|
|
Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
Data corrente: |
14/04/2015 |
Data da última atualização: |
30/01/2024 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
DORNELES, E. M. S.; SANTANA, J. A.; RIBEIRO, D.; DORELLA, F. A.; GUIMARAES, A. S.; MOAWAD, M. S.; SELIM, S. A.; GARALDI, A. L. M.; MIYOSHI, A.; RIBEIRO, M. G.; GOUVEIA, A. M. G.; AZEVEDO, V.; HEINEMANN, M. B.; LAGE, A. P. |
Afiliação: |
ELAINE M. S. DORNELES, UFMG; JORDANA A. SANTANA, UFMG; DAYANA RIBEIRO, UFMG; FERNANDA ALVES DORELLA, UFMG; ALESSANDRO DE SA GUIMARAES, CNPGL; MOHAMED S. MOAWAD, Cairo University, Cairo, Egypt; SALAH A. SELIM, Cairo University, Cairo, Egypt; ANA LUIZA M. GARALDI, UNERJ; ANDERSON MIYOSHI, UFMG; MARCIO G. RIBEIRO, UNESP; AURORA M. G. GOUVEIA, UFMG; VASCO AZEVEDO, UFMG; MARCOS B. HEINEMANN, UFMG; ANDREY P. LAGE, UFMG. |
Título: |
Evaluation of ERIC-PCR as Genotyping Method for Corynebacterium pseudotuberculosis Isolates. |
Ano de publicação: |
2014 |
Fonte/Imprenta: |
Plos One, v. 9, n. 6, e98758, 2014. |
DOI: |
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0098758 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The aim of this study was to evaluate the Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus (ERIC-PCR) as a tool for molecular typing of C. pseudotuberculosis isolates from eight different hosts in twelve countries. Ninety-nine C. pseudotuberculosis field strains, one type strain (ATCC 19410T ) and one vaccine strain (1002) were fingerprinted using the ERIC-1R and ERIC-2 primers, and the ERIC-1R+ERIC-2 primer pair. Twenty-nine different genotypes were generated by ERIC 1-PCR, 28 by ERIC 2-PCR and 35 by ERIC 1+2-PCR. The discriminatory index calculated for ERIC 1, ERIC 2, and ERIC 1+2-PCR was 0.89, 0.86, and 0.92, respectively. Epidemiological concordance was established for all ERIC-PCR assays. ERIC 1+2-PCR was defined as the best method based on suitability of the amplification patterns and discriminatory index. Minimal spanning tree for ERIC 1+2-PCR revealed three major clonal complexes and clustering around nitrate-positive (biovar Equi) and nitrate-negative (biovar Ovis) strains. Therefore, ERIC 1+2-PCR proved to be the best technique evaluated in this study for genotyping C. pseudotuberculosis strains, due to its usefulness for molecular epidemiology investigations. |
Palavras-Chave: |
Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus (ERIC-PCR). |
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/122336/1/Cnpgl-2014-PlosOne-Evaluation.pdf
|
Marc: |
LEADER 02105naa a2200301 a 4500 001 2013504 005 2024-01-30 008 2014 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1371/journal.pone.0098758$2DOI 100 1 $aDORNELES, E. M. S. 245 $aEvaluation of ERIC-PCR as Genotyping Method for Corynebacterium pseudotuberculosis Isolates.$h[electronic resource] 260 $c2014 520 $aThe aim of this study was to evaluate the Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus (ERIC-PCR) as a tool for molecular typing of C. pseudotuberculosis isolates from eight different hosts in twelve countries. Ninety-nine C. pseudotuberculosis field strains, one type strain (ATCC 19410T ) and one vaccine strain (1002) were fingerprinted using the ERIC-1R and ERIC-2 primers, and the ERIC-1R+ERIC-2 primer pair. Twenty-nine different genotypes were generated by ERIC 1-PCR, 28 by ERIC 2-PCR and 35 by ERIC 1+2-PCR. The discriminatory index calculated for ERIC 1, ERIC 2, and ERIC 1+2-PCR