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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
Data corrente: |
14/04/2015 |
Data da última atualização: |
30/01/2024 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
DORNELES, E. M. S.; SANTANA, J. A.; RIBEIRO, D.; DORELLA, F. A.; GUIMARAES, A. S.; MOAWAD, M. S.; SELIM, S. A.; GARALDI, A. L. M.; MIYOSHI, A.; RIBEIRO, M. G.; GOUVEIA, A. M. G.; AZEVEDO, V.; HEINEMANN, M. B.; LAGE, A. P. |
Afiliação: |
ELAINE M. S. DORNELES, UFMG; JORDANA A. SANTANA, UFMG; DAYANA RIBEIRO, UFMG; FERNANDA ALVES DORELLA, UFMG; ALESSANDRO DE SA GUIMARAES, CNPGL; MOHAMED S. MOAWAD, Cairo University, Cairo, Egypt; SALAH A. SELIM, Cairo University, Cairo, Egypt; ANA LUIZA M. GARALDI, UNERJ; ANDERSON MIYOSHI, UFMG; MARCIO G. RIBEIRO, UNESP; AURORA M. G. GOUVEIA, UFMG; VASCO AZEVEDO, UFMG; MARCOS B. HEINEMANN, UFMG; ANDREY P. LAGE, UFMG. |
Título: |
Evaluation of ERIC-PCR as Genotyping Method for Corynebacterium pseudotuberculosis Isolates. |
Ano de publicação: |
2014 |
Fonte/Imprenta: |
Plos One, v. 9, n. 6, e98758, 2014. |
DOI: |
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0098758 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The aim of this study was to evaluate the Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus (ERIC-PCR) as a tool for molecular typing of C. pseudotuberculosis isolates from eight different hosts in twelve countries. Ninety-nine C. pseudotuberculosis field strains, one type strain (ATCC 19410T ) and one vaccine strain (1002) were fingerprinted using the ERIC-1R and ERIC-2 primers, and the ERIC-1R+ERIC-2 primer pair. Twenty-nine different genotypes were generated by ERIC 1-PCR, 28 by ERIC 2-PCR and 35 by ERIC 1+2-PCR. The discriminatory index calculated for ERIC 1, ERIC 2, and ERIC 1+2-PCR was 0.89, 0.86, and 0.92, respectively. Epidemiological concordance was established for all ERIC-PCR assays. ERIC 1+2-PCR was defined as the best method based on suitability of the amplification patterns and discriminatory index. Minimal spanning tree for ERIC 1+2-PCR revealed three major clonal complexes and clustering around nitrate-positive (biovar Equi) and nitrate-negative (biovar Ovis) strains. Therefore, ERIC 1+2-PCR proved to be the best technique evaluated in this study for genotyping C. pseudotuberculosis strains, due to its usefulness for molecular epidemiology investigations. |
Palavras-Chave: |
Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus (ERIC-PCR). |
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/122336/1/Cnpgl-2014-PlosOne-Evaluation.pdf
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Marc: |
LEADER 02105naa a2200301 a 4500 001 2013504 005 2024-01-30 008 2014 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1371/journal.pone.0098758$2DOI 100 1 $aDORNELES, E. M. S. 245 $aEvaluation of ERIC-PCR as Genotyping Method for Corynebacterium pseudotuberculosis Isolates.$h[electronic resource] 260 $c2014 520 $aThe aim of this study was to evaluate the Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus (ERIC-PCR) as a tool for molecular typing of C. pseudotuberculosis isolates from eight different hosts in twelve countries. Ninety-nine C. pseudotuberculosis field strains, one type strain (ATCC 19410T ) and one vaccine strain (1002) were fingerprinted using the ERIC-1R and ERIC-2 primers, and the ERIC-1R+ERIC-2 primer pair. Twenty-nine different genotypes were generated by ERIC 1-PCR, 28 by ERIC 2-PCR and 35 by ERIC 1+2-PCR. The discriminatory index calculated for ERIC 1, ERIC 2, and ERIC 1+2-PCR was 0.89, 0.86, and 0.92, respectively. Epidemiological concordance was established for all ERIC-PCR assays. ERIC 1+2-PCR was defined as the best method based on suitability of the amplification patterns and discriminatory index. Minimal spanning tree for ERIC 1+2-PCR revealed three major clonal complexes and clustering around nitrate-positive (biovar Equi) and nitrate-negative (biovar Ovis) strains. Therefore, ERIC 1+2-PCR proved to be the best technique evaluated in this study for genotyping C. pseudotuberculosis strains, due to its usefulness for molecular epidemiology investigations. 653 $aEnterobacterial Repetitive Intergenic Consensus (ERIC-PCR) 700 1 $aSANTANA, J. A. 700 1 $aRIBEIRO, D. 700 1 $aDORELLA, F. A. 700 1 $aGUIMARAES, A. S. 700 1 $aMOAWAD, M. S. 700 1 $aSELIM, S. A. 700 1 $aGARALDI, A. L. M. 700 1 $aMIYOSHI, A. 700 1 $aRIBEIRO, M. G. 700 1 $aGOUVEIA, A. M. G. 700 1 $aAZEVEDO, V. 700 1 $aHEINEMANN, M. B. 700 1 $aLAGE, A. P. 773 $tPlos One$gv. 9, n. 6, e98758, 2014.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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Cutter |
