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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
Data corrente: |
22/05/2007 |
Data da última atualização: |
22/05/2007 |
Autoria: |
SILVA, D. C. G.; MORTEL, M. van de; WHITHAM, S.; BAUM, T.; PASSIANOTTO, A. L. de L.; NOGUEIRA, L. M.; BENEVENTI, M. A.; BINNECK, E.; YAMANAKA, N.; NEPOMUCENO, A. L.; ALMEIDA, A. M. R.; DI MAURO, A. O.; ABDELNOOR, R. V. |
Título: |
Construção e análise de bibliotecas subtrativas de cDNA de genótipos de soja sob interação com o fungo causador da ferrugem asiática. |
Ano de publicação: |
2006 |
Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 52.; CONGRESO DE LA ASOCIACIÓN LATINOAMERICANA DE GENÉTICA, 12., 2006, Foz do Iguaçu. Resumos... Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2006. |
Descrição Física: |
1 CD-ROM. |
Idioma: |
Português |
Notas: |
Área Plantas - pdf 1270. |
Conteúdo: |
Entre os problemas que afetam a produção de soja no Brasil, a doença fúngica chamada ferrugem asiática, causada por Phakopsora pachyrhizi Sydow & Sydow, tem sido responsável por severos danos econômicos. Apesar de se saber a localização genômica de alguns dos locos de resistência vertical a ferrugem asiática, nada se sabe quanto ao mecanismo molecular da interação do fungo com a soja e as complexas vias metabólicas que são ativadas em genótipos suscetíveis e resistentes em função desta interação, culminando na efetiva infecção da planta pelo patógeno ou no impedimento da proliferação do mesmo. O objetivo deste estudo foi construir e analisar bibliotecas subtrativas de cDNA em genótipos suscetíveis e resistentes a P. pachyrhizi em situação de infecção precoce e tardia, visando conhecer os genes que são diferencialmente expressos durante essa interação. Para a obtenção de cDNA, foram montados quatro tratamentos: amostras de folhas do genótipo resistente PI230970 e do genótipo suscetível Embrapa 48, coletadas às 24 e 192hs após inoculação com o fungo. Para a construção das bibliotecas subtrativas utilizou-se a metodologia de Hibridização Subtrativa Supressiva (SSH) que promove o enriquecimento de populações de mRNA diferencialmente expressos, durante a qual houve a subtração dos quatro tratamentos pelos seus equivalentes falso inoculados. Os fragmentos amplificados através dessa técnica foram clonados e sequenciados, e as seqüências obtidas foram comparadas a acessos de seqüências de nucleotídeos e de proteínas do GenBank, utilizando o algoritmo BLASTX. Para as quatro bibliotecas, foram obtidos cerca de 6000 clones. Destes, 384 foram seqüenciados até o momento, sendo 96 de cada biblioteca, sendo que apenas 142 (37 %) eram de sequências únicas, demonstrando uma alta redundância de clones nas bibliotecas. A categorização dos transcritos de ambas as bibliotecas construídas com cDNA da Embrapa 48 resultou em 34% de proteínas relacionadas ao metabolismo, 3% de proteínas de estrutura celular, 11% de proteínas de defesa celular, 6% de proteínas relacionadas a transcrição e tradução, 1% de proteínas de transdução de sinal, 3% de proteínas de transporte, 3% de proteínas da organização celular e divisão, 11% de proteínas de classificação incerta ou desconhecida e 20% não apresentou similaridade com as seqüências disponíveis no GenBank. Já para as bibliotecas da PI230970 houve 17% de proteínas relacionadas ao metabolismo, 37% de proteínas de defesa celular, 4% de proteínas de transdução de sinal, 8% de proteínas de transporte, 1% de proteínas da organização celular e divisão, 13% de proteínas de classificação incerta ou desconhecida e 20% não apresentou similaridade com as seqüências disponíveis no GenBank. Os resultados deste trabalho irão contribuir para um avanço na compreensão dos mecanismos de resistência das plantas de soja a este patógeno, e assim auxiliar no desenvolvimento de métodos mais eficientes de controle. MenosEntre os problemas que afetam a produção de soja no Brasil, a doença fúngica chamada ferrugem asiática, causada por Phakopsora pachyrhizi Sydow & Sydow, tem sido responsável por severos danos econômicos. Apesar de se saber a localização genômica de alguns dos locos de resistência vertical a ferrugem asiática, nada se sabe quanto ao mecanismo molecular da interação do fungo com a soja e as complexas vias metabólicas que são ativadas em genótipos suscetíveis e resistentes em função desta interação, culminando na efetiva infecção da planta pelo patógeno ou no impedimento da proliferação do mesmo. O objetivo deste estudo foi construir e analisar bibliotecas subtrativas de cDNA em genótipos suscetíveis e resistentes a P. pachyrhizi em situação de infecção precoce e tardia, visando conhecer os genes que são diferencialmente expressos durante essa interação. Para a obtenção de cDNA, foram montados quatro tratamentos: amostras de folhas do genótipo resistente PI230970 e do genótipo suscetível Embrapa 48, coletadas às 24 e 192hs após inoculação com o fungo. Para a construção das bibliotecas subtrativas utilizou-se a metodologia de Hibridização Subtrativa Supressiva (SSH) que promove o enriquecimento de populações de mRNA diferencialmente expressos, durante a qual houve a subtração dos quatro tratamentos pelos seus equivalentes falso inoculados. Os fragmentos amplificados através dessa técnica foram clonados e sequenciados, e as seqüências obtidas foram comparadas a acessos de seqüênc... Mostrar Tudo |
Categoria do assunto: |
