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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
08/03/2023 |
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Data da última atualização: |
08/03/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BUSS, C. E.; AFONSO, J.; OLIVEIRA, P. S. N. DE; PETRINI, J.; TIZIOTO, P. C.; CESAR, A. S. M.; GUSTANI-BUSS, E. C.; CARDOSO, T. F.; ROVADOSKI, G. A.; DINIZ, W. J. DA S.; LIMA, A. O. DE; ROCHA, M. I. P.; ANDRADE, B. G. N.; WOLF, J. B.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; REGITANO, L. C. de A. |
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Afiliação: |
CARLOS EDUARDO BUSS, Federal University of São Carlos; JULIANA AFONSO; PRISCILA S. N. DE OLIVEIRA, Federal University of São Carlos; JULIANA PETRINI, University of São Paulo/ESALQ, Piracicaba; POLYANA CRISTINE TIZIOTO, NGS Soluções Genômicas; ALINE S. M. CESAR, University of São Paulo/ESALQ; EMANUELE CRISTINA GUSTANI-BUSS, Mindflow Genomics, Leuven, Flanders, Belgium.; TAINÃ FIGUEIREDO CARDOSO; GREGORI A. ROVADOSKI, University of São Paulo/ESALQ; WELLISON JARLES DA SILVA DINIZ, Auburn University; ANDRESSA OLIVEIRA DE LIMA, University of Washington; MARINA IBELLI PEREIRA ROCHA, Federal University of São Carlos; BRUNO GABRIEL NASCIMENTO ANDRADE, Munster Technological University/MTU; JASON B. WOLF, University of Bath; LUIZ LEHMANN COUTINHO, University of São Paulo/ESALQ; GERSON BARRETO MOURÃO, University of São Paulo/ESALQ; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
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Título: |
Bivariate GWAS reveals pleiotropic regions among feed efficiency and beef quality-related traits in Nelore cattle. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Mammalian Genome, v. 34, p. 90-103, dec. 2022. |
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DOI: |
10.1007/s00335-022-09969-6 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Feed-efcient cattle selection is among the most leading solutions to reduce cost for beef cattle production. However, technical difculties in measuring feed efciency traits had limited the application in livestock. Here, we performed a Bivariate Genome-Wide Association Study (Bi-GWAS) and presented candidate biological mechanisms underlying the association between feed efciency and meat quality traits in a half-sibling design with 353 Nelore steers derived from 34 unrelated sires. A total of 13 Quantitative Trait Loci (QTL) were found explaining part of the phenotypic variations. An important transcription factor of adipogenesis in cattle, the TAL1 (rs133408775) gene located on BTA3 was associated with intramuscular fat and average daily gain (IMF-ADG), and a region located on BTA20, close to CD180 and MAST4 genes, both related to fat accumulation. We observed a low positive genetic correlation between IMF-ADG (r=0.30±0.0686), indicating that it may respond to selection in the same direction. Our fndings contributed to clarifying the pleiotropic modulation of the complex traits, indicating new QTLs for bovine genetic improvement. |
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Palavras-Chave: |
Bi GWAS; Efciency and meat quality; Phenotypic variations; Pleiotropic modulation; QTL. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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001 2152195
005 2023-03-08
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520 $aFeed-efcient cattle selection is among the most leading solutions to reduce cost for beef cattle production. However, technical difculties in measuring feed efciency traits had limited the application in livestock. Here, we performed a Bivariate Genome-Wide Association Study (Bi-GWAS) and presented candidate biological mechanisms underlying the association between feed efciency and meat quality traits in a half-sibling design with 353 Nelore steers derived from 34 unrelated sires. A total of 13 Quantitative Trait Loci (QTL) were found explaining part of the phenotypic variations. An important transcription factor of adipogenesis in cattle, the TAL1 (rs133408775) gene located on BTA3 was associated with intramuscular fat and average daily gain (IMF-ADG), and a region located on BTA20, close to CD180 and MAST4 genes, both related to fat accumulation. We observed a low positive genetic correlation between IMF-ADG (r=0.30±0.0686), indicating that it may respond to selection in the same direction. Our fndings contributed to clarifying the pleiotropic modulation of the complex traits, indicating new QTLs for bovine genetic improvement.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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| Registros recuperados : 138 | |
| 8. |  | MUDADO, M. de A.; REGITANO, L. C. de A.; SIQUEIRA, F.; ROSA, A. do N.; HIGA, R.; TIZIOTO, P. C. Finding a minimal set of SNPs for paternity identification in Nelore cattle. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 7.; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE IBEROAMERICAN SOCIETY FOR BIOINFORMATICS, 3., 2011, Florianópolis. Proceedings... Florianópolis: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2011. Não paginado. X-MEETING, 2011.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Corte. |
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| 9. | | BRESSANI, F. A.; TIZIOTO, P. C.; VIEIRA, L.; ZAROS, L. G.; MEIRELLES, S. L.; REGITANO, L. C. de A. Prospecção de SNPs no gene TNFa e sua possível associação à verminose gastrintestinal em caprinos. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 9., 2012, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBMA, 2012. 3 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 10. | | ROSA, K. de O. da; TIZIOTO, P. C.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; REGITANO, L. C. de A. Seleção de genes candidatos a referência para estudos de expressão gênica por meio de análises de RNA-Seq e qPCR. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 6., 2014, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2014. p. 27. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 57) Editores técnicos: João de Mendonça Naime, Caue Ribeiro, Maria Alice Martins, Elaine Cristina Paris, Paulino Ribeiro Villas Boas, Ladislau Marcelino Rabello.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 11. | | GOUVEIA, J. J. S.; SANTIAGO, A. C.; IBELLI, A. M. G.; TIZIOTO, P. C.; ESTEVES, S. N.; BARIONI JUNIOR, W.; REGITANO, L. C. de A. Associação entre microssatélite localizado no cromossomo OAR3 e peso ao abate de ovinos pertencentes a três grupos genéticos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 54., 2008, Salvador. Resumos... Salvador: SBG, 2008 p. 214| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 12. | | TIZIOTO, P. C.; VENERONI, G. B.; MEIRELLES, S. L.; GASPARIN, G.; IBELLI, A. M. G.; OLIVIERA, H. N.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A. Associação entre polimorfismos de única base (SNP) dos genes PPARGC1A e PSMC1 com espessura de gordura subcutânea em animais da raça Canchim. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 55., 2009, Águas de Lindóia. Anais... Águas de Lindóia: SBG, 2009. p. 210.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 15. | | DINIZ, W. J. da S.; TIZIOTO, P. C.; MOKRY, F. B.; MUDADU, M. de A.; SOUZA, M. M. de; REGITANO, L. C. de A. Análise de haplótipos em QTL associado ao conteúdo de ferro no músculo de bovinos Nelore. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 6., 2014, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2014. p. 28. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 57) Editores técnicos: João de Mendonça Naime, Caue Ribeiro, Maria Alice Martins, Elaine Cristina Paris, Paulino Ribeiro Villas Boas, Ladislau Marcelino Rabello.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 16. | | SERRA, V.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LIMA, A. O. de; GASPARIN, G.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; REGITANO, L. C. de A. Análise de qualidade de RNA para estudo do perfil transcriptômico de animais extremos para eficiência alimentar da raça Nelore. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 5., 2013, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste: Embrapa Instrumentação , 2013. p. 12 (Embrapa Pecuária Sudeste. Documentos, 110). Editado por Ana Rita de Araújo nogueira, simone Cristina Méo Nicura| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 17. | | BRESSANI, F. A.; TIZIOTO, P. C.; ROCHA, M. I. P.; IBELLI, A. M. G.; NICIURA, S. C. M.; REGITANO, L. C. de A. Comparação de diferentes protocolos para visualização de DNA separado por eletroforese em gel de agarose utilizando-se os corantes fluorescentes brometo de etídeo e GelRedr. In: ENCONTRO NACIONAL SOBRE MÉTODOS DOS LABORATÓRIOS DA EMBRAPA, 15., 2010, Pelotas, RS. Novas perspectivas para os laboratórios da Embrapa. Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 18. | | VENERONI-GOUVEIA, G.; TIZIOTO, P. C.; MEIRELLES, S. L. C.; SANTIAGO, A. C.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A. Candidate genes for carcass traits in a tropical-adapted Brazilian composite beef breed. Genetics and Molecular Research, v. 14, n. 4, p. 16667-16674, 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 19. | | VERERONI, G. B.; MEIRELLES, S. L.; IBELLI, A. M. M.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, H. N.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A. Um SNP do gene PSMC1 não afeta a variação da espessura de gordura subcutânea, área de olho de lombo e peso aos 18 meses em bovinos da raça Canchim. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA SÃO CARLOS, 2009, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Pecuária Sudeste: Embrapa Instrumentação Agropecuária, 2009. p. 25. (Embrapa Pecuária Sudeste. Documentos, 90).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 20. | | OLIVEIRA, P. S. N. de; TIZIOTO, P. C.; NORONHA, C. T.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A. A SNP in NEUROD1 is associated with production traits in Nelore beef cattle. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 51., 2014, Barra dos Coqueiros. A produção animal frente às mudanças climáticas e tecnológicas - anais. Barra dos coqueiros: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2014. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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