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| Registros recuperados : 29 | |
| 1. |  | BÖCK, M. J.; OLIVEIRA, A. A. de; GODO, D. O. R.; SILVA, M. V. G. B.; MELO, T. P. de; MELLO, F. C. B.; OTTO, P. I. Melhoramento genético: da base mendeliana para produção animal. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 32., 2023, Natal. Anais... Brasília, DF: Associação Brasileira de Zootecnistas; Natal: Universidade Federal Rural do Semi-Árido, 2023. Zootec 2023.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 2. | | OTTO, P. I.; GUIMARÃES, S. E. F.; CALUS, M. P. L.; VANDENPLAS, J.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; SILVA, M. V. G. B. Single-step genome-wide association studies (GWAS) and post-GWAS analyses to identify genomic regions and candidate genes for milk yield in Brazilian Girolando cattle. Journal of Dairy Science, v. 103, n. 11, p. 10347-10360, 2020.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 3. | | TEMP, L. B.; OLIVEIRA, L. A. da S.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B.; OTTO, P. I. Seleção genômica para predição do mérito genético para características reprodutivas na raça Girolando. In: SIMPÓSIO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 6., 2021, Diamantina. Zootecnia em tempos de pandemia: oportunidades e desafios. Diamantina: Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2021.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 4. | | OLIVEIRA, L. A. da S.; TEMP, L. B.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B.; OTTO, P. I. Impacto da inclusão de informações genômicas na avaliação genética para produção de leite na raça Girolando. In: SIMPÓSIO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 6., 2021, Diamantina. Zootecnia em tempos de pandemia: oportunidades e desafios. Diamantina: Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2021.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 5. | | BÖCK, M. J.; SILVA, M. V. G. B.; PANETTO, J. C. do C.; MARTINS, M. F.; NEGRI, R.; OTTO, P. I. Diversidade genética das raças Holandesa, Pardo-Suíça e Jersey no Brasil. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE BOVINOCULTURA LEITEIRA, 9., 2023, Viçosa, MG. Anais... Viçosa, MG: Universidade Federal de Viçosa, 2023. p. 454-456.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 6. | | OTTO, P. I.; OLIVEIRA, R. A. de; NEGRI, R.; MELLO, F. C. B.; PANETTO, J. C. do C.; SILVA, M. V. G. B. Avaliação do período gestacional para a facilidade de partos em bovinos Girolando. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE BOVINOCULTURA LEITEIRA, 9., 2023, Viçosa, MG. Anais... Viçosa, MG: Universidade Federal de Viçosa, 2023. p. 447-450. IX SIMLEITE.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 7. | | CARVALHO, B. C. de; BRANDÃO, F. Z.; SANTOS, G. B.; VARAGO, F. C.; OTTO, P. I.; VARGAS, M. W.; GRÁZIA, J. G. V.; CAMARGO, L. S. de A. Oocyte quality in post-partum of 3/4 and 7/8 Holstein x Zebu primiparous crossbred cows. Animal Reproduction, v. 10, n. 3, p. 559, Jul./Sept. 2013. Suplemento. Edição dos abstracts do 27º Annual Meeting of the Brazilian Embryo Technology Society, 2013, Praia do Forte, BA.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 8. | | BÖCK, M. J.; SILVA, M. V. G. B.; PANETTO, J. C. do C.; MARTINS, M. F.; NEGRI, R.; OTTO, P. I. Padrão de ancestralidade nas raças Holandesa, Jersey e Pardo-Suiça. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE BOVINOCULTURA LEITEIRA, 9., 2023, Viçosa, MG. Anais... Viçosa, MG: Universidade Federal de Viçosa, 2023. p. 476-478.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 9. | | ROCHA, R. de F. B.; OTTO, P. I.; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; MACHADO, M. A.; VERONEZE, R.; LEANDRO, F. D.; PEREIRA, S. M.; GUIMARÃES, S. E. F.; PANETTO, J. C. do C. Repeatability and random regression models to estimate genetic parameters for oocyte and embryo production in the Gir breed. Animal Production Science, v. 62, n. 17, p. 1661-1670, 2022.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 10. | | ROCHA, R. de F. B.; GARCIA, A. O.; OTTO, P. I.; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; GUIMARÃES, S. E. F. Runs of homozygosity and signatures of selection for number of oocytes and embryos in the Gir Indicine cattle. Mammalian Genome, v. 34, p. 482-496, 2023.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 11. | | ROCHA, R. de F. B.; GARCIA, A. O.; OTTO, P. I.; SANTOS, M. G. dos; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; GUIMARÃES, S. E. F. Single-step genome-wide association studies and post-GWAS analyses for the number of oocytes and embryos in Gir cattle. Mammalian Genome, v. 34, p. 497-508, 2023.