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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
Data corrente: |
20/04/2006 |
Data da última atualização: |
17/01/2020 |
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
Autoria: |
NARCISO, M. G.; YAMAGISHI, M. E. B.; QUINALIA, T.; BEZERRA, G. B. P.; NESHICH, G. |
Afiliação: |
MARCELO GONCALVES NARCISO, CNPAF; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; THIAGO QUINALIA; GEORGE B. P. BEZERRA; GORAN NESHICH, CNPTIA. |
Título: |
2D maps of protein interface surfaces. |
Ano de publicação: |
2005 |
Fonte/Imprenta: |
In: X-MEETING; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 1., 2005, Caxambu. [Proceedings...]. [S.l.]: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2005. p. 1. |
Idioma: |
Inglês |
Notas: |
X-meeting 2005. Presented posters. |
Conteúdo: |
More than 50% of the Protein Data Bank - PDB - files have two or more chains. It is desirable to get a better understanding of how the protein complexes are gathered together. Although, surface complementarity is a key factor in complexes formation, physical-chemical properties also play an important role. Recently, the protein interface surfaces were rendered in 3D, and, over them, all the STING_DB physical-chemical properties could be painted, what greatly facilitated their analyses. In this work we propose an alternative way to visualize the protein interfaces. The 3D protein interface surfaces were modeled as Graphs and using the Shape Preserving algorithm, they were mapped onto the plane. This mapping introduce some inevitable deformation, nevertheless the local shape is preserved which is essential in the process of matching the corresponding regions in both surfaces. This matching task is almost impossible in 3D due the surface complexity in the space. |
Palavras-Chave: |
Bioinformática; Interface de superfícies; Mapa bidimensional. |
Thesagro: |
Mapa; Proteína. |
Thesaurus Nal: |
Bioinformatics. |
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
Marc: |
LEADER 01787nam a2200241 a 4500 001 1008757 005 2020-01-17 008 2005 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aNARCISO, M. G. 245 $a2D maps of protein interface surfaces.$h[electronic resource] 260 $aIn: X-MEETING; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 1., 2005, Caxambu. [Proceedings...]. [S.l.]: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2005. p. 1.$c2005 500 $aX-meeting 2005. Presented posters. 520 $aMore than 50% of the Protein Data Bank - PDB - files have two or more chains. It is desirable to get a better understanding of how the protein complexes are gathered together. Although, surface complementarity is a key factor in complexes formation, physical-chemical properties also play an important role. Recently, the protein interface surfaces were rendered in 3D, and, over them, all the STING_DB physical-chemical properties could be painted, what greatly facilitated their analyses. In this work we propose an alternative way to visualize the protein interfaces. The 3D protein interface surfaces were modeled as Graphs and using the Shape Preserving algorithm, they were mapped onto the plane. This mapping introduce some inevitable deformation, nevertheless the local shape is preserved which is essential in the process of matching the corresponding regions in both surfaces. This matching task is almost impossible in 3D due the surface complexity in the space. 650 $aBioinformatics 650 $aMapa 650 $aProteína 653 $aBioinformática 653 $aInterface de superfícies 653 $aMapa bidimensional 700 1 $aYAMAGISHI, M. E. B. 700 1 $aQUINALIA, T. 700 1 $aBEZERRA, G. B. P. 700 1 $aNESHICH, G.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Semiárido. |
Data corrente: |
17/12/2013 |
Data da última atualização: |
17/12/2013 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
Autoria: |
FERREIRA, G. de O.; NASCIMENTO, R. de C.; COSTA, S. R. da; NOGUEIRA, T. O.; SANTOS, C. A. F.; FLORI, J. E. |
Afiliação: |
