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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia; Embrapa Meio-Norte. |
Data corrente: |
11/08/2014 |
Data da última atualização: |
25/05/2022 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
RAPOSO, R. S.; SOUZA, I. G. B.; VELOSO, M. E. da C.; KOBAYASHI, A. K.; LAVIOLA, B. G.; DINIZ, F. M. |
Afiliação: |
R.S. Raposo, Universidade Federal do Ceara, Núcleo de Biologia Experimental.; I.G.B. Souza, Universidade Federal do Piauí.; MARCOS EMANUEL DA COSTA VELOSO, CPAMN; ADILSON KENJI KOBAYASHI, CNPAE; BRUNO GALVEAS LAVIOLA, CNPAE; FABIO MENDONCA DINIZ, CPAMN. |
Título: |
Development of novel simple sequence repeat markers from a genomic sequence survey database and their application for diversity assessment in Jatropha curcas germplasm from Guatemala. |
Ano de publicação: |
2014 |
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 13, n. 3, p. 6099-6106, Aug. 2014. |
DOI: |
http://dx.doi.org/10.4238/2014.August.7.25 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The last few years have seen a significant increase in the number of large-scale sequencing projects generating whole genome databases. These sequence databases can be surveyed (genome sequence survey) for tandem repeats as an alternative means to develop microsatellites for monitoring and selecting natural populations and cultivars of Jatropha curcas. A total of 100 tandem repeats were revealed from mining 368 genomic surveyed sequences available in the Kazusa DNA Research Institute database. Twenty microsatellite sequences were successfully amplified, resulting in repeatable and scorable polymerase chain reaction products. Genotyping of J. curcas accessions from the Guatemalan population revealed 18 polymorphic loci. The average number of alleles per locus was 6.9, and allelic sizes ranged from 94 to 299 bp. Expected and observed heterozygosities ranged from 0.118 to 0.906 and from 0.082 to 0.794, respectively. Polymorphic information content values ranged from 0.114 (JcSSR-34) to 0.886 (JcSSR-33) with an average of 0.627. Analysis with Micro-Checker indicated few null alleles for locus JcSSR-37 in Guatemalan populations, which may be a possible cause of its deviation from Hardy-Weinberg equilibrium, even after Bonferroni?s correction. No loci showed significant linkage disequilibrium. These microsatellite loci are expected to be valuable molecular markers in J. curcas because they show high levels of polymorphism and heterozygosity. |
Palavras-Chave: |
Biofuel; Energy crop; Genetic diversity; Microsatellites; Microssatélite; Physic nut. |
Thesagro: |
Biocombustível; Cultura energética; Euphorbiaceae; Pinhão de purga; Planta oleaginosa. |
Categoria do assunto: |
-- G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/125432/1/ArtigoMarcosFabioGMR2014.pdf
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Marc: |
LEADER 02543naa a2200325 a 4500 001 2017730 005 2022-05-25 008 2014 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttp://dx.doi.org/10.4238/2014.August.7.25$2DOI 100 1 $aRAPOSO, R. S. 245 $aDevelopment of novel simple sequence repeat markers from a genomic sequence survey database and their application for diversity assessment in Jatropha curcas germplasm from Guatemala.$h[electronic resource] 260 $c2014 520 $aThe last few years have seen a significant increase in the number of large-scale sequencing projects generating whole genome databases. These sequence databases can be surveyed (genome sequence survey) for tandem repeats as an alternative means to develop microsatellites for monitoring and selecting natural populations and cultivars of Jatropha curcas. A total of 100 tandem repeats were revealed from mining 368 genomic surveyed sequences available in the Kazusa DNA Research Institute database. Twenty microsatellite sequences were successfully amplified, resulting in repeatable and scorable polymerase chain reaction products. Genotyping of J. curcas accessions from the Guatemalan population revealed 18 polymorphic loci. The average number of alleles per locus was 6.9, and allelic sizes ranged from 94 to 299 bp. Expected and observed heterozygosities ranged from 0.118 to 0.906 and from 0.082 to 0.794, respectively. Polymorphic information content values ranged from 0.114 (JcSSR-34) to 0.886 (JcSSR-33) with an average of 0.627. Analysis with Micro-Checker indicated few null alleles for locus JcSSR-37 in Guatemalan populations, which may be a possible cause of its deviation from Hardy-Weinberg equilibrium, even after Bonferroni?s correction. No loci showed significant linkage disequilibrium. These microsatellite loci are expected to be valuable molecular markers in J. curcas because they show high levels of polymorphism and heterozygosity. 650 $aBiocombustível 650 $aCultura energética 650 $aEuphorbiaceae 650 $aPinhão de purga 650 $aPlanta oleaginosa 653 $aBiofuel 653 $aEnergy crop 653 $aGenetic diversity 653 $aMicrosatellites 653 $aMicrossatélite 653 $aPhysic nut 700 1 $aSOUZA, I. G. B. 700 1 $aVELOSO, M. E. da C. 700 1 $aKOBAYASHI, A. K. 700 1 $aLAVIOLA, B. G. 700 1 $aDINIZ, F. M. 773 $tGenetics and Molecular Research, Ribeirão Preto$gv. 13, n. 3, p. 6099-6106, Aug. 2014.
