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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
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Data corrente: |
26/01/2004 |
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Data da última atualização: |
29/04/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BRONDANI, R. P. V.; BRONDANI, C.; GRATTAPAGLIA, D. |
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Afiliação: |
CLAUDIO BRONDANI, CNPAF. |
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Título: |
Towards a genus-wide reference linkage map for Eucalyptus based exclusively on highly informative microsatellite markers. |
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Ano de publicação: |
2002 |
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Fonte/Imprenta: |
Molecular Genetic Genomics, v. 267, n. 3, p. 338-347, May 2002. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s00438-002-0665-6 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
A novel set of 50 highly polymorphic microsatellite markers were developed and mapped on existing RAPD framework maps of Eucalyptus grandis and E. urophylla. Together with the twenty previously developed microsatellite markers, these were used to align the existing maps for the two most commercially important Eucalyptus species in the tropics. Sixty-three microsatellite markers were placed on the E. grandis map in 11 linkage groups, and 53 on the E. urophylla map distributed in 10 linkage groups. Approximately 66% of the microsatellite markers segregated in a fully informative fashion, allowing the establishment of colinear syntenic linkage groups between the two maps. The 50 new microsatellite markers were highly informative, with an average of 14 alleles per locus, and average expected heterozygosity between 0.82 and 0.87. Furthermore, within the subgenus Symphyomyrtus. to which the vast majority of commercially important Eucalyptus species belong, these markers display on average 90% transportability. This set of 70 mapped microsatellite markers represents a significant step toward the development of a genus-wide reference linkage map for Eucalyptus. These highly multiallelic and transportable markers constitute a powerful tool for QTL discovery and validation, and can be used in directed searches for QTL allele variation across Eucalyptus pedigrees. |
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Palavras-Chave: |
Linkage map; Microsatellite; Simple sequence repeats; SSR. |
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Thesagro: |
Eucalipto; Marcador Molecular. |
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Thesaurus Nal: |
Eucalyptus; Linkage (genetics); Microsatellite repeats. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
LEADER 02217naa a2200265 a 4500
001 1211700
005 2022-04-29
008 2002 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s00438-002-0665-6$2DOI
100 1 $aBRONDANI, R. P. V.
245 $aTowards a genus-wide reference linkage map for Eucalyptus based exclusively on highly informative microsatellite markers.$h[electronic resource]
260 $c2002
520 $aA novel set of 50 highly polymorphic microsatellite markers were developed and mapped on existing RAPD framework maps of Eucalyptus grandis and E. urophylla. Together with the twenty previously developed microsatellite markers, these were used to align the existing maps for the two most commercially important Eucalyptus species in the tropics. Sixty-three microsatellite markers were placed on the E. grandis map in 11 linkage groups, and 53 on the E. urophylla map distributed in 10 linkage groups. Approximately 66% of the microsatellite markers segregated in a fully informative fashion, allowing the establishment of colinear syntenic linkage groups between the two maps. The 50 new microsatellite markers were highly informative, with an average of 14 alleles per locus, and average expected heterozygosity between 0.82 and 0.87. Furthermore, within the subgenus Symphyomyrtus. to which the vast majority of commercially important Eucalyptus species belong, these markers display on average 90% transportability. This set of 70 mapped microsatellite markers represents a significant step toward the development of a genus-wide reference linkage map for Eucalyptus. These highly multiallelic and transportable markers constitute a powerful tool for QTL discovery and validation, and can be used in directed searches for QTL allele variation across Eucalyptus pedigrees.
650 $aEucalyptus
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650 $aMicrosatellite repeats
650 $aEucalipto
650 $aMarcador Molecular
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653 $aSSR
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700 1 $aGRATTAPAGLIA, D.
773 $tMolecular Genetic Genomics$gv. 267, n. 3, p. 338-347, May 2002.