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Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Semiárido. |
Data corrente: |
06/07/2007 |
Data da última atualização: |
19/01/2024 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Autoria: |
LOPES, A. P.; SILVA, F. F. S. da; LÚCIO, A. A.; PEREIRA, M. S.; BATISTA, P. F.; PIRES, M. M. da L.; ARAGÃO, C. A.; DANTAS, B. F. |
Afiliação: |
ARMANDO PEREIRA LOPES, UPE; FABRÍCIO FRANCISCO SANTOS DA SILVA, UPE; ALDENIR ALVES LUCIO, UPE; MAIANE SANTOS PEREIRA, UPE; PATRÍCIO FERREIRA BATISTA, UNEB; MAYARA MILENA DA LUZ PIRES, UNEB; CARLOS ALBERTO ARAGÃO, UNEB; BARBARA FRANCA DANTAS, CPATSA. |
Título: |
Efeito de diferentes substratos, submetidos a diferentes níveis de sombreamento, sobre mudas de catingueira (Caesalpinia pyramidalis Tul.). |
Ano de publicação: |
2006 |
Fonte/Imprenta: |
In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMI-ÁRIDO, 1., 2006, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semi-Árido, 2006. |
Páginas: |
p. 51-55. |
Série: |
(Embrapa Semi-Árido. Documentos, 197). |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Este trabalho foi desenvolvido no laboratório de Análise de Sementes da Embrapa Semi-Árido, Petrolina ? PE, e no campo experimental da Universidade do Estado da Bahia (UNEB), no período de março a maio de 2006, com o objetivo de avaliar a influência de diferentes substratos, em diferentes níveis de sombreamento, nas mudas da catingueira. As sementes foram plantadas em sacos plásticos com diferentes substratos (solo; areia; areia+solo; areia+solo+esterco caprino e substrato comercial) e expostas a diferentes níveis de sombreamento (0%,30%,50%,75%). As avaliações foram realizadas 30 e 60 dias após a semeadura. Os parâmetros avaliados foram: peso de matéria fresca e seca (PMFF e PMSF, respectivamente) da folha, área foliar (AF) e número de folhas (NF). Com base nos resultados obtidos, pode-se concluir que: os níveis de sombreamentos utilizados não apresentaram efeitos significativos nos parâmetros avaliados e o substrato areia+solo, na maioria dos ambientes, induziu maior desenvolvimento foliar das mudas. |
Palavras-Chave: |
Recursos naturais; Sobreamento; Substrato. |
Thesagro: |
Caesalpinia Pyramidalis; Catingueira; Muda; Semente. |
Thesaurus NAL: |
Natural resources. |
Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/197532/1/SDC197.pdf
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Marc: |
LEADER 02070nam a2200313 a 4500 001 1159069 005 2024-01-19 008 2006 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aLOPES, A. P. 245 $aEfeito de diferentes substratos, submetidos a diferentes níveis de sombreamento, sobre mudas de catingueira (Caesalpinia pyramidalis Tul.).$h[electronic resource] 260 $aIn: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMI-ÁRIDO, 1., 2006, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semi-Árido$c2006 300 $ap. 51-55. 490 $a(Embrapa Semi-Árido. Documentos, 197). 520 $aEste trabalho foi desenvolvido no laboratório de Análise de Sementes da Embrapa Semi-Árido, Petrolina ? PE, e no campo experimental da Universidade do Estado da Bahia (UNEB), no período de março a maio de 2006, com o objetivo de avaliar a influência de diferentes substratos, em diferentes níveis de sombreamento, nas mudas da catingueira. As sementes foram plantadas em sacos plásticos com diferentes substratos (solo; areia; areia+solo; areia+solo+esterco caprino e substrato comercial) e expostas a diferentes níveis de sombreamento (0%,30%,50%,75%). As avaliações foram realizadas 30 e 60 dias após a semeadura. Os parâmetros avaliados foram: peso de matéria fresca e seca (PMFF e PMSF, respectivamente) da folha, área foliar (AF) e número de folhas (NF). Com base nos resultados obtidos, pode-se concluir que: os níveis de sombreamentos utilizados não apresentaram efeitos significativos nos parâmetros avaliados e o substrato areia+solo, na maioria dos ambientes, induziu maior desenvolvimento foliar das mudas. 650 $aNatural resources 650 $aCaesalpinia Pyramidalis 650 $aCatingueira 650 $aMuda 650 $aSemente 653 $aRecursos naturais 653 $aSobreamento 653 $aSubstrato 700 1 $aSILVA, F. F. S. da 700 1 $aLÚCIO, A. A. 700 1 $aPEREIRA, M. S. 700 1 $aBATISTA, P. F. 700 1 $aPIRES, M. M. da L. 700 1 $aARAGÃO, C. A. 700 1 $aDANTAS, B. F.
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Embrapa Semiárido (CPATSA) |
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