GLEYCE DE OLIVEIRA FERREIRA, Estagiária da Embrapa Semiárido; REJANE DE CARVALHO NASCIMENTO, Estagiária da Embrapa Semiárido; SONIANE RODRIGUES DA COSTA, Doutoranda Universidade Estadual de Feira de Santana; THAIDES OLIVEIRA NOGUEIRA, Estagiário da Embrapa Semiárido; CARLOS ANTONIO FERNANDES SANTOS, CPATSA; JOSE EGIDIO FLORI, CPATSA. |
Título: |
Propagação vegetativa de plantas originadas do cruzamento entre Psidium guajava x Psidium guineense, resistentes a Meloidogyne enterolobii. |
Ano de publicação: |
2013 |
Fonte/Imprenta: |
In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 8., 2013, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2013. |
Páginas: |
p. 15-19. |
Série: |
(Embrapa Semiárido. Documentos, 253). |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
O objetivo do trabalho foi propagar, por meio de estaquia, o híbrido interespecífico Psidium guajava x Psidium guineense para ser usado como porta-enxerto em goiabeiras comerciais, suscetíveis a Meloidogyne enterolobii. As estacas semilenhosas foram submetidas à imersão da parte basal em solução de ácido indol-butírico (AIB), na concentração de 1.500 mg/L por 15 minutos. Após esse tratamento as estacas foram imediatamente colocadas para enraizar em caixas plásticas perfuradas contendo substrato comercial e permaneceram sob nebulização intermitente em casa de vegetação, por 60 dias, para evitar a desidratação e facilitar o enraizamento. Plantas com ótimo estádio vegetativo foram transplantadas para sacos plásticos perfurados contendo mistura de solo + esterco de curral + areia fina + substrato comercial na proporção 2:1:1:1. Observou-se que das 1.194 estacas, 680 apresentaram bom desenvolvimento vegetativo, proporcionando uma eficiência de 57% de pegamento. A aplicação de 1.500 mg/L de AIB para a propagação por estaquia do híbrido interespecífico proporcionou boa formação das mudas e ótimo desenvolvimento vegetativo. |
Palavras-Chave: |
Guava; Meloidogyne enterolobii; Porta-enxerto; Propagação. |
Thesagro: |
Goiaba; Nematóide; Psidium Guajava. |
Thesaurus NAL: |
Psidium guineense. |
Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/94239/1/SDC253.pdf
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Marc: |
LEADER 02147nam a2200289 a 4500 001 1974236 005 2013-12-17 008 2013 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aFERREIRA, G. de O. 245 $aPropagação vegetativa de plantas originadas do cruzamento entre Psidium guajava x Psidium guineense, resistentes a Meloidogyne enterolobii.$h[electronic resource] 260 $aIn: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 8., 2013, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido$c2013 300 $ap. 15-19. 490 $a(Embrapa Semiárido. Documentos, 253). 520 $aO objetivo do trabalho foi propagar, por meio de estaquia, o híbrido interespecífico Psidium guajava x Psidium guineense para ser usado como porta-enxerto em goiabeiras comerciais, suscetíveis a Meloidogyne enterolobii. As estacas semilenhosas foram submetidas à imersão da parte basal em solução de ácido indol-butírico (AIB), na concentração de 1.500 mg/L por 15 minutos. Após esse tratamento as estacas foram imediatamente colocadas para enraizar em caixas plásticas perfuradas contendo substrato comercial e permaneceram sob nebulização intermitente em casa de vegetação, por 60 dias, para evitar a desidratação e facilitar o enraizamento. Plantas com ótimo estádio vegetativo foram transplantadas para sacos plásticos perfurados contendo mistura de solo + esterco de curral + areia fina + substrato comercial na proporção 2:1:1:1. Observou-se que das 1.194 estacas, 680 apresentaram bom desenvolvimento vegetativo, proporcionando uma eficiência de 57% de pegamento. A aplicação de 1.500 mg/L de AIB para a propagação por estaquia do híbrido interespecífico proporcionou boa formação das mudas e ótimo desenvolvimento vegetativo. 650 $aPsidium guineense 650 $aGoiaba 650 $aNematóide 650 $aPsidium Guajava 653 $aGuava 653 $aMeloidogyne enterolobii 653 $aPorta-enxerto 653 $aPropagação 700 1 $aNASCIMENTO, R. de C. 700 1 $aCOSTA, S. R. da 700 1 $aNOGUEIRA, T. O. 700 1 $aSANTOS, C. A. F. 700 1 $aFLORI, J. E.
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Registro original: |
Embrapa Semiárido (CPATSA) |
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