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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
07/01/2010 |
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Data da última atualização: |
15/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
HIGA, R. H.; TOZZI, C. L. |
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Afiliação: |
ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; CLÉSIO LUIS TOZZI, FEEC/UNICAMP. |
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Título: |
Prediction of binding hot spot residues by using structural and evolutionary parameters. |
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Ano de publicação: |
2008 |
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Fonte/Imprenta: |
In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 4., 2008, Salvador. Proceedings... Salvador: AB³C, 2008. |
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Páginas: |
Não paginado. |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
X-meeting 2008. |
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Conteúdo: |
In this work, we present a method for predicting hot spot residues by using a set of structural and evolutionary parameters. Unlike previous studies, we use a set of parameters which do not depend on the structure of the protein in complex, so that the predictor can also be used when the interface region is unknown. Despite the fact that no information concerning proteins in complex is used for prediction, the application of the method to a compiled dataset described in the literature achieved a performance of 60.4 percent, as measured by F-Measure, corresponding to a recall of 78.1 percent and a precision of 49.5 percent. This result is higher than those reported by previous studies using the same data set. |
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Palavras-Chave: |
Estrutura proteica; Hot spot residues; Hot spots; Hot spots prediction; Interações proteína-proteína. |
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Thesaurus Nal: |
Protein structure. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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520 $aIn this work, we present a method for predicting hot spot residues by using a set of structural and evolutionary parameters. Unlike previous studies, we use a set of parameters which do not depend on the structure of the protein in complex, so that the predictor can also be used when the interface region is unknown. Despite the fact that no information concerning proteins in complex is used for prediction, the application of the method to a compiled dataset described in the literature achieved a performance of 60.4 percent, as measured by F-Measure, corresponding to a recall of 78.1 percent and a precision of 49.5 percent. This result is higher than those reported by previous studies using the same data set.
650 $aProtein structure
653 $aEstrutura proteica
653 $aHot spot residues
653 $aHot spots
653 $aHot spots prediction
653 $aInterações proteína-proteína
700 1 $aTOZZI, C. L.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agroindústria Tropical. |
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Data corrente: |
13/04/2010 |
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Data da última atualização: |
13/06/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
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Autoria: |
RUFINO, M. do S. M.; ALVES, R. E.; BRITO, E. S. de; MORAIS, S. M. de; SAMPAIO, C. de G.; PÉREZ-JIMÉNEZ, J.; SAURA-CALIXTO, F. D. |
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Título: |
Metodologia científica: determinação da atividade antioxidante total em frutas pelo método de redução do ferro (FRAP) |
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Ano de publicação: |
2006 |
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Fonte/Imprenta: |
Fortaleza: Embrapa Agroindústria Tropical, 2006. |
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Páginas: |
4 p. |
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Série: |
(Embrapa Agroindústria Tropical. Comunicado técnico, 125). |
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Idioma: |
Português |
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Palavras-Chave: |
(FRAP); Antioxidantes; Frutas. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/CNPAT-2010/11964/1/cot-125.pdf
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Marc: |
LEADER 00738nam a2200229 a 4500
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700 1 $aPÉREZ-JIMÉNEZ, J.
700 1 $aSAURA-CALIXTO, F. D.
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Registro original: |
Embrapa Agroindústria Tropical (CNPAT) |
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Biblioteca |
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Tipo/Formato |
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Cutter |
Registro |
Volume |
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