybean rust 650 $aDoença de planta 650 $aFerrugem 650 $aFungo 650 $aPhakopsora pachyrhizi 650 $aSoja
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
Registros recuperados : 22 | |
2. | | RINCÃO, M. P.; MARIN, S. R. R.; MARCELINO, F. C.; ABDELNOOR, R. V. Validação de marcadores moleculares SSR para seleção assistida para doenças em soja. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 4., 2009, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2009. p. 91-96. (Embrapa Soja. Documentos, 312). Editado por Odilon Ferreira Saraiva, Paula Geron Saiz Melo.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
3. | | CRUZ, B. G.; YOKOYAMA, A.; RINCÂO, M. P.; CARVALHO, K.; KAMOGAE, M. K.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Validação de um sistema para estudo funcional de genes de Phakopsora pachyrhizi baseado em silenciamento gênico. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 10., 2015, Londrina. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2015. p. 44-52.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
4. | | CAMARGO, P. C.; CATELLI, L. L.; RINCÃO, M. P.; PIOVEZANI, A. R.; ARIAS, C. A. A.; ABDELNOOR, R. V. Mapeamento do locus de resistência à ferrugem asiática no genótipo PI 561356. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 5.; MERCOSOJA 2009, Goiânia. Anais... Londrina: Embrapa Soja, 2009. Seção trabalhos, t. 171. 1 CD-ROM. Editado por Adilson de Oliveira Júnior, Odilon Ferreira Saraiva, Clara Beatriz Hoffmann Campo, César de Castro.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
5. | | CAMOLESE, A. C.; BOTELHO, L.; PINHEIRO, M.; FRAGA, T. R.; MAIA, M. S.; RINCÃO, M. P.; ABDELNOOR, R. V. Ranqueamento de populações de soja quanto à resistência a Phakopsora pachyrhizi. JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 7., 2012, Londrina. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2012. p. 158-165. (Embrapa Soja. Documentos, 333). Editado por Paula Gerón Saiz de Mello. Disponível em: .Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
6. | | RINCÃO, M. P; CRUZ, B. G.; YOKOYAMA, A.; KUWAHARA, M. K.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Perfil transcricional de genes essenciais ao fungo phakopsora pachyrhizi causador da ferrugem asiática da soja. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 7.; MERCOSOJA, 2015, Florianópolis. Tecnologia e mercado global: perspectivas para soja: anais. Londrina: Embrapa Soja, 2015. 3 p. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
7. | | FRAGA, T. R.; MEDRI, M.; ABDELNOOR, R. V.; MEDRI, C.; RINCÃO, M. P.; COSTA, F. G.; OLIVEIRA, M. C. N. de; SILVA, D. C. G. da. Anatomia do processo infeccioso da ferrugem asiática em folhas de soja. In: ENCONTRO ANUAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 18., 2009, Londrina. Anais... Londrina: Universidade Estadual de Londrina, 2009. Ref. 4207.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
8. | | PASSIANOTTO, A. L. de L.; LOPES, V. S.; RINCÃO, M. P.; NEPOMUCENO, A. L.; BINNECK, E.; ABDELNOOR, R. V.; GONELA, A.; MARCELINO, F. C. Desenvolvimento e validação do sistema de genotipagem molecular com marcadores microssatélites de cultivares de soja via sequenciador automático. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 55., 2009, Águas de Lindóia. Charles Darwin: a origem das espécies: o livro que transformou a humanidade. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2009. p.138.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
9. | | RINCÃO, M. P.; CATELLI, L. L.; MARIN, S. R. R.; SOARES, R. M.; ARIAS, C. A. A.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; ABDELNOOR, R. V. Validação de marcadores moleculares microssatélites ligados ao gene Rps1-k de resistência à podridão radicular de fitóftora em soja. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 6., 2012, Cuiabá. Soja: integração nacional e desenvolvimento sustentável: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2012. p. 17, res. 11.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
10. | | RINCÃO, M. P.; CATELLI, L. L.; MARIN, S. R. R.; SOARES, R. M.; ARIAS, C. A. A.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; ABDELNOOR, R. V. Validação de marcadores moleculares microssatélites ligados ao gene Rps1-k de resistência à podridão radicular de fitóftora em soja. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 6., 2012, Cuiabá. Soja: integração nacional e desenvolvimento sustentável: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2012. 4 p. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
