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Registros recuperados : 178 | |
103. | | SOUZA, M. de F.; PIMENTEL-NETO, M.; SILVA, R. M. da; FARIAS, A. C. B.; GUIMARÃES, M. P. Gastrointestinal parasites of sheep, municipality of Lajes, Rio Grande do Norte, Brazil. Revista Brasileira de Parasitologia Veterinária, Jaboticabal, v. 21, n. 1, p. 71-73, jan./mar. 2012. Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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104. | | DIAS, J. do S. A.; SOUZA, M. de L. M. de; ALVARES, V. de S.; SILVA, O. F. Fungos produtores de metabólicos tóxicos em castanha-do-brasil no Estado do Amapa. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICOLOGIA, 7., 2013, Belém, PA. Livro de Resumos.... Belém, PA: Sociedade Brasileira de Micologia, 2013. p. 141. Biblioteca(s): Embrapa Acre; Embrapa Agroindústria de Alimentos; Embrapa Amapá. |
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107. | | AMARAL, A. M. do; MENEGUCCI, J. L. de P.; MARINHO, C. S.; PAIVA, L. V.; SOUZA, M. de. Avaliacao do vigor da tangoreira 'Murcott' (Citrus reticulata Blanco C. sinensis Osbeck) sobre dois diferentes porta-enxertos. In: CONGRESSO DA POS-GRADUACAO NA ESAL, 6., 1993, Lavras. Anais: Cerrado: torto, nem por isso errado. Lavras: ESAL, 1993. p.1-2. Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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108. | | CARVALHO, H. H. de; PAIVA, L. V.; GUIMARAES, C. T.; MELO, E. F.; ROCHA, E. A.; SOUZA, M. de. Avaliação da similaridade genética entre variedades de laranjas (Citrus sinensis (L.) Osbeck) e mutantes da "folha murcha" por meio de marcadores moleculares RAPD. In: CONGRESSO DE POS-GRADUAÇÃO DA ESAL, 16., 2007, Lavras: Anais... Lavras: UFLA, 2007. 1 CD-ROM. Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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109. | | COSTA, R. A.; FARIAS, A. X. de; CORREA, T. B. S.; SOUZA, M. de L. M. de; FREITAS-SILVA, O. Verificação da adoção das boas práticas agrícolas em café mediante a aplicação de questionário socio-econômico em propriedades produtoras de café. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 3., 2003, Porto Seguro. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2003. p. 269-270. Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos. |
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110. | | PADILHA, A. C. M.; EIDELWEIN, J.; VASCONCELOS NETO, A. G.; VIEIRA, A. C. P.; SOUZA, M. de. O uso de recursos estratégicos na produção de orgânicos: o caso dos produtores da feira ecológica de Passo Fundo-RS. Desenvolvimento em Questão, Ijuí, v. 17, n. 48, p. 312-333, 27 ago. 2019. Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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111. | | REZENDE, L. de P.; AMARAL, A. M. do; CARVALHO, S. A. de; SOUZA SOBRINHO, F. de; SOUZA, M. de. Volume de substrato e superfosfato simples na formacao do limoeiro `Cravo' em vasos. II - efeitos no peso de materia seca total, da parte aerea e do sistema radicular Ciencia e Agrotecnologia, v.22, n.4, p.509-515, Lavras, 1998 Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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114. | | SANTIAGO, M. C. P. de A.; ANJOS, M. R. dos; JESUS, M. S. C. de; SOUZA, M. de L. M. de; PACHECO, S.; BIZZO, H. R. Análise e caracterização de taninos condensados por cromatografia líquida. Brazilian Journal of Development, Curitiba, v. 6, n. 8, p. 61446-61462, ago. 2020. Analysis and characterization of condensed tannins by liquid chromatography. Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos. |
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115. | | FARIA-MACHADO, A. F. de; LICURGO, F. M. S.; PIRES, J. M. F.; CAMPOS, R. da S.; WILHELM, A. E.; SOUZA, M. de L. M. de; ANTONIASSI, R. Method validation for analysis of phorbol esters from Jatropha curcas. Industrial Crops & Products, v. 140, 2019, 111627. 8 p. Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos. |
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116. | | ANJOS, M. R. dos; CASTRO, I. M. de; SOUZA, M. de L. M. de; LIMA, V. V. DE; AQUINO-NETO, F. R. DE. Multiresidue method for simultaneous analysis of aflatoxin M1, avermectins, organophosphate pesticides and milbemycin in milk by ultra-performance liquid chromatography coupled to tandem mass spectrometry. Food Additives & Contaminants. Part A: Chemistry, Analysis, Control, Exposure & Risk Assessment, v. 33, n. 6, p. 995-1002, jun. 2016. Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos. |
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118. | | OLIVEIRA JUNIOR, J. P. de; CARVALHO, H. G. de; MALAVOLTA E.; PAULA, M. B. de; SOUZA, M. de; GUILHERME, L. R. G. Diagnose foliar em citros. I. Efeito de cultivares e de quadrantes de coleta de folhas nos teores de macronutrientes. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 29, n. 4, p. 579-585, abr. 1994. Título em inglês: Foliar diagnosis in citrus. I. Effect of cultivars and of leaf collecting quadrants on macronutrient amounts. Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros; Embrapa Unidades Centrais. |
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119. | | OLIVEIRA JUNIOR, J. P. de; CARVALHO, H. G. de; MALAVOLTA, E.; PAULA, M. B. de; SOUZA, M. de; GUILHERME, L. R. G. Diagnose foliar em citros. II. Efeito de cultivares e de quadrantes de coleta de folhas nos teores de micronutrientes. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 29, n. 4, p.587-592, abr. 1994. Título em inglês: Foliar diagnosis in citrus. II. Effect of cultivars and of leaf collecting quadrants on micronutrient amounts. Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros; Embrapa Unidades Centrais. |
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120. | | PEREIRA, D. I. da P.; SOUZA, J. C. de; SANTA-CECÍLIA, L. V. C.; REIS, P. R.; SOUZA, M. de A. Parasitismo de larvas da mosca- mineradora Liriomysa huidobrensis Blanchard (Diptera: Agromyzidae) pelo parasítoide. Ciência e Agrotecnologia, Lavras, v. 26, n. 5, p. 955-963, nov. 2002. Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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Registros recuperados : 178 | |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
Data corrente: |
14/08/2020 |
Data da última atualização: |
10/09/2020 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Circulação/Nível: |
A - 1 |
Autoria: |
LIMA, A. O. de; KOLTES, J. E.; DINIZ, W. J. S.; OLIVEIRA, P. S. N. de; CESAR, A. S. M.; TIZIOTO, P. L.; AFONSO, J.; SOUZA, M. de S.; PETRINI, J.; ROCHA, M. I. P.; CARDOSO, T. F.; ZERLOTINI NETO, A.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; REGITANO, L. C. de A. |
Afiliação: |
ANDRESSA O. DE LIMA, UFSCar; JAMES E. KOLTES, Iowa State University; WELLISON J. S. DINIZ, UFSCar; PRISCILA S. N. DE OLIVEIRA; ALINE S. M. CESAR, Esalq/USP; POLYANA C. TIZIOTO, NGS Genomic Solution; JULIANA AFONSO, UFSCar; MARCELA M. DE SOUZA, Iowa State University; JULIANA PETRINI, UNIFAL; MARINA I. P. ROCHA, UFSCar; TAINÃ F. CARDOSO; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; LUIZ L. COUTINHO, Esalq/USP; GERSON B. MOURÃO, Esalq/USP; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
Título: |
Potential biomarkers for feed efficiency-related traits in nelore cattle identified by co-expression network and integrative genomics analyses. |
Ano de publicação: |
2020 |
Fonte/Imprenta: |
Frontiers in Genetics, v. 11, p. 1-14, Mar. 2020. |
DOI: |
https://doi.org/10.3389/fgene.2020.00189 |
Idioma: |
Inglês |
Notas: |
Article 189. Na publicação: Luciana C. A. Regitano. |
Conteúdo: |
Feed efficiency helps to reduce environmental impacts from livestock production, improving beef cattle profitability. We identified potential biomarkers (hub genes) for feed efficiency, by applying co-expression analysis in Longissimus thoracis RNA-Seq data from 180 Nelore steers. Six co-expression modules were associated with six feed efficiency-related traits (p-value ≤ 0.05). Within these modules, 391 hub genes were enriched for pathways as protein synthesis, muscle growth, and immune response. Trait-associated transcription factors (TFs) ELF1, ELK3, ETS1, FLI1, and TCF4, were identified with binding sites in at least one hub gene. Gene expression of CCDC80, FBLN5, SERPINF1, and OGN was associated with multiple feed efficiency-related traits (FDR ≤ 0.05) and were previously related to glucose homeostasis, oxidative stress, fat mass, and osteoblastogenesis, respectively. Potential regulatory elements were identified, integrating the hub genes with previous studies from our research group, such as the putative cis-regulatory elements (eQTLs) inferred as affecting the PCDH18 and SPARCL1 hub genes related to immune system and adipogenesis, respectively. Therefore, our analyses contribute to a better understanding of the biological mechanisms underlying feed efficiency in bovine and the hub genes disclosed can be used as biomarkers for feed efficiency-related traits in Nelore cattle. |
Palavras-Chave: |
Biomarcadores; Expressão gênica; Feed efficiency; Hub genes; Longissimus thoracis; Systems biology; WGCNA. |
Thesagro: |
Bos Indicus. |
Thesaurus NAL: |
Gene expression. |
Categoria do assunto: |
-- G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/215312/1/AP-Potential-biomarkers-2020.pdf
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Marc: |
LEADER 02711naa a2200421 a 4500 001 2124356 005 2020-09-10 008 2020 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.3389/fgene.2020.00189$2DOI 100 1 $aLIMA, A. O. de 245 $aPotential biomarkers for feed efficiency-related traits in nelore cattle identified by co-expression network and integrative genomics analyses.$h[electronic resource] 260 $c2020 500 $aArticle 189. Na publicação: Luciana C. A. Regitano. 520 $aFeed efficiency helps to reduce environmental impacts from livestock production, improving beef cattle profitability. We identified potential biomarkers (hub genes) for feed efficiency, by applying co-expression analysis in Longissimus thoracis RNA-Seq data from 180 Nelore steers. Six co-expression modules were associated with six feed efficiency-related traits (p-value ≤ 0.05). Within these modules, 391 hub genes were enriched for pathways as protein synthesis, muscle growth, and immune response. Trait-associated transcription factors (TFs) ELF1, ELK3, ETS1, FLI1, and TCF4, were identified with binding sites in at least one hub gene. Gene expression of CCDC80, FBLN5, SERPINF1, and OGN was associated with multiple feed efficiency-related traits (FDR ≤ 0.05) and were previously related to glucose homeostasis, oxidative stress, fat mass, and osteoblastogenesis, respectively. Potential regulatory elements were identified, integrating the hub genes with previous studies from our research group, such as the putative cis-regulatory elements (eQTLs) inferred as affecting the PCDH18 and SPARCL1 hub genes related to immune system and adipogenesis, respectively. Therefore, our analyses contribute to a better understanding of the biological mechanisms underlying feed efficiency in bovine and the hub genes disclosed can be used as biomarkers for feed efficiency-related traits in Nelore cattle. 650 $aGene expression 650 $aBos Indicus 653 $aBiomarcadores 653 $aExpressão gênica 653 $aFeed efficiency 653 $aHub genes 653 $aLongissimus thoracis 653 $aSystems biology 653 $aWGCNA 700 1 $aKOLTES, J. E. 700 1 $aDINIZ, W. J. S. 700 1 $aOLIVEIRA, P. S. N. de 700 1 $aCESAR, A. S. M. 700 1 $aTIZIOTO, P. L. 700 1 $aAFONSO, J. 700 1 $aSOUZA, M. de S. 700 1 $aPETRINI, J. 700 1 $aROCHA, M. I. P. 700 1 $aCARDOSO, T. F. 700 1 $aZERLOTINI NETO, A. 700 1 $aCOUTINHO, L. L. 700 1 $aMOURÃO, G. B. 700 1 $aREGITANO, L. C. de A. 773 $tFrontiers in Genetics$gv. 11, p. 1-14, Mar. 2020.
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