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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Solos. |
Data corrente: |
14/03/2000 |
Data da última atualização: |
25/08/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
OLIVEIRA, V. M. de; COUTINHO, H. L. da C.; SOBRAL, B. W. S.; GUIMARAES, C. T.; ELSAS, J. D. van; MANFIO, G. P. |
Afiliação: |
V. M. DE OLIVEIRA, FUNDAÇÃO ANDRÉ TOSELLO; HEITOR LUIZ DA COSTA COUTINHO, CNPS; B. W. S. SOBRAL, NATIONAL CENTER FOR GENOME RESOURCES; C. T. GUIMARÃES, NATIONAL CENTER FOR GENOME RESOURCES; J. D. VAN ELSAS, RESEARCH INSTITUTE FOR PLANT PROTECTION; GILSON PAULO MANFIO, FUNDAÇÃO ANDRÉ TOSELLO. |
Título: |
Discrimination of Rhizobium tropici and R. leguminosarum strains by PCR-specific amplification of 16S-23S rDNA spacer region fragments and denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE). |
Ano de publicação: |
1999 |
Fonte/Imprenta: |
Letters in Applied Microbiology, v. 28, N. 2, p. 137-141, Feb. 1999. |
DOI: |
https://doi.org/10.1046/j.1365-2672.1999.00480.x |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
With the aim of detecting Rhizobium species directly in the environment, specific PCR primers for Rh, tropici and Rh, leguminosarum were designed on the basis of sequence analysis of 16S-23S rDNA spacer regions of several Rh. tropici, Rh. leguminosarum and Agrobacterium rhizogenes strains. Primer specificity was checked by comparison with available rDNA spacer sequences in databases, and by PCR using DNA from target and reference strains. Sequence polymorphisms of rDNA spacer fragments among strains of the same species were detected by denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE). The specific PCR primers designed in the study could be applied to evaluate the diversity of Rh. tropici and Rh. leguminosarum by analysing the polymorphisms of 16S-23S spacer rDNA amplified from either whole-cell or soil-extracted DNA. |
Palavras-Chave: |
Analysis; Database; Diversidade; Diversity; tropici. |
Thesagro: |
Base de Dados; DNA; Eletroforese; Rhizobium; Solo. |
Thesaurus Nal: |
electrophoresis; soil. |
Categoria do assunto: |
-- P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
Marc: |
LEADER 01876naa a2200337 a 4500 001 1335364 005 2023-08-25 008 1999 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1046/j.1365-2672.1999.00480.x$2DOI 100 1 $aOLIVEIRA, V. M. de 245 $aDiscrimination of Rhizobium tropici and R. leguminosarum strains by PCR-specific amplification of 16S-23S rDNA spacer region fragments and denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE).$h[electronic resource] 260 $c1999 520 $aWith the aim of detecting Rhizobium species directly in the environment, specific PCR primers for Rh, tropici and Rh, leguminosarum were designed on the basis of sequence analysis of 16S-23S rDNA spacer regions of several Rh. tropici, Rh. leguminosarum and Agrobacterium rhizogenes strains. Primer specificity was checked by comparison with available rDNA spacer sequences in databases, and by PCR using DNA from target and reference strains. Sequence polymorphisms of rDNA spacer fragments among strains of the same species were detected by denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE). The specific PCR primers designed in the study could be applied to evaluate the diversity of Rh. tropici and Rh. leguminosarum by analysing the polymorphisms of 16S-23S spacer rDNA amplified from either whole-cell or soil-extracted DNA. 650 $aelectrophoresis 650 $asoil 650 $aBase de Dados 650 $aDNA 650 $aEletroforese 650 $aRhizobium 650 $aSolo 653 $aAnalysis 653 $aDatabase 653 $aDiversidade 653 $aDiversity 653 $atropici 700 1 $aCOUTINHO, H. L. da C. 700 1 $aSOBRAL, B. W. S. 700 1 $aGUIMARAES, C. T. 700 1 $aELSAS, J. D. van 700 1 $aMANFIO, G. P. 773 $tLetters in Applied Microbiology$gv. 28, N. 2, p. 137-141, Feb. 1999.
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Registro original: |
Embrapa Solos (CNPS) |
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Registros recuperados : 5 | |
1. | | WEID, I. von der; PAIVA, E.; NOBREGA, A.; ELSAS, J. D. van; SELDIN, L. Diversity of Paenibacillus polymyxa strains isolated from the rhizosphere of maize planted in cerrado soil. Research in Microbiology, Paris, v. 151, n. 5, p. 369-381, 2000.Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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2. | | COTTA, S. R.; DIAS, A. C. F.; MARRIEL, I. E.; GOMES, E. A.; ELSAS, J. D. van; SELDIN, L. Avaliação do possível impacto de milho geneticamente modificado na ciclagem do nitrogênio em solo de Cerrado. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 30.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 14.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 12.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 9.; SIMPÓSIO SOBRE SELÊNIO NO BRASIL, 1., 2012, Maceió. A responsabilidade socioambiental da pesquisa agrícola: anais. Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2012. 1 CD-ROM. Fertbio 2012.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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3. | | COTTA, S. R.; DIAS, A. C. F.; MARRIEL, I. E.; ANDREOTE, F. D.; SELDIN, L.; ELSAS, J. D. van. Different effects of transgenic maize and nontransgenic maize on nitrogen-transforming archaea and bacteria in tropical soils. Applied and Environmental Microbiology, Washington, v. 80, n. 20, p. 6437-6445, Oct. 2014.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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4. | | SELDIN, L.; ROSADO, A. S.; CRUZ, D. W. da; NOBREGA, A.; ELSAS, J. D. van; PAIVA, E. Comparison of Paenibacillus azotofixans strains isolated from rhizoplane, rhizosphere, and non-root-associated soil from maize planted in two different Brazilian soils. Applied and Environmental Microbiology, Washington, v. 64, n. 10, p. 3860-3868, 1998.Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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5. | | COTTA, S. R.; DIAS, A. C. F.; MARRIEL, I. E.; GOMES, E. A.; ELSAS, J. D. van; SELDIN, L. Temporal dynamics of microbial communities in the rhizosphere of two genetically modified (GM) maize hybrids in tropical agrosystems. Antonie van Leeuwenhoek, Dordrecht, v. 103, n. 3, p. 589-601, 2013.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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Registros recuperados : 5 | |
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