11. | | CARVALHO, K. de; RINCÃO, M. P.; DARBEN, L. M.; CARVALHO, M. C. C. G. de; LOPES, I. de O. N.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. External application of dsRNA targeting a Phakopsora pachyrhizi effector candidate attenuated fungal pathogenicity. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 25., 2017, San Diego. Abstracts... [S. l.: s. n.], 2017. não paginado. PLANT AND ANIMAL GENOME XXV CONFERENCE - INTLPAG, 2017.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
12. | | MAGALHÃES, B. R. S.; SÓSA-GOMEZ, D. R.; DIONÍSIO, J. F.; DIAS, F. C.; BALDISSERA, J. N. da C.; RINCÃO, M. P.; ROSA, R. da. Cytogenetic markers applied to cytotaxonomy in two soybean pests: Anticarsia gemmatalis (Hu¨bner, 1818) and Chrysodeixis includens (Walker, 1858). Plos one, v. 15, n. 3, e0230244, mar. 2020 9 p.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
13. | | SILVA, D. C. G.; CAMOLESE, A. C.; BOTELHO, L.; YAMANAKA, N.; PINHEIRO, M.; FRAGA, T. R.; MAIA, M. S.; RINCÃO, M. P.; NOVAES, R. M. L.; ARIAS, C. A. A.; ABDELNOOR, R. V. Avaliação de populações segregantes de soja quanto à resistência à ferrugem asiática. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 6., 2012, Cuiabá. Soja: integração nacional e desenvolvimento sustentável: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2012. p. 179, res. 312.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
14. | | SILVA, D. C. G.; CAMOLESE, A. C.; BOTELHO, L.; YAMANAKA, N.; PINHEIRO, M.; FRAGA, T. R.; MAIA, M. S.; RINCÃO, M. P.; NOVAES, R. M. L.; ARIAS, C. A. A.; ABDELNOOR, R. V. Avaliação de populações segregantes de soja quanto à resistência à ferrugem asiática. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 6., 2012, Cuiabá. Soja: integração nacional e desenvolvimento sustentável: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2012. 4 p. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
15. | | CAMOLESE, A. C.; SILVA, D. C. G.; NOVAES, R. M. L.; CRUZ, A. S.; RINCÃO, M. P.; OLIVEIRA, A. M. A.; OLIVEIRA, M. F.; ABDELNOOR, R. V.; ARIAS, C. A. A.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Validação de SNPs associados à resistência a podridão radicular de Phytophthora. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 47.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MOFO BRANCO, 2014, Londrina. Desafios futuros: anais. Londrina: SBF, 2014. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
16. | | COSTA, R. P. S.; DE CARVALHO, K.; RINCÃO, M. P.; NOMURA, R. B. G.; AVELINO, B. B.; LOPES, I. de O. N.; ABDELNOOR, R. V.; DE CARVALHO, M. C. C. G.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Validation of a system for functional gene analysis in P. pachyrhizi by ectopic application of dsRNA. In: BRAZILIAN BIOTECHNOLOGY CONGRESS, 7.; BIOTECHNOLOGY IBERO-AMERICAN CONGRESS, 2., 2018, Brasília, DF. Proceedings... Brasília, DF: SBBiotec, 2018.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
17. | | PARMEZAN, T. R.; RINCÃO, M. P.; SABINO, F. C.; BRITO JUNIOR, S. L. B.; BIRKETT, M.; PICKETT, J.; HOFFMANN-CAMPO, C. B.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Expression profile of genes involved in terpenoid biosynthesis under Phakopsora pachryrhizi infection. In: INTERNATIONAL CONGRESS OF PLANT MOLECULAR BIOLOGY, 11., 2015, Iguassu Falls. Abstract... Abstract: 620.pdf.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
18. | | CARVALHO, K.; ABE, V. Y.; DARBEN, L. M.; RINCÃO, M. P.; QI, M.; UTIYAMA, A. S.; CARVALHO, M. C. C. G.; LOPES, I. de O. N.; ABDELNOOR, R. V.; WHITHAM, S. A.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Host induced gene silencing in P. pachyrhizi effectors interfere in virulence of soybean attenuating fungal pathogenicity In: IS-MPMI Congress, 18., 2019, Glasgow. [Abstracts...]. [S. l.: s. n.], 2019.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
19. | | BARROS, V. de A.; FONTESA, P. P.; SOUZA, G. B. de; GONÇALVES, A. B.; CARVALHO, K. de; RINCÃO, M. P.; LOPES, I. de O. N.; COSTA, M. D. L.; ALVES, M. S.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; FIETTO, L. G. Phakopsora pachyrhizi triggers the jasmonate signaling pathway during compatible interaction in soybean and GmbZIP89 plays a role of major component in the pathway. Plant physiology and biochemistry, v. 151, p. 526-534, 2020.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
20. | | CATELLI, L. L.; ARIAS, C. A. A.; DI MAURO, A. O.; CAMARGO, P. O.; MARIN, S. R. R.; POLIZEL, A. M.; SOUZA, L. G.; LEMOS, N. G.; RINCÃO, M. P.; YAMANAKA, N.; ABDELNOOR, R. V. Parámetros genéticos de resistencia asociados a la roya asiática de la soja (Phakopsora pachyrzi). In: CONGRESO LATINOAMERICANO DE GENETICA, 13; CONGRESO DE GENETICA, 6, 2008, Lima. Resumos...Lima: Hozlo S.R.L., 2008.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
Registros recuperados : 22 | |
|
Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|