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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Biblioteca |
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Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 383 | |
| 104. |  | CIAMPI, A. Y.; GAIOTTO, F. A.; MARQUES, C. M.; WALTER, B. M. T.; GRATTAPAGLIA, D. A. Amplified fragment length polymorphism (AFLP) for population genetics studies of tropical trees. Brazilian Journal of Genetics, Ribeirao Preto, v.19, n.3, p.284, 1996. Supplement.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 105. | | LOURENÇO, R. T.; CUNHA, A. F.; TSUKUMO, F.; PEREIRA, G. A. G.; GRATTAPAGLIA, D. Análise da composição e organização do genoma de Eucalyptus grandis com base em sequenciamento "shotgun" por amostragem ("sample sequencing"). In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 7., 2002, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2002. p. 30.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 106. | | NEVES, L. G.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; PAQUALI, G.; KIRST, M.; GRATTAPAGLIA, D. Advancing to a high density gene-rich map based on single feature polymorphisms in tropical eucalyptus. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 17., 2009, San Diego, CA. [Proceedings...]. [S. l.: s.n.], 2009. W185| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 107. | | SILVA, A. G.; GAIOTTO, F. A.; CIAMPI, A. Y.; GRATTAPAGLIA, D. Análise de genética populacional de duas espécies de palmito (Euterpe edulis E Euterpe oleracea) utilizando microssatélites. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 5., 2000, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2000. p. 42.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 108. | | VAZ, A. R. C.; BRONDANI, R. P. V.; BROMMONSCHENKEL, S. H.; GRATTAPAGLIA, D. Ancoragem do mapa genético no mapa físico utilizando marcadores microssatélites a partir de uma biblioteca de BACs de Eucalyptus grandis. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 52., 2006, Foz do Iguaçu, PR. Resumos... Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2006. p. 1167.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 109. | | LAVIOLA, B. G.; ALVES, A. A.; ROSADO, T. B.; GRATTAPAGLIA, D.; BHERING, L. L. Breeding jatropha by genomic selection: a pilot assessment of accuracy of predictive models. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 22., 2014, San Diego, CA. [Abstracts]. San Diego: [s.n.], 2014. P707.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 110. | | LAVIOLA, B. G.; ALVES, A. A.; ROSADO, T. B.; GRATTAPAGLIA, D.; BHERING, L. L. Breeding jatropha by genomic selection: a pilot assessment of accuracy of predictive models. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 22., 2014, San Diego, CA. Abstracts... California: Quartzy, 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 111. | | CUPERTINO, F. B.; LEAL, J. B.; GRATTAPAGLIA, D.; GAIOTTO, F. A. Certificação de paternidade e maternidade em famílias de Eucalyptus spp por meio de marcadores microssatélites. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 52., 2006, Foz do Iguaçu, PR. Resumos... Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2006. p. 937.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 113. | | AZEVEDO, V. C. R.; KANASHIRO, M.; GRATTAPAGLIA, D.; CIAMPI, A. Y. Caracterização genética molecular de maçaranduba - anilkara huberi (Ducke) A.Chev. (Sapotaceae): potencial implicação na definição de um programa de manejo sustentável. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 10., 2005, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2005. p. 159.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 114. | | LAU, E. Y.; SOARES, B. L.; MELO, J. O.; BROMMONSCHENKEL, S. H.; GRATTAPAGLIA, D. Caracterização estrutural de uma região genômica de Eucalyptus grandis que contém uma família gênica que codifica xiloglucana endotransglicosilases/hidrolases. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 52., 2006, Foz do Iguaçu, PR. Resumos... Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2006. p. 1235.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 116. | | SANSALONI, C. P.; MAMANI, E. M.; PAPPAS, G. J.; GRATTAPAGLIA, D. Análise populacional e mapeamento genético de microssatélites tetra e pentanucleotídeos em espécies de Eucalyptus. In : ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 12., 2007, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2007. p. 158.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 119. | | BROMMONSCHENKEL, S. H.; LIMA, J. C.; SOARES, B. L.; GRATTAPAGLIA, D. Construção e caracterização de uma biblioteca BAC de Eucalyptus grandis. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 52., 2006, Foz do Iguaçu, PR. Resumos... Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2006. p. 1080.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 120. | | VAZ, A. R. C.; BRONDANI, R. P. V.; BROMMONSCHENKEL, S. H.; GRATTAPAGLIA, D. Posicionamento de microssatélites em clones BAC: rumo à integração do mapa genético e mapa físico (BACs) de Eucalyptus grandis. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 51., 2005, Águas de Lindóia, SP. A era da genômica: da bioestatística à bioinformática: anais. Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2005. p. 612.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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