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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Uva e Vinho. |
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Data corrente: |
12/01/2017 |
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Data da última atualização: |
27/11/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
SOUZA, E. B. de. |
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Afiliação: |
Elen Bonilha de Souza. |
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Título: |
Caracterização biológica e molecular de isolados de Apple stem grooving virus e construção de um clone infeccioso. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
2016. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Tese (Doutorado em Fitossanidade) - Universidade Federal de Pelotas, Programa de pós-graduação em Fitossanidade. Orientador: Profª. Dra. Danielle Ribeiro de Barros Coorientadores: Dr. Osmar Nickel e Dr. Cesar Bauer Gomes |
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Conteúdo: |
O Apple stem grooving virus (ASGV), espécie tipo do gênero Capillovirus, é conhecido como um vírus latente causador do acanelamento do lenho da macieira, devido ao principal sintoma observado em espécies suscetíveis, infecção podendo levar à perda de qualidade de frutos e queda na produtividade. O vírus já foi diagnosticado em diversas partes do mundo e atualmente, existem depositados no GenBank, dezoito sequências de genomas completos de isolados de ASGV, e várias sequências parciais principalmente da região da capa proteica. O presente trabalho está dividido em dois capítulos. O capítulo l teve como objetivo a caracterização biológica e molecular de dois isolados de ASGV (M219-3 e M220), e de forma mais específica, a clonagem e sequenciamento do genoma completo dos mesmos e a análise filogenética em comparação com demais sequências disponíveis. Os fragmentos foram amplificados por RT-PCR, clonados, sequenciados e analisados com os programas Clustal W e Lasergene. O capítulo ll teve como objetivo a construção de um clone infeccioso, a partir do isolado M220, utilizando-se a técnica Gibson Assembly. Ambos isolados apresentaram-se de forma similar quanto a expressão de sintomas morfológicos. Os resultados obtidos permitiram a obtenção das primeiras sequências genômicas completas de isolados brasileiros de ASGV, bem como a construção de um clone infeccioso. A identidade entre M219-3 e M220 foi de 92.2%, quando comparada a sequência de nucleotídeos, e 95.3% e 93.3%, quando comparadas as sequencias de aminoácidos da proteína de movimento e capsídeo, respectivamente. A análise filogenética da proteína de movimento dos isolados com as sequências depositadas determinou dois grupos distintos quanto ao hospedeiro. M219-3 e M220 agruparam-se juntamente com isolados cujo os hospedeiros eram predominantemente maça e pera. Dada a relevância da infecção causada por esse vírus, o trabalho contribuirá para estudos da variabilidade genética dessa espécie viral, bem como para a elucidação da associação do ASGV com a patologia já relatada na literatura. MenosO Apple stem grooving virus (ASGV), espécie tipo do gênero Capillovirus, é conhecido como um vírus latente causador do acanelamento do lenho da macieira, devido ao principal sintoma observado em espécies suscetíveis, infecção podendo levar à perda de qualidade de frutos e queda na produtividade. O vírus já foi diagnosticado em diversas partes do mundo e atualmente, existem depositados no GenBank, dezoito sequências de genomas completos de isolados de ASGV, e várias sequências parciais principalmente da região da capa proteica. O presente trabalho está dividido em dois capítulos. O capítulo l teve como objetivo a caracterização biológica e molecular de dois isolados de ASGV (M219-3 e M220), e de forma mais específica, a clonagem e sequenciamento do genoma completo dos mesmos e a análise filogenética em comparação com demais sequências disponíveis. Os fragmentos foram amplificados por RT-PCR, clonados, sequenciados e analisados com os programas Clustal W e Lasergene. O capítulo ll teve como objetivo a construção de um clone infeccioso, a partir do isolado M220, utilizando-se a técnica Gibson Assembly. Ambos isolados apresentaram-se de forma similar quanto a expressão de sintomas morfológicos. Os resultados obtidos permitiram a obtenção das primeiras sequências genômicas completas de isolados brasileiros de ASGV, bem como a construção de um clone infeccioso. A identidade entre M219-3 e M220 foi de 92.2%, quando comparada a sequência de nucleotídeos, e 95.3% e 93.3%, quando comp... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
ASGV-sequenciamento; Capillovirus Betaflexiviridae; CDNA; Gibson Assembly. |
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Thesagro: |
Malus Domestica. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/153271/1/TESE-Souza-Elen-Bonilha-Versao-Defesal-11.08.-2016.pdf
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Marc: |
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520 $aO Apple stem grooving virus (ASGV), espécie tipo do gênero Capillovirus, é conhecido como um vírus latente causador do acanelamento do lenho da macieira, devido ao principal sintoma observado em espécies suscetíveis, infecção podendo levar à perda de qualidade de frutos e queda na produtividade. O vírus já foi diagnosticado em diversas partes do mundo e atualmente, existem depositados no GenBank, dezoito sequências de genomas completos de isolados de ASGV, e várias sequências parciais principalmente da região da capa proteica. O presente trabalho está dividido em dois capítulos. O capítulo l teve como objetivo a caracterização biológica e molecular de dois isolados de ASGV (M219-3 e M220), e de forma mais específica, a clonagem e sequenciamento do genoma completo dos mesmos e a análise filogenética em comparação com demais sequências disponíveis. Os fragmentos foram amplificados por RT-PCR, clonados, sequenciados e analisados com os programas Clustal W e Lasergene. O capítulo ll teve como objetivo a construção de um clone infeccioso, a partir do isolado M220, utilizando-se a técnica Gibson Assembly. Ambos isolados apresentaram-se de forma similar quanto a expressão de sintomas morfológicos. Os resultados obtidos permitiram a obtenção das primeiras sequências genômicas completas de isolados brasileiros de ASGV, bem como a construção de um clone infeccioso. A identidade entre M219-3 e M220 foi de 92.2%, quando comparada a sequência de nucleotídeos, e 95.3% e 93.3%, quando comparadas as sequencias de aminoácidos da proteína de movimento e capsídeo, respectivamente. A análise filogenética da proteína de movimento dos isolados com as sequências depositadas determinou dois grupos distintos quanto ao hospedeiro. M219-3 e M220 agruparam-se juntamente com isolados cujo os hospedeiros eram predominantemente maça e pera. Dada a relevância da infecção causada por esse vírus, o trabalho contribuirá para estudos da variabilidade genética dessa espécie viral, bem como para a elucidação da associação do ASGV com a patologia já relatada na literatura.
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Registro original: |
Embrapa Uva e Vinho (CNPUV) |
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| Registros recuperados : 83 | |
| 8. |  | IKUMA, E. S.; AOKI, R. T.; SOUZA, E. B. de; KOMEGAWA, E. O.; SONEGO, O. R. Avaliação do controle químico das doenças foliares na cultura do trigo. In: REUNIÃO DA COMISSÃO CENTRO-SUL-BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO, 3., 1987, Cascavel. Resultados de pesquisa com trigo - 1986. Dourados: EMBRAPA-UEPAE Dourados, 1987. p. 116-118. (EMBRAPA-UEPAE Dourados. Documentos, 28). Projeto 004.82.034-6 - Avaliação de fungicidas no controle das ferrugens do trigo.| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 11. | | SOUSA, P. G.; SOARES SOBRINHO, J.; LUIZ, A. J. B.; RUMIATTO, M.; SOUZA, E. B. de. Cultivares de trigo em nível estadual de experimentação. In: REUNIÃO DA COMISSÃO CENTRO-SUL-BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO, 5., 1989, Cornélio Procópio. Resultados de pesquisa com trigo - 1988. Dourados: EMBRAPA-UEPAE Dourados, 1989. p. 31-34. (EMBRAPA-UEPAE Dourados. Documentos, 39). Projeto 004.87.0116-8 - Competição de cultivares de trigo na Região Sul de Mato Grosso do Sul.| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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| 13. | | SOUSA, P. G.; SOARES SOBRINHO, J.; LUIZ, A. J. B.; RUMIATTO, M.; SOUZA, E. B. de. Linhagens e cultivares de trigo em nível final de experimentação. In: REUNIÃO DA COMISSÃO CENTRO-SUL-BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO, 5., 1989, Cornélio Procópio. Resultados de pesquisa com trigo - 1988. Dourados: EMBRAPA-UEPAE Dourados, 1989. p. 35-43. (EMBRAPA-UEPAE Dourados. Documentos, 39). Projeto 004.87.016-8 - Competição de cultivares de trigo na Região Sul de Mato Grosso do Sul.| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 14. | | SOUSA, P. G.; SOARES SOBRINHO, J.; LUIZ, A. J. B.; RUMIATTO, M.; SOUZA, E. B. de. Linhagens de trigo em nível intermediário de experimentação. In: REUNIÃO DA COMISSÃO CENTRO-SUL-BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO, 5., 1989, Cornélio Procópio. Resultados de pesquisa com trigo - 1988. Dourados: EMBRAPA-UEPAE Dourados, 1989. p. 44-54. (EMBRAPA-UEPAE Dourados. Documentos, 39). Projeto 004.87.016-8 - Competição de cultivares de trigo na Região Sul de Mato Grosso do Sul.| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 18. | | ALBUQUERQUE, G. M. R.; FONSECA, M. E. N.; BOITEUX, L. S.; LOPES, C. A.; SOUZA, E. B. Análise do perfil de DEGS obtidos via RNASeq associados à suplantação da resistência de 'Hawaii 7996' por isolado brasileiro de Ralstonia pseudosolanacearum. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 51., 2019, Recife. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Fitopatologia, 2019. p. 742. Resumo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 19. | | OLIVEIRA, J. C.; ALBUQUERQUE, G. M. R.; XAVIER, A. S.; MARIANO, R. L. R.; SUASSUNA, N. D.; SOUZA, E. B. Characterization of xanthomonas citri subsp. malvacearum causing cotton angular leaf spot in Brazil. Journal of Plant Pathology, v. 93, n. 3, p. 707-712, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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