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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pantanal. |
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Data corrente: |
07/10/2020 |
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Data da última atualização: |
09/10/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
MALOSSI, C. D.; FIORATTI, E. G.; CARDOSO, J. F.; MAGRO, A. J.; KROON, E. G.; AGUIAR, D. M. de; BORGES, A. M. C. M; NOGUEIRA, M. F.; ULLMANN, L. S.; ARAUJO JUNIOR, J. P. |
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Afiliação: |
CAMILA DANTAS MALOSSI, São Paulo State University (Unesp), Botucatu; EDUARDO GORZONI FIORATTI, Vales do Jequitinhonha e Mucuri Federal University (UFVJM); JEDSON FERREIRA CARDOSO, Evandro Chagas Institute, Ananindeua; ANGELO JOSE MAGRO, São Paulo State University, Unesp, Botucatu; ERNA GEESSIEN KROON, Universidade Federal de Minas Gerais; DANIEL MOURA DE AGUIAR, Mato Grosso Federal University, Cuiabá; ALICE MAMEDE COSTA MARQUE BORGES, Mato Grosso Federal University, Cuiabá; MARCIA FURLAN NOGUEIRA T DE LIMA, CPAP; LEILA SABRINA ULLMANN, São Paulo State University, Unesp; JOÃO PESSOA ARAUJO JUNIOR, São Paulo State University, Unesp. |
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Título: |
High genomic variability in Equine Infectious Anemia Virus obtained from naturally infected horses in Pantanal, Brazil: an endemic region case. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Viruses, v. 12, n. 2, 207, p. 1-15, 2020. |
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DOI: |
10.3390/v12020207 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Equine infectious anemia virus (EIAV) is a persistent lentivirus that causes equine infectiousanemia (EIA). In Brazil, EIAV is endemic in the Pantanal region, and euthanasia is not mandatory inthis area. All of the complete genomic sequences from field viruses are from North America, Asia, and Europe, and only proviral genomic sequences are available. Sequences from Brazilian EIAVare currently available only forgagand LTR regions. Thus, the present study aimed for the first time to sequence the entire EIAV genomic RNA in naturally infected horses from an endemic areain Brazil. RNA in plasma from naturally infected horses was used for next-generation sequencing(NGS), and gaps were filled using Sanger sequencing methodology. Complete viral genomes of EIAV from two horses were obtained and annotated (Access Number: MN560970 and MN560971). Putative genes were analyzed and compared with previously described genes, showing conservation in gag and pol genes and high variations in LTR and env sequences. Amino acid changes were identified in the p26 protein, one of the most common targets used for diagnosis, and p26 molecular modelling showed surface amino acid alterations in some epitopes. Brazilian genome sequences presented 88.6% nucleotide identity with one another and 75.8 to 77.3% with main field strains, such as EIAV Liaoning,Wyoming, Ireland, and Italy isolates. Furthermore, phylogenetic analysis suggested that this Brazilians train comprises a separate monophyletic group. These results may help to better characterize EIAV and to overcome the challenges of diagnosing and controlling EIA in endemic regions. MenosEquine infectious anemia virus (EIAV) is a persistent lentivirus that causes equine infectiousanemia (EIA). In Brazil, EIAV is endemic in the Pantanal region, and euthanasia is not mandatory inthis area. All of the complete genomic sequences from field viruses are from North America, Asia, and Europe, and only proviral genomic sequences are available. Sequences from Brazilian EIAVare currently available only forgagand LTR regions. Thus, the present study aimed for the first time to sequence the entire EIAV genomic RNA in naturally infected horses from an endemic areain Brazil. RNA in plasma from naturally infected horses was used for next-generation sequencing(NGS), and gaps were filled using Sanger sequencing methodology. Complete viral genomes of EIAV from two horses were obtained and annotated (Access Number: MN560970 and MN560971). Putative genes were analyzed and compared with previously described genes, showing conservation in gag and pol genes and high variations in LTR and env sequences. Amino acid changes were identified in the p26 protein, one of the most common targets used for diagnosis, and p26 molecular modelling showed surface amino acid alterations in some epitopes. Brazilian genome sequences presented 88.6% nucleotide identity with one another and 75.8 to 77.3% with main field strains, such as EIAV Liaoning,Wyoming, Ireland, and Italy isolates. Furthermore, phylogenetic analysis suggested that this Brazilians train comprises a separate monophyletic group. Th... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Anemia Infecciosa; Doença Animal; Eqüino; Vírus. |
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Thesaurus Nal: |
Endemic diseases; Equine infectious anemia virus. |
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Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/216482/1/HighGenomicVariability-2020.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pantanal (CPAP) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
19/02/2009 |
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Data da última atualização: |
06/07/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
Internacional - A |
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Autoria: |
CRUZ, J. L.; PELACANI, C. R.; ARAÚJO, W. L. |
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Afiliação: |
Jailson Lopes Cruz, CNPMF; Claudinéia Regina Pelacani, UEFS; Wagner Luiz Araújo, UFV. |
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Título: |
Influência do nitrato e do amônio sobre a fotossíntese e a concentração de compostos nitrogenadas em mandioca. |
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Ano de publicação: |
2008 |
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Fonte/Imprenta: |
Ciência Rural, Santa Maria, RS, v. 38, n. 3, p. 643-649, mai./jun. 2008. |
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ISSN: |
0103-8478 |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Disponível em: http://www.scielo.br/pdf/cr/v38n3/a08v38n3.pdf
Acesso em: 19 fev. 2009. |
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Conteúdo: |
Plantas de mandioca (Manihot esculenta Crantz) apresentam redução no acúmulo de matéria seca quando cultivadas com altos níveis de amônio na solução do solo. A razão para esse efeito do amônio ainda permanece pouco estudada. O presente trabalho foi desenvolvido visando avaliar a influência do NO3- e do NH4+ sobre alguns aspectos relacionados à fotossíntese e à concentração de alguns compostos nitrogenados em plantas de mandioca. Para esse estudo, utilizou-se a variedade Cigana Preta, que foi cultivada em solução nutritiva, tendo areia grossa lavada como substrato. Os tratamentos consistiram de três proporções entre NO3-:NH4+, em mM (12:0, 6:6, e 0:12). Plantas cultivadas apenas com NO3- ou com NO3- + NH4+ não apresentaram diferenças na taxa fotosssintética. No entanto, observou-se redução desse evento quando o NH4+ foi a única fonte nitrogenada. O valor da condutância estomática obtido para as plantas cultivadas apenas com NO3- foi de 0,49mol m-²s-¹, enquanto que para as plantas cultivadas apenas com NH4+, o valor foi de apenas 0,16mol m-²s-¹ (três vezes menor). Não houve diferenças significativas na concentração foliar de amônio livre, sugerindo não ter ocorrido efeito tóxico direto do NH4+ sobre a fotossíntese. A concentração de proteínas foi maior para as plantas cultivadas apenas com NH4+. Os resultados sugerem que o menor acúmulo de matéria seca das plantas de mandioca cultivadas exclusivamente com NH4+ é decorrente, dentre outros fatores, do efeito desse íon sobre a atividade fotosssintética, em virtude, principalmente, de sua ação negativa sobre a condutância estomática. MenosPlantas de mandioca (Manihot esculenta Crantz) apresentam redução no acúmulo de matéria seca quando cultivadas com altos níveis de amônio na solução do solo. A razão para esse efeito do amônio ainda permanece pouco estudada. O presente trabalho foi desenvolvido visando avaliar a influência do NO3- e do NH4+ sobre alguns aspectos relacionados à fotossíntese e à concentração de alguns compostos nitrogenados em plantas de mandioca. Para esse estudo, utilizou-se a variedade Cigana Preta, que foi cultivada em solução nutritiva, tendo areia grossa lavada como substrato. Os tratamentos consistiram de três proporções entre NO3-:NH4+, em mM (12:0, 6:6, e 0:12). Plantas cultivadas apenas com NO3- ou com NO3- + NH4+ não apresentaram diferenças na taxa fotosssintética. No entanto, observou-se redução desse evento quando o NH4+ foi a única fonte nitrogenada. O valor da condutância estomática obtido para as plantas cultivadas apenas com NO3- foi de 0,49mol m-²s-¹, enquanto que para as plantas cultivadas apenas com NH4+, o valor foi de apenas 0,16mol m-²s-¹ (três vezes menor). Não houve diferenças significativas na concentração foliar de amônio livre, sugerindo não ter ocorrido efeito tóxico direto do NH4+ sobre a fotossíntese. A concentração de proteínas foi maior para as plantas cultivadas apenas com NH4+. Os resultados sugerem que o menor acúmulo de matéria seca das plantas de mandioca cultivadas exclusivamente com NH4+ é decorrente, dentre outros fatores, do efeito desse íon sobre a at... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Assimilação do CO2; Transpiração. |
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Thesagro: |
Nitrogênio; Proteína. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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500 $aDisponível em: http://www.scielo.br/pdf/cr/v38n3/a08v38n3.pdf Acesso em: 19 fev. 2009.
520 $aPlantas de mandioca (Manihot esculenta Crantz) apresentam redução no acúmulo de matéria seca quando cultivadas com altos níveis de amônio na solução do solo. A razão para esse efeito do amônio ainda permanece pouco estudada. O presente trabalho foi desenvolvido visando avaliar a influência do NO3- e do NH4+ sobre alguns aspectos relacionados à fotossíntese e à concentração de alguns compostos nitrogenados em plantas de mandioca. Para esse estudo, utilizou-se a variedade Cigana Preta, que foi cultivada em solução nutritiva, tendo areia grossa lavada como substrato. Os tratamentos consistiram de três proporções entre NO3-:NH4+, em mM (12:0, 6:6, e 0:12). Plantas cultivadas apenas com NO3- ou com NO3- + NH4+ não apresentaram diferenças na taxa fotosssintética. No entanto, observou-se redução desse evento quando o NH4+ foi a única fonte nitrogenada. O valor da condutância estomática obtido para as plantas cultivadas apenas com NO3- foi de 0,49mol m-²s-¹, enquanto que para as plantas cultivadas apenas com NH4+, o valor foi de apenas 0,16mol m-²s-¹ (três vezes menor). Não houve diferenças significativas na concentração foliar de amônio livre, sugerindo não ter ocorrido efeito tóxico direto do NH4+ sobre a fotossíntese. A concentração de proteínas foi maior para as plantas cultivadas apenas com NH4+. Os resultados sugerem que o menor acúmulo de matéria seca das plantas de mandioca cultivadas exclusivamente com NH4+ é decorrente, dentre outros fatores, do efeito desse íon sobre a atividade fotosssintética, em virtude, principalmente, de sua ação negativa sobre a condutância estomática.
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773 $tCiência Rural, Santa Maria, RS$gv. 38, n. 3, p. 643-649, mai./jun. 2008.
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