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Registro original: |
Embrapa Meio-Norte (CPAMN) |
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Registros recuperados : 39 | |
2. | | LIMA, G. P. G. DE; ROCHA-BEZERRA, L. C. B. DA; MACEDO, L. L. P. DE; BEMQUERER, M. P.; SA, M. F. G. de; CARVALHO, A. F. U. Purification, partial characterization and in vitro biological activity against pest insects of a novel trypsin inhibitor from Sapindus saponaria seeds. The FEBS Journal, v. 279, p. 81, 2012. Supplement 1. Edições do resumo do Congresso: 22nd IUBMB Congress, 37th FEBS Congress, 2012, Seville, Spain. Proceedings of the 22nd IUBMB Congress/37th FEBS Congress. USA: WILEY-BLACKWELL, 2012.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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3. | | FREITAS, E. O.; PAIXÃO, J. F. R.; MACEDO, L. L. P. de; LOURENCO, I. T.; GARCIA, R. A.; FERREIRA, M. A.; SA, M. F. G. de. Novos promotores de genes induzíveis pelo ataque do inseto-praga bicudo-doalgodoeiro em tecido floral de algodão. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 27.; CONGRESSO LATINO-AMERICANO DE ENTOMOLOGIA, 10., Gramado. Saúde, ambiente e agricultura: anais. Gramado: SEB, 2018. Na publicação: Maria F. Grossi-de-Sá.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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5. | | MACEDO, C. L. de; MARTINS, E. S.; MACEDO, L. L. P. de; SANTOS, A. C. dos; PRAÇA, L. B.; GÓIS, L. A. B. de; MONNERAT, R. G. Seleção e caracterização de estirpes de Bacillus thuringiensis eficientes contra a Diatraea saccharalis (Lepidoptera: Crambidae). Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 47, n. 12, p. 1759-1765, dez. 2012. Título em inglês: Selection and characterization of Bacillus thuringiensis efficient strains against Diatraea saccharalis (Lepidoptera: Crambidae).Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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6. | | ARTICO, S.; RIBEIRO ALVES, M.; OLIVEIRA NETO, O. B.; MACEDO, L. L. P. de; SILVEIRA, S.; GROSI-DE-SA, M. F.; MARTINELLI, A. P.; ALVES FERREIRA, M. Transcriptome analysis of Gossypium hirsutum flower buds infested by cotton boll weevil (Anthonomus grandis) larvae. BMC Genomics, 15:854, 2014. (Open Access).Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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7. | | VASQUEZ, D. D. N.; RIBEIRO, T. P.; MACEDO, L. L. P. de; LOURENCO, I. T.; PAES-DE-MELO, B.; BASSO, M. F.; MIRANDA, J. E.; SILVA, M. C. M. da; SA, M. F. G. de. Algodão GM para o controle do bicudo do algodoeiro mediante silenciamento multiplo de genes. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 8, 2023, Florianópolis, SC. Anais...Florianópolis: SBG, 2023. p. 44 Na publicação: Leonardo Lima Pepino Macedo; Isabela Tristan Lourenço-Tessutti; Jose Miranda.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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8. | | RIBEIRO, T. P.; RUFFO, G. C.; MACEDO, L. L. P. de; LOURENCO, I. T.; SOUZA, J. P. A.; OLIVEIRA NETO, O. B.; SILVA, M. C. M. da; SA, M. F. G. de. Algodão transgênico expressando duas novas tóxinas cry confere alta resistência ao bicudo do algodoeiro. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 8, 2023, Florianópolis, SC. Anais...Florianópolis: SBG, 2023. p. 66 Na publicação: Leonardo Lima Pepino Macedo.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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9. | | NEGRISOLI JUNIOR, A. S.; BALDANI, J. I.; SA, M. F. G. de; SILVA, M. C. M. da; MACEDO, L. L. P. de; FONSECA, F. C. de A.; NEGRISOLI, C. R. de C. B.; GUZZO, E. C. Manejo da broca-gigante da cana-de-açúcar (Telchinlicus) (Drury) (Lepidoptera: Castniidae) no nordeste do Brasil. Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2015. 52 p. (Embrapa Tabuleiros Costeiros. Documentos, 198).Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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10. | | HABIB, P.; SOCCOL, C. R.; O'KEEFE, B. R.; KRUMPE, L. R. H.; WILSON, J.; MACEDO, L. L. P. de; FAHEEM, M.; SANTOS, V. O. dos; PRADO, G. S.; BOTELHO, M. A.; LACOMBE, S.; SA, M. F. G. de. Gene-silencing suppressors for high-level production of the HIV-1 entry inhibitor griffithsin in Nicotiana benthamiana. Process Biochemistry, v. 70, p. 45-54, 2018. Na publicação: Maria Fatima Grossi-de-Sa.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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11. | | MOURA, H. F. N.; COELHO, R. R.; GARCIA, R. A.; MOREIRA-PINTO, C. E.; REDJIMI, I. M. N.; MACEDO, L. L. P. de; ANTONINO-DE-SOUZA, J. D.; SA, M. F. G. de. Desafios e perspectivas para o silenciamento gênico em Helicoverpa armigera (Lepidoptera: Noctuidae). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 27.; CONGRESSO LATINO-AMERICANO DE ENTOMOLOGIA, 10., Gramado. Saúde, ambiente e agricultura: anais. Gramado: SEB, 2018. p. 915 Na publicação: Leonardo L. P. Macedo, Maria F. Grossi-de-Sá.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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12. | | BASSO, M. F.; LOURENCO-TESSUTTI, I. T.; MENDES, R. A. G.; PINTO, C. E. M.; BOURNAUD, C.; GILLET, F.-X.; TOGAWA, R. C.; MACEDO, L. L. P. de; ENGLER, J. d A.; GROSSI-DE-SA, M. F. MiDaf16-like and MiSkn1-like gene families are reliable targets to develop biotechnological tools for the control and management of Meloidogyne incognita. Scientific Reports, v. 10, n. 1, p. 1-13, 2020.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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13. | | LUCENA, W. A.; PELEGRINI, P. B.; MARTINS-DE-SA, D.; FONSECA, F. C. A.; GOMES JÚNIOR, J. E.; MACEDO, L. L. P. de; SILVA, M. C. M. da; OLIVEIRA, R. D.; GROSSI DE SA, M. F. Molecular approaches to improve the insecticidal activity of Bacillus thuringiensis cry toxins. Toxins, v. 6, p. 2393-2423, 2014.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
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14. | | MACEDO, C. L. de; MARTINS, E. S.; MACEDO, L. L. P. de; SANTOS, A. C. dos; PRACA, L. B.; GÓIS, L. A. B. de; PONTES, R. G. M. S. de. Seleção e caracterização de estirpes de Bacillus thuringiensis eficientes contra a Diatraea saccharalis (Lepidoptera: Crambidae). Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 47, n. 12, p. 1759-1765, 2012.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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15. | | SILVA, P. L. R.; MACEDO, L. L. P. de; SÁ, M. E. L. de; AMORIM. R. M. S. de; MORGANTE, C. V.; TESSUTTI, I. T. L.; BASSO, M. F.; GALBIERI, R.; SÁ, M. F. G. de. Transgenic cotton applied to phytonematode control using in plant RNA interfering strategy. In: BRAZILIAN BIOTECHNOLOGY CONGRESS, 7.; BIOTECHNOLOGY IBERO-AMERICAN CONGRESS, 2., 2018, Brasília, DF. Proceedings... Brasília, DF: SBBiotec, 2018.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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16. | | NORIEGA, D. D.; ARRAES, F. B. M.; ANTONINO, J. D.; MACEDO, L. L. P. de; FONSECA, F. C. A.; TOGAWA, R. C.; GRYNBERG, P.; SILVA, M. C. M. da; NEGRISOLI JUNIOR, A. S.; SA, M. F. G. de. Transcriptome Analysis and Knockdown of the Juvenile Hormone Esterase Gene Reveal Abnormal Feeding Behavior in the Sugarcane Giant Borer. Frontiers in Physiology, v. 11, 588450, jul. 2020.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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17. | | RIBEIRO, T. P.; MARTINS-DE-SA, D.; MACEDO, L. L. P. de; LOURENCO, I. T.; RUFFO, G. C.; SOUSA, J. P. A.; SANTANA, J. M. do R.; OLIVEIRA-NETO, O. B.; MOURA, S. M.; SILVA, M. C. M. da; MORGANTE, C. V.; OLIVEIRA, N. G. de; BASSO, M. F.; SA, M. F. G. de. Cotton plants overexpressing the Bacillus thuringiensis Cry23Aa and Cry37Aa binary-like toxins exhibit high resistance to the cotton boll weevil (Anthonomus grandis). Plant Science, v. 344, 112079, 2024. Na publicação: Leonardo Lima Pepino Macedo; Isabela Tristan Lourenço-Tessutti; Maria Cristina Mattar Silva; Maria Fatima Grossi-de-Sa.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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18. | | RIBEIRO, T. P.; LOURENCO, I. T.; MELO, B. P. de; MORGANTE, C. V.; SALLES FILHO, A.; LINS, C. B. J.; FERREIRA, G. F.; MELLO, G. N.; MACEDO, L. L. P. de; LUCENA, W. A.; SILVA, M. C. M. da; OLIVEIRA‑NETO, O. B.; SA, M. F. G. de. Improved cotton transformation protocol mediated by Agrobacterium and biolistic combined-methods. Planta, v. 254, 20, 2021.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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19. | | MOREIRA-PINTO, C. E.; COELHO, R. R.; LEITE, A. G. B.; SILVEIRA, D. A.; SOUZA, D. A.; LOPES, R. B.; MACEDO, L. L. P. de; SILVA, M. C. M. da; RIBEIRO, T. P.; MORGANTE, C. V.; ANTONINO, J. D.; SA, M. F. G. de. Increasing Anthonomus grandis susceptibility to Metarhizium anisopliae through RNAi-induced AgraRelish knockdown: a perspective to combine biocontrol and biotechnology. Pest Management Science, v. 77, n. 9, p. 4054-4063, 2021. Na publicação: Leonardo L P Macedo; Maria C M Silva; Maria F Grossi-de-Sa.,Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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20. | | SOUZA JÚNIOR, J. D. A. de; COELHO, R. R.; LOURENÇO, I. T.; FRAGOSO, R. da R.; VIANA, A. A. B.; MACEDO, L. L. P. de; SILVA, M. C. M. da; CARNEIRO, R. M. D. G.; ENGLER, G.; ALMEIDA-ENGLER, J. de; GROSSI DE SÁ, M. F. Knocking-down Meloidogyne incognita proteases by plant-delivered dsRNA has negative pleiotropic effect on nematode vigor. Plos One, v. 8, n. 12, e85364, 2013.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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