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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Uva e Vinho. |
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Data corrente: |
03/01/2019 |
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Data da última atualização: |
27/04/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
VALENTE, J. B.; PEREIRA, F. S.; STEMPKOWSKI, L. A.; FARIAS, M.; KUHNEM, P.; LAU, D.; FAJARDO, T. V. M.; NHANI JUNIOR, A.; CASA, R. T.; BOGO, A.; SILVA, F. N. da. |
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Afiliação: |
J. B. VALENTE, Crop Production Graduate Program, Santa Catarina State University/UDESC, Lages, SC 88520-000; F. S. Pereira, Crop Production Graduate Program, Santa Catarina State University/UDESC, Lages, SC 88520-000; L. A. Stempkowski, Crop Production Graduate Program, Santa Catarina State University/UDESC, Lages, SC 88520-000; M. Farias, Crop Production Graduate Program, Santa Catarina State University/UDESC, Lages, SC 88520-000; P. Kuhnem, Biotrigo Gen etica, Passo Fundo, RS 99052-160; DOUGLAS LAU, CNPT; THOR VINICIUS MARTINS FAJARDO, CNPUV; ANTONIO NHANI JUNIOR, CNPTIA; R. T. CASA, Crop Production Graduate Program, Santa Catarina State University/UDESC, Lages, SC 88520-000; A. Bogo, Crop Production Graduate Program, Santa Catarina State University/UDESC, Lages, SC 88520-000; F. N. da Silva, Crop Production Graduate Program, Santa Catarina State University/UDESC, Lages, SC 88520-000. |
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Título: |
A novel putative member of the family Benyviridae is associated with soilborne wheat mosaic disease in Brazil. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Plant Pathology, First online, 2018. |
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DOI: |
10.1111/ppa.12970 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
DIsponível em: |
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Conteúdo: |
Soilborne wheat mosaic disease (SBWMD), originally attributed to infections by Soilborne wheat mosaic virus (SBWMV) and Wheat spindle streak mosaic virus (WSSMV), is one of the most frequent virus diseases and causes economic losses in wheat in southern Brazil. This study aimed to characterize molecularly the viral species associated with wheat plants showing mosaic symptoms in Brazil. Wheat leaves and stems displaying mosaic symptoms were collected from different wheat cultivars in Passo Fundo municipality, Rio Grande do Sul State, southern Brazil. Double-stranded RNA was extracted and submitted to cDNA library synthesis and next-generation sequencing. No sequences of SBWMV and WSSMV were detected but the complete genome sequence of a putative new member of the family Benyviridae was determined, for which the name wheat stripe mosaic virus (WhSMV) is proposed. WhSMV has a bipartite genome with RNA 1 and RNA 2 organization similar to that of viruses belonging to Benyviridae . WhSMV RNA 1 has a single open reading frame (ORF) encoding a polyprotein with putative viral replicase function. WhSMV RNA 2 has six ORFs encoding the coat protein, the major protein (read-through), triple gene block movement proteins (TGB 1, 2 and 3) and ORF 6 (hypothetical protein). In addition to the genomic organization and nucleotide and amino acid sequence identi- ties, phylogenetic analyses also corroborated that WhSMV is a virus species of the Benyviridae . However, isolates of WhSMV formed a clade distinct from members of the genus Benyvirus . It was also demonstrated that the plasmodio- phorid Polymyxa graminis is associated with wheat roots showing SBWMD symptoms and infected by WhSMV. Keywords: Benyviridae , mosaic symptoms, next-generation sequencing, Polymyxa graminis , Triticum aestivum , wheat stripe mosaic virus MenosSoilborne wheat mosaic disease (SBWMD), originally attributed to infections by Soilborne wheat mosaic virus (SBWMV) and Wheat spindle streak mosaic virus (WSSMV), is one of the most frequent virus diseases and causes economic losses in wheat in southern Brazil. This study aimed to characterize molecularly the viral species associated with wheat plants showing mosaic symptoms in Brazil. Wheat leaves and stems displaying mosaic symptoms were collected from different wheat cultivars in Passo Fundo municipality, Rio Grande do Sul State, southern Brazil. Double-stranded RNA was extracted and submitted to cDNA library synthesis and next-generation sequencing. No sequences of SBWMV and WSSMV were detected but the complete genome sequence of a putative new member of the family Benyviridae was determined, for which the name wheat stripe mosaic virus (WhSMV) is proposed. WhSMV has a bipartite genome with RNA 1 and RNA 2 organization similar to that of viruses belonging to Benyviridae . WhSMV RNA 1 has a single open reading frame (ORF) encoding a polyprotein with putative viral replicase function. WhSMV RNA 2 has six ORFs encoding the coat protein, the major protein (read-through), triple gene block movement proteins (TGB 1, 2 and 3) and ORF 6 (hypothetical protein). In addition to the genomic organization and nucleotide and amino acid sequence identi- ties, phylogenetic analyses also corroborated that WhSMV is a virus species of the Benyviridae . However, isolates of WhSMV formed a cl... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Benyviridae; Mosaic symptoms; Next-generation sequencing; Wheat stripe mosaic virus. |
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Thesagro: |
Polymyxa Graminis; Triticum Aestivum. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 02870naa a2200337 a 4500
001 2102942
005 2019-04-27
008 2018 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1111/ppa.12970$2DOI
100 1 $aVALENTE, J. B.
245 $aA novel putative member of the family Benyviridae is associated with soilborne wheat mosaic disease in Brazil.$h[electronic resource]
260 $c2018
500 $aDIsponível em: <https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/ppa.12970>
520 $aSoilborne wheat mosaic disease (SBWMD), originally attributed to infections by Soilborne wheat mosaic virus (SBWMV) and Wheat spindle streak mosaic virus (WSSMV), is one of the most frequent virus diseases and causes economic losses in wheat in southern Brazil. This study aimed to characterize molecularly the viral species associated with wheat plants showing mosaic symptoms in Brazil. Wheat leaves and stems displaying mosaic symptoms were collected from different wheat cultivars in Passo Fundo municipality, Rio Grande do Sul State, southern Brazil. Double-stranded RNA was extracted and submitted to cDNA library synthesis and next-generation sequencing. No sequences of SBWMV and WSSMV were detected but the complete genome sequence of a putative new member of the family Benyviridae was determined, for which the name wheat stripe mosaic virus (WhSMV) is proposed. WhSMV has a bipartite genome with RNA 1 and RNA 2 organization similar to that of viruses belonging to Benyviridae . WhSMV RNA 1 has a single open reading frame (ORF) encoding a polyprotein with putative viral replicase function. WhSMV RNA 2 has six ORFs encoding the coat protein, the major protein (read-through), triple gene block movement proteins (TGB 1, 2 and 3) and ORF 6 (hypothetical protein). In addition to the genomic organization and nucleotide and amino acid sequence identi- ties, phylogenetic analyses also corroborated that WhSMV is a virus species of the Benyviridae . However, isolates of WhSMV formed a clade distinct from members of the genus Benyvirus . It was also demonstrated that the plasmodio- phorid Polymyxa graminis is associated with wheat roots showing SBWMD symptoms and infected by WhSMV. Keywords: Benyviridae , mosaic symptoms, next-generation sequencing, Polymyxa graminis , Triticum aestivum , wheat stripe mosaic virus
650 $aPolymyxa Graminis
650 $aTriticum Aestivum
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700 1 $aBOGO, A.
700 1 $aSILVA, F. N. da
773 $tPlant Pathology, First online, 2018.
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Registro original: |
Embrapa Uva e Vinho (CNPUV) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 93 | |
| 81. |  | BRUNES, L. C.; MAGNABOSCO, C. de U.; BALDI REY, F. S.; QUEIROZ, L. C. R. de; SANTOS, M. F. dos; CROZARA, A. S.; CASTRO, L. M. de; SILVA, F. N. O. da. Tendências genéticas para características associadas a habilidade materna em bovinos da raça Nelore sob seleção para precocidade sexual. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROMETEOROLOGIA, 20., SIMPÓSIO DE MUDANÇAS CLIMÁTICAS E DESERTIFICAÇÃO NO SEMIÁRIDO BRASILEIRO, 5., 2017, Juazeiro. A agrometeorologia na solução de problemas multiescala: anais. Juazeiro: Sociedade Brasileira de Agrometeorologia, 2017.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 82. | | QUEIROZ, L. C. R. de; BRUNES, L. C.; MAGNABOSCO, C. de U.; BALDI REY, F. S.; CROZARA, A. S.; CASTRO, L. M. de; SILVA, F. N. O. da; SANTOS, M. F. dos. Tendências genéticas para características de composição de carcaça em bovinos da raça Nelore sob seleção para precocidade sexual. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROMETEOROLOGIA, 20., SIMPÓSIO DE MUDANÇAS CLIMÁTICAS E DESERTIFICAÇÃO NO SEMIÁRIDO BRASILEIRO, 5., 2017, Juazeiro. A agrometeorologia na solução de problemas multiescala: anais. Juazeiro: Sociedade Brasileira de Agrometeorologia, 2017.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 83. | | QUEIROZ, L. C. R. de; BRUNES, L. C.; MAGNABOSCO, C. de U.; COSTA, M. F. O. e; BALDI REY, F. S.; CASTRO, L. M. de; SANTOS, M. F. dos; SILVA, F. N. O. da. Tendências genéticas e fenotipicas para características de carcaça em bovinos da raça nelore sob seleção para precocidade sexual. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 27., 2017, Santos. Anais [eletrônicos]... Brasília, DF: Associação Brasileira de Zootecnistas, 2017. Zootec.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 84. | | QUEIROZ, L. C. R. de; BRUNES, L. C.; MAGNABOSCO, C. de U.; COSTA, M. F. O. e; BALDI REY, F. S.; CASTRO, L. M. de; SANTOS, M. F. dos; SILVA, F. N. O. da. Tendências genéticas e fenotipicas para características de carcaça em bovinos da raça nelore sob seleção para precocidade sexual. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 27., 2017, Santos. Anais [eletrônicos]... Brasília, DF: Associação Brasileira de Zootecnistas, 2017. Zootec.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 85. | | QUEIROZ, L. C. R. de; BRUNES, L. C.; MAGNABOSCO, C. de U.; COSTA, M. F. O. e; BALDI REY, F. S.; CASTRO, L. M. de; SANTOS, M. F. dos; SILVA, F. N. O. da. Tendências genéticas e fenotípicas para perímetro escrotal e caracteristicas indicadoras de precocidade sexual em um rebanho nelore. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 27., 2017, Santos. Anais [eletrônicos]... Brasília, DF: Associação Brasileira de Zootecnistas, 2017. Zootec 2017| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 86. | | QUEIROZ, L. C. R. de; BRUNES, L. C.; MAGNABOSCO, C. de U.; COSTA, M. F. O. e; BALDI REY, F. S.; CASTRO, L. M. de; SANTOS, M. F. dos; SILVA, F. N. O. da. Tendências genéticas e fenotípicas para perímetro escrotal e caracteristicas indicadoras de precocidade sexual em um rebanho nelore. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 27., 2017, Santos. Anais [eletrônicos]... Brasília, DF: Associação Brasileira de Zootecnistas, 2017. Zootec.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 87. | | ALVES-JÚNIOR, M.; ALFENAS-ZERBINI, P.; ANDRADE, E. C. de; ESPOSITO, D. A.; SILVA, F. N.; CRUZ, A. C. F. da; VENTRELLA, M. C.; OTONI, W. C.; ZERBINI, F. M. Synergism and negative interference during co-infection of tomato and Nicotiana benthamiana with two bipartite begomoviruses. Virology, v. 387, n. 2, p. 257-266, mai. 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 88. | | PEREIRA, T. G.; NAITO, F. Y. B.; FONTENELE, R. S.; BLAWID, R.; FERNANDES, F. R.; LIMA, A. T. M.; SILVA, F. N.; ROCHA, C. S.; ROSALES, G. P.; OLIVEIRA, C. L.; RESENDE, R. O.; ZERBINI, F. M.; RIBEIRO, S. da G.; ARAGAO, F. J. L.; NAGATA, A. K. I. Begomovirus species diversity in South American weeds. In: INTERNATIONAL GEMINIVIRUS SYMPOSIUM, 6.; INTERNATIONAL ssDNA COMPARATIVE VIROLOGY WORKSHOP, 4., 2010, Guanajuato, Mexico. [Programme & abstracts]. Guanajuato: Cinvestav: Conacyt, 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 89. | | ORILIO, A. F.; LIMA, A. T. M.; ALMEIDA, M. M. S.; ROCHA, C. da S.; BARROS, D. R.; URQUIZA, G. P. C.; SILVA, F. N.; ZERBINI, P. A.; BARBOSA, J. C.; ALBUQUERQUE, L. C.; INOUE-NAGATA, A. K.; KITAJIMA, E. W.; ZERBINI, F. M. Malvaviscus yellow mosaic virus, a begomovirus carrying a nanovirus-like nonanucleotide and a modified stem-loop structure. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE VIROLOGIA, 30.; ENCONTRO DE VIROLOGIA DO MERCOSUL, 14., 2019, Cuiabá. Resumos... Brasília, DF: SBV, 2019. p. 8.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 90. | | LIMA, A. T. M.; ORÍLIO, A. F.; ALMEIDA, M. M. S.; ROCHA, C. S.; BARROS, D. R.; CASTILLO-URQUIZA, G. P.; SILVA, F. N.; XAVIER, C. A. D.; BRUCKNER, F. P.; ALFENAS-ZERBINI, P.; BARBOSA, J. C.; ALBUQUERQUE, L. C.; INOUE-NAGATA, A. K.; KITAJIMA, E. W.; ZERBINI, F. M. Malvaviscus yellow mosaic virus, a divergent begomovirus carrying a nanovirus-like nonanucleotide and a modified stem-loop structure. Annals of Applied Biology, v. 179, p. 96-107, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 91. | | SOUZA, D. D. de; QUEIROZ, A. P. de; PEREIRA, F. S.; DIANESE, E. de C.; FAJARDO, T. V. M.; NHANI JUNIOR, A.; LAU, D.; SILVA, L. A. da; RIBEIRO, B. M.; COELHO, A. S. G.; AGUIAR, R. W. de S.; MELLO, R. N. de; SILVA, F. N. da. Molecular characterization and sequence analysis of four Brazilian rice stripe necrosis virus isolates. Archives of Virology, v. 166, n. 6, p. 1763-1767, June 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Trigo; Embrapa Uva e Vinho. |
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| 92. | | SANTI, A.; NHANI JUNIOR, A.; GUTERRES, C. W.; LAU, D.; SILVA, F. N. da; PEREIRA, F. S.; DALMAGO, G. A.; VALENTE, J. B.; STEMPKOWSKI, L. A.; RODRIGUES, O.; KUHNEM, P.; CASA, R. T.; ZOLDAN, S. M.; PRESTES, S. J. N.; FAJARDO, T. V. M. Trigo: risco identificado. Cultivar, v. 20, n. 238, p. 10-13, Mar. 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Trigo; Embrapa Uva e Vinho. |
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| 93. | | XAVIER, C. A. D.; NOGUEIRA, A. M.; BELLO, V. H.; WATANABE, L. F. M.; BARBOSA, T. M. C.; ALVES JÚNIOR, M.; BARBOSA, L.; BESERRA-JÚNIOR, J. E. A.; BOARI, A. de J.; CALEGARIO, R.; GORAYEB, E. S.; HONORATO JÚNIOR, J.; KOCH, G.; LIMA, G. S. de A.; LOPES, C.; MELLO, R. N. de; PANTOJA, K.; SILVA, F. N.; RAMOS SOBRINHO, R.; SANTANA, E. N.; SILVA, J. W. P. da; KRAUSE-SAKATE, R.; ZERBINI, F. M. Assessing the diversity of whiteflies infesting cassava in Brazil. PeerJ, v. 9, e11741, July 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Arroz e Feijão. |
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