was 0.89, 0.86, and 0.92, respectively. Epidemiological concordance was established for all ERIC-PCR assays. ERIC 1+2-PCR was defined as the best method based on suitability of the amplification patterns and discriminatory index. Minimal spanning tree for ERIC 1+2-PCR revealed three major clonal complexes and clustering around nitrate-positive (biovar Equi) and nitrate-negative (biovar Ovis) strains. Therefore, ERIC 1+2-PCR proved to be the best technique evaluated in this study for genotyping C. pseudotuberculosis strains, due to its usefulness for molecular epidemiology investigations. 653 $aEnterobacterial Repetitive Intergenic Consensus (ERIC-PCR) 700 1 $aSANTANA, J. A. 700 1 $aRIBEIRO, D. 700 1 $aDORELLA, F. A. 700 1 $aGUIMARAES, A. S. 700 1 $aMOAWAD, M. S. 700 1 $aSELIM, S. A. 700 1 $aGARALDI, A. L. M. 700 1 $aMIYOSHI, A. 700 1 $aRIBEIRO, M. G. 700 1 $aGOUVEIA, A. M. G. 700 1 $aAZEVEDO, V. 700 1 $aHEINEMANN, M. B. 700 1 $aLAGE, A. P. 773 $tPlos One$gv. 9, n. 6, e98758, 2014.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Acre. Para informações adicionais entre em contato com cpafac.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Acre; Embrapa Amazônia Oriental. |
Data corrente: |
06/10/2020 |
Data da última atualização: |
11/03/2024 |
Tipo da produção científica: |
Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Autoria: |
PRIMAVESI, A. C.; ANDRADE, A. G. de; ALVES, B. J. R.; ROSSO, C. R. S. de; BATISTA, E. M.; PRATES, H. T.; ORTIZ, F. R.; MELLO, J.; FERRAZ, M. R.; LINHARES, N. W.; MACHADO, P. L. O. de A.; MOELLER, R.; ALVES, R. de C. S.; SILVA, W. M. |
Afiliação: |
ANA CANDIDA PACHECO DE A PRIMAVESI, CPPSE; ALUISIO GRANATO DE ANDRADE, CNPS; BRUNO JOSE RODRIGUES ALVES, CNPAB; CESAR ROBERTO SILVA DE ROSSO, CNPMA; EDYR MARINHO BATISTA, CPAF-AC; HELIO TEIXEIRA PRATES, CNPMS; FABIO ROGERIO ORTIZ, CNPSO; JOMAR CHANDOHA DE MELLO, CNPSO; MARCOS ROBERTO FERRAZ, Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos/USP; NIRCEU WERNECK LINHARES, CPAC; PEDRO LUIZ OLIVEIRA DE A MACHADO, CNPS; MARIA REGINA FREIRE MOLLER, CPATU; RITA DE CÁSSIA SOUZA ALVES, CPAF-RR; WILLIAM MARRA SILVA, CPAO. |
Título: |
Métodos de análise de solo. |
Ano de publicação: |
2005 |
Fonte/Imprenta: |
In: NOGUEIRA, A. R. de A.; SOUZA, G. B. de (ed.). Manual de laboratórios: solo, água, nutrição vegetal, nutrição animal e alimentos. São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste, 2005. |
Páginas: |
p. 63-123. |
Idioma: |
Português |
Thesagro: |
Análise do Solo; Solo. |
Categoria do assunto: |
W Química e Física |
Marc: |
LEADER 00942naa a2200301 a 4500 001 2141749 005 2024-03-11 008 2005 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aPRIMAVESI, A. C. 245 $aMétodos de análise de solo.$h[electronic resource] 260 $c2005 300 $ap. 63-123. 650 $aAnálise do Solo 650 $aSolo 700 1 $aANDRADE, A. G. de 700 1 $aALVES, B. J. R. 700 1 $aROSSO, C. R. S. de 700 1 $aBATISTA, E. M. 700 1 $aPRATES, H. T. 700 1 $aORTIZ, F. R. 700 1 $aMELLO, J. 700 1 $aFERRAZ, M. R. 700 1 $aLINHARES, N. W. 700 1 $aMACHADO, P. L. O. de A. 700 1 $aMOELLER, R. 700 1 $aALVES, R. de C. S. 700 1 $aSILVA, W. M. 773 $tIn: NOGUEIRA, A. R. de A.; SOUZA, G. B. de (ed.). Manual de laboratórios: solo, água, nutrição vegetal, nutrição animal e alimentos. São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste, 2005.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Acre (CPAF-AC) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|