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Marc: |
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Embrapa Soja (CNPSO) |
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Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Soja. |
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Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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154. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | NEPOMUCENO, A. L.; SILVA, J. F. V.; LEMOS, E. G. M.; BINNECK, E.; CARNEIRO, N.; MARIN, S. R.; SILVEIRA, C. A; WENDLAND, A.; BASSOI, M. C.; ALMIEDA, A. M.; MORAES, A.; BENEVENTI, M. A.; GIACOMINI, N.; STOLF, R.; FUGANTI, R.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; ARIAS, C. A.; MOLINA, J. C. Genoma funcional de raízes de soja. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE NEMATOLOGIA, 24., 2003, Petrolina. [ Anais...]. Petrolina: Sociedade Brasileira de Nematologia: Embrapa Semi-Árido, 2003. p. 53-55. Editado por Wellington Antonio Moreira, Lúcia Helena Piedade Kiill.Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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155. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | ROMERO, C. C. T.; STOLF-MOREIRA, R.; BRITO JÚNIOR, S. L.; CATELLI, L. L.; PEREIRA, R. M.; LINO, E. J.; SILLA, P. R.; NASCIMENTO, L. S. do; NASCIMENTO, L. C. do; CARAZZOLLE, M. F.; BINNECK, E.; MARCELINO, F. C.; ABDELNOOR, R. V. Genome-wide expression analysis of soybean plants under an incompatible interaction with the fungus Uromyces appendiculatus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA, 3., 2010, Fortaleza. Programa e resumos. Brasília, DF: SBBiotec, 2010. p. 219-220.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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156. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | NEPOMUCENO, A. L.; SILVA, J. F. V.; LEMOS, E. G. M.; BINNECK, E.; CARNEIRO, N.; MARIN, S. R. R.; SILVEIRA, C. A.; BASSOI, M. C.; ALMEIDA, A. M. R.; MORALES, A.; BENEVENTI, M. A.; GIACOMINI, N.; STOLF, R.; FUGANTI, R.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; ARIAS, C. A. A.; MOLINA, J. C.; WENDLAND, A. Genômica funcional em plantas de soja submetidas a estresses bióticos e abióticos. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 25., 2003, Uberaba. Resumos... Londrina: Embrapa Soja: EPAMIG: Fundação Triângulo, 2003. p. 113-114. (Embrapa Soja. Documentos, 209). Organizado por Odilon Ferreira Saraiva, Regina Maria Villas Boas de Campos Leite.Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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157. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | NEPOMUCENO, A. L.; SILVA, J. F. V.; LEMOS, E.; BINNECK, E.; CARNEIRO, N.; MARIN, S. R.; SILVEIRA, C. A.; BASSOI, M. C.; ALMEIDA, A. M.; MORALES, A.; BENEVENTI, M. A.; GIACOMINI, N.; STOLF, R.; FUGANTI, R.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; ARIAS, C. A.; MOLINA, J. C.; WENDLAND, A. Genômica Funcional: Tolerância à seca e resistência a nematóides em soja. Brazilian Journal of Plant Physiology, Campinas, v.15, p.80, 2003. Suplemento. Resumo apresentado no IX Congresso Brasileiro de Fisiologia Vegetal, Atibaia, 2003.Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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158. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | SILVA, D. C. G. da; STOLF, R.; MORTEL, M. de van; LEMOS, N. G.; SANTOS, J. V. M. dos; PEREIRA, R. M.; BINNECK, E.; ALMEIDA, A. M. R.; NEPOMUCENO, A. L.; YAMANAKA, N.; MARCELINO, F. C.; BAUM, T. J.; WHITHAM, S. A.; LEMOS, E. G. M.; ABDELNOOR, R. V. Transcritos da soja induzidos durante interação com a ferrugem asiática. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 54., 2008, Salvador. Resumos... Salvador: SBG, 2008. p. 319.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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159. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | BINNECK, E.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V. ALMEIDA, A. M. R.; SOSA-GÓMEZ, D. R.; FARIAS, J. R. B.; BASSOI, M. C.; SILVA, J. F. V.; HOFFMANN-CAMPO, C. B.; OLIVEIRA, M. C. N.; MARCELINO, F. C.; PEREIRA, R. M.; GREGORIO, D.; MARIN, S. R. R.; SILVEIRA, C. A. Setting the bioinformatics laboratory at Embrapa Soybean aiming to ameliorate biotic and abiotic stresses. In: MEETING INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 3., 2007, São Paulo. X-Meeting 2007: proceedings. Campinas: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2007. p. 195. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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160. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | NEPOMUCENO, A. L.; LUGLE, S.; ARIAS, C. A. A.; SILVA, J. F. V.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; OYA, T.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; LEMOS, N. G.; BRETON, M. C.; MARTINS, P. K.; PEDROSO, J. C.; DELATTRE, N.; CARNEIRO, N.; LEITE, A. Transformação de plantas de soja por biobalística com genes de interesse. In: HOFFMANN-CAMPO, C. B.; SARAIVA, O. F. (Org.). Resultados de pesquisa da Embrapa Soja - 2001: ecofisiologia e biologia molecular. Londrina: Embrapa Soja, 2002. p. 40-42. (Embrapa Soja. Documentos, 198).Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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