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| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Gado de Leite. Para informações adicionais entre em contato com cnpgl.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
Data corrente: |
11/08/2021 |
Data da última atualização: |
11/08/2021 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
LOPES, J. M. L.; MATOS, E. M. de; ZORZATTO, C.; AZEVEDO, A. L. S.; MACHADO, M. A.; CHESTER, M.; VICCINI, L. F. |
Afiliação: |
JULIANA MAINENTI LEAL LOPES, Universidade Federal de Juiz de Fora; ELYABE MONTEIRO DE MATOS, Universidade Federal de Juiz de Fora; CRISTIANE ZORZATTO, Universidade Federal de Juiz de Fora; ANA LUISA SOUSA AZEVEDO, CNPGL; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; MICHAEL CHESTER, Royal Botanic Gardens; LYDERSON FACIO VICCINI, Universidade Federal de Juiz de Fora. |
Título: |
Development of microsatellite markers for Lippia alba and related Lippia species. |
Ano de publicação: |
2020 |
Fonte/Imprenta: |
Molecular Biology Reports, v. 47, p. 4911-4915, 2020 |
DOI: |
https://doi.org/10.1007/s11033-020-05445-z |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Microsatellite primers were developed in Lippia alba complex to better understanding the origins and evolution of the species. We sought to increase the numbers of available simple sequence repeat (SSR) markers. We performed low-coverage (~ twofold) genomic DNA sequencing of a diploid accession and generated a de novo assembly comprising 175,572 contigs. Sixteen SSR loci were selected and of these 13 SSR loci were successfully amplified in 20 L. alba tetraploid accessions and in 12 other Lippia species. Only one SSR locus was monomorphic, whereas 12 loci were polymorphic, yielding one to nine alleles. The heterozygosity was similar among markers, with values of 0.274?0.485; the polymorphism information content values varied from 0.237 to 0.367. These markers were successfully amplified in related species with 85% of transferability on average. Thus, we demonstrate the utility of including a de novo assembly step to obtain SSR markers from low-coverage genomic datasets. |
Palavras-Chave: |
Simple sequence repeat; SSR. |
Thesagro: |
Genética; Marcador Genético. |
Thesaurus Nal: |
Phyla (Verbenaceae); Polyploidy. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
Data corrente: |
29/12/2010 |
Data da última atualização: |
29/12/2010 |
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
Autoria: |
RAMOS, A. F.; ZAGO, F. C.; MARTINS, V. M. V.; MARTINS, E.; TEIXEIRA, H. C. A.; FONTEQUE, J. H.; EGITO, A. A. do. |
Afiliação: |
ALEXANDRE FLORIANI RAMOS, CENARGEN; FABIANO CARMINATTI ZAGO, Epagri; VERA MARIA VILLAMIL MARTINS, CAV / UDESC; EDISON MARTINS, Associação Brasileira de Criadores da Raça Crioula Lageana; HEITOR CASTRO ALVES TEIXEIRA, CENARGEN; JOANDES HENRIQUE FONTEQUE, CAV / UDESC; ANDREA ALVES DO EGITO, CENARGEN. |
Título: |
Biometria testicular de reprodutores bovinos da raça crioula lageana entre um e dois anos de idade. |
Ano de publicação: |
2010 |
Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS; WORKSHOP EM BIOPROSPECÇÃO E CONSERVAÇÃO DE PLANTAS NATIVAS DO SEMI-ÁRIDO, 3.; WORKSHOP INTERNACIONAL SOBRE BIