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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
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Data corrente: |
23/11/2021 |
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Data da última atualização: |
09/06/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PAIVA, B. A. R. de; WENDLAND, A.; ROSSATO, M.; FERREIRA, M. A. da S. V. |
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Afiliação: |
BRUNA ALICIA RAFAEL DE PAIVA, UNB; ADRIANE WENDLAND FERREIRA, CNPAF; MAURICIO ROSSATO, UNB; MARISA A. DA S. VELLOSO FERREIRA, UNB. |
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Título: |
Virulence and type III effector diversities of Xanthomonas citri pv. fuscans and X. phaseoli pv. phaseoli in Brazil. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Phytopathology, v. 170, n. 1, p. 1-14, 2022. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1111/jph.13049 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Common bacterial blight (CBB) is caused by four genetic lineages belonging to two species of Xanthomonas, namely Xanthomonas citri pv. fuscans (includes fuscans, NF2 and NF3 lineages) and X. phaseoli pv. phaseoli (lineage NF1). A collection of 117 strains of Xanthomonas isolated from common bean plants grown in several producing regions of Brazil, between 2007 and 2016 was established. For species and lineage identification, the following tests were performed: multiplex PCR with a set of four specific primer pairs, pathogenicity tests on susceptible cultivar BRS Artico and phylogenetic analysis based on housekeeping gene sequences. The presence of the two species were confirmed among the 117 strains, being 62 non-fuscans strains (NF1, NF2 and NF3) and 55 fuscans strains of X. citri pv. fuscans. To select a set of representative strains for the virulence assay, a PCR-based analysis of effector diversity was performed with 42 strains belonging to the two species. PCR with primers for xopL, avrBsT, xopE2 and xopE1 genes were positive for all strains, while for the other six effectors there was variation. Six distinct effector profiles were detected, and one strain representing each type was inoculated in 15 common bean cultivars with varying levels of resistance to CBB. The fuscans strains showed uniformity in their effector profiles and were the most virulent. The phylogenetic analyses of our strain collection revealed that all genetic variants of CBB pathogens (NF1, NF2, NF3 and fuscans) are present in Brazil, with significant variability in virulence to common bean cultivars. MenosCommon bacterial blight (CBB) is caused by four genetic lineages belonging to two species of Xanthomonas, namely Xanthomonas citri pv. fuscans (includes fuscans, NF2 and NF3 lineages) and X. phaseoli pv. phaseoli (lineage NF1). A collection of 117 strains of Xanthomonas isolated from common bean plants grown in several producing regions of Brazil, between 2007 and 2016 was established. For species and lineage identification, the following tests were performed: multiplex PCR with a set of four specific primer pairs, pathogenicity tests on susceptible cultivar BRS Artico and phylogenetic analysis based on housekeeping gene sequences. The presence of the two species were confirmed among the 117 strains, being 62 non-fuscans strains (NF1, NF2 and NF3) and 55 fuscans strains of X. citri pv. fuscans. To select a set of representative strains for the virulence assay, a PCR-based analysis of effector diversity was performed with 42 strains belonging to the two species. PCR with primers for xopL, avrBsT, xopE2 and xopE1 genes were positive for all strains, while for the other six effectors there was variation. Six distinct effector profiles were detected, and one strain representing each type was inoculated in 15 common bean cultivars with varying levels of resistance to CBB. The fuscans strains showed uniformity in their effector profiles and were the most virulent. The phylogenetic analyses of our strain collection revealed that all genetic variants of CBB pathogens (NF1, NF2, NF3 ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Avirulence genes. |
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Thesagro: |
Doença de Planta; Feijão; Phaseolus Vulgaris; Resistência Genética. |
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Thesaurus Nal: |
Beans; Genetic resistance; Plant diseases and disorders; Xanthomonas axonopodis; Xanthomonas fuscans. |
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Categoria do assunto: |
H Saúde e Patologia |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pantanal. |
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Data corrente: |
27/03/2013 |
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Data da última atualização: |
27/03/2013 |
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Tipo da produção científica: |
Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
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Autoria: |
COSTA-PEREIRA, R.; ROSA, F. R. da; RESENDE, E. K. de. |
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Afiliação: |
RAUL COSTA PEREIRA, UFMS; FÁBIO RICARDO DA ROSA, UFMS; EMIKO KAWAKAMI DE RESENDE, CPAP. |
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Título: |
Estrutura trófica da comunidade de peixes de riachos da porção oeste da bacia do Alto Paraná. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
Corumbá: Embrapa Pantanal, 2012. |
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Páginas: |
25 p. |
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Série: |
(Embrapa Pantanal. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 117). |
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ISSN: |
1981-7215 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O conhecimento ecológico de peixes de riachos brasileiros ainda possui lacunas. Apesar dos muitos estudos ictiológicos na Bacia do Alto Rio Paraná, poucos foram conduzidos em córregos da região Centro-Oeste, uma das mais ameaçadas pela expansão agropecuária. Este estudo é resultado da compilação dos dados de amostras obtidas em riachos da porção Oeste da Bacia do Alto Rio Paraná. Nosso objetivo é analisar a dieta da ictiofauna e alocar as mais abundantes em guildas tróficas. Selecionamos 343 indivíduos de 44 espécies de peixes de 35 riachos nas sub-bacias dos rios Ivinhema, Pardo e Sucuriú, além de riachos que deságuam diretamente no rio Paraná. As 22 espécies mais abundantes foram classificadas em seis grupos tróficos: insetívoros bentônicos, onívoros generalistas, insetívoros, carnívoro com tendência à piscivoria, onívoros com tendência à herbivoria e iliófago-detritívoros. A classificação trófica de cada espécie na literatura foi revisada e discutida. Diferenças na composição da dieta e inclusão em guildas entre estudos foram frequentes, o que provavelmente se relaciona ao generalismo e a plasticidade trófica típicos de peixes de riachos. Nesse contexto, sugerimos que estudos de dieta em riachos tenham escalas espaciais, temporais e ontogenéticas amplas, e que a classificação de espécies em guildas a priori não é aconselhável. |
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Palavras-Chave: |
Generalismo; Guildas tróficas; Ictiofauna. |
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Thesagro: |
Dieta. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/79842/1/BP117.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pantanal (CPAP) |
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