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 12. | | FACO, O.; SILVA, M. V. G. B.; PANETTO, J. C. do C.; OTTO, P. I.; LOBO, A. M. B. O.; FONSECA, J. F. da; LOBO, R. N. B.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. Sumário Capragene. Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2020. 52 p.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 13. | | MACHADO, T. F.; MICHELOTTI, V. T.; BARBEIRO, L. W.; MELO, T. P. de; OTTO, P. I.; FIGUEIREDO, E. A. P. de; MELLO, F. C. B.; RORATO, P. R. N. Análises de componentes principais e correlação de Spearman para a determinação de características a serem utilizadas em programas de melhoramento de poedeiras. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL ON-LINE, 14., 2021. Anais.... Chapecó: UDESC: Concórdia: Embrapa Suínos e Aves, 2022.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 14. | | NEGRI, R.; DALTRO, D.; KLUSKA, S.; OTTO, P. I.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; MARTINS, M. F.; OLIVEIRA, H. R. de; COBUCI, J. A.; SILVA, M. V. G. B. Genomic-enhanced breeding values for heat stress tolerance in Girolando cattle in Brazil. Livestock Science, v. 278, 105360, 2023.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 15. | | BARBEIRO, L. W.; MICHELOTTI, V. T.; MACHADO, T. F.; MELO, T. P. de; OTTO, P. I.; FIGUEIREDO, E. A. P. de; MELLO, F. C. B.; RORATO, P. R. N. Herdabilidade para características produtivas, reprodutivas e de qualidade do ovo em três linhagens poedeiras. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL ON-LINE, 14., 2021. Anais.... Chapecó: UDESC: Concórdia: Embrapa Suínos e Aves, 2022.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 16. | | OLIVEIRA, C. S.; SILVA, M. V. G. B.; QUINTAO, C. C. R.; OTTO, P. I.; ALONSO, R. V.; FERES, L. F.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; CAMARGO, L. S. de A. Imputation accuracy for genomic selection using embryo biopsy samples in Gir. Reproductive Biology, v. 23, 100765, 2023.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 17. | | FACO, O.; SILVA, M. V. G. B.; PANETTO, J. C. do C.; OTTO, P. I.; LOBO, A. M. B. O.; FONSECA, J. F. da; LOBO, R. N. B.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. Programa de Melhoramento Genético de Caprinos Leiteiros - Capragene, 3º Sumário de Avaliação Genética, 2º Sumário de Avaliação Genética Genômica, Ano 2020 - Raça Saanen. Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2020. 52 p.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 18. | | SANTOS, G. B.; CARVALHO, B. C. de; BRANDÃO, F. Z.; VARAGO, F. C.; VARGAS, M. W.; MACHADO, F. S.; CAMPOS, M. M.; CAMARGO, L. S. de A.; OTTO, P. I. Effect of diet energy on the relationship of follicular fluid estrogen and progesterone concentration in postpartum crossbred Holstein x Gir cows. Animal Reproduction, v. 11, n. 3, p. 459, 2014. Edição dos proceedings do 28º Annual Meeting of the Brazilian Embryo Technology Society, 2014, Natal.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 19. | | VERARDO, L. L.; OTTO, P. I.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; REIS, D. R. de L.; EGITO, A. A. do; VITORINO, A. S. M.; CAROLINO, M. I. C. M.; CAROLINO, N. P.; SILVA, M. V. G. B. Exploring the genetic origin of Brazilian locally adapted breeds: admixture, population history and relationship with Portuguese and indicine cattle. Livestock Science, v. 282, 105455, 2024.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 20. | | ROCHA, R. de F. B.; OTTO, P. I.; GARCIA, A. O.; SANTOS, M. G. dos; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; CALUS, M. P. L.; GUIMARÃES, S. E. F. A genética envolvida na produção de oócitos e embriões em Gir leiteiro. Balde Branco, ano 59, n. 703, p. 56-59, 2024.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| Registros recuperados : 29 | |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Gado de Leite. Para informações adicionais entre em contato com cnpgl.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
04/04/2023 |
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Data da última atualização: |
22/08/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 4 |
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Autoria: |
ROCHA, R. de F. B.; GARCIA, A. O.; OTTO, P. I.; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; GUIMARÃES, S. E. F. |
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Afiliação: |
RENATA DE FÁTIMA BRETANHA ROCHA, Universidade Federal de Viçosa; ARIELLY OLIVEIRA GARCIA, Universidade Federal de Viçosa; PAMELA ITAJARA OTTO, Universidade Federal de Santa Maria; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; MARTA FONSECA MARTINS, CNPGL; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; JOAO CLAUDIO DO CARMO PANETTO, CNPGL; SIMONE ELIZA FACIONI GUIMARÃES, Universidade Federal de Viçosa. |
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Título: |
Runs of homozygosity and signatures of selection for number of oocytes and embryos in the Gir Indicine cattle. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Mammalian Genome, v. 34, p. 482-496, 2023. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s00335-023-09989-w |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Runs of homozygosity (ROH) and signatures of selection are the results of selection processes in livestock species that have been shown to afect several traits in cattle. The aim of the current work was to verify the profle of ROH and inbreeding depression in the number of total (TO) and viable oocytes (VO) and the number of embryos (EMBR) in Gir Indicine cattle. In addition, we aim to identify signatures of selection, genes, and enriched regions between Gir subpopulations sorted by breeding value for these traits. The genotype fle contained 2093 animals and 420,718 SNP markers. Breeding values used to sort Gir animals were previously obtained. ROH and signature of selection analyses were performed using PLINK software, followed by ROH-based (FROH) and pedigree-based inbreeding (Fped) and a search for genes and their functions. An average of 50±8.59 ROHs were found per animal. ROHs were separated into classes according to size, ranging from 1 to 2 Mb (ROH1?2Mb: 58.17%), representing ancient inbreeding, ROH2?4Mb (22.74%), ROH4-8Mb (11.34%), ROH8-16Mb (5.51%), and ROH>16Mb (2.24%). Combining our results, we conclude that the increase in general FROH and Fped signifcantly decreases TO and VO; however, in diferent chromosomes traits can increase or decrease with FROH. In the analysis for signatures of selection, we identifed 15 genes from 47 signifcant genomic regions, indicating diferences in populations with high and low breeding value for the three traits. |
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Palavras-Chave: |
Homozigose; Ovócito. |
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Thesagro: |
Bovino; Embrião Animal; Gado Gir. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
LEADER 02311naa a2200277 a 4500
001 2152954
005 2023-08-22
008 2023 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s00335-023-09989-w$2DOI
100 1 $aROCHA, R. de F. B.
245 $aRuns of homozygosity and signatures of selection for number of oocytes and embryos in the Gir Indicine cattle.$h[electronic resource]
260 $c2023
520 $aRuns of homozygosity (ROH) and signatures of selection are the results of selection processes in livestock species that have been shown to afect several traits in cattle. The aim of the current work was to verify the profle of ROH and inbreeding depression in the number of total (TO) and viable oocytes (VO) and the number of embryos (EMBR) in Gir Indicine cattle. In addition, we aim to identify signatures of selection, genes, and enriched regions between Gir subpopulations sorted by breeding value for these traits. The genotype fle contained 2093 animals and 420,718 SNP markers. Breeding values used to sort Gir animals were previously obtained. ROH and signature of selection analyses were performed using PLINK software, followed by ROH-based (FROH) and pedigree-based inbreeding (Fped) and a search for genes and their functions. An average of 50±8.59 ROHs were found per animal. ROHs were separated into classes according to size, ranging from 1 to 2 Mb (ROH1?2Mb: 58.17%), representing ancient inbreeding, ROH2?4Mb (22.74%), ROH4-8Mb (11.34%), ROH8-16Mb (5.51%), and ROH>16Mb (2.24%). Combining our results, we conclude that the increase in general FROH and Fped signifcantly decreases TO and VO; however, in diferent chromosomes traits can increase or decrease with FROH. In the analysis for signatures of selection, we identifed 15 genes from 47 signifcant genomic regions, indicating diferences in populations with high and low breeding value for the three traits.
650 $aBovino
650 $aEmbrião Animal
650 $aGado Gir
653 $aHomozigose
653 $aOvócito
700 1 $aGARCIA, A. O.
700 1 $aOTTO, P. I.
700 1 $aSILVA, M. V. G. B.
700 1 $aMARTINS, M. F.
700 1 $aMACHADO, M. A.
700 1 $aPANETTO, J. C. do C.
700 1 $aGUIMARÃES, S. E. F.
773 $tMammalian Genome$gv. 34, p. 482-496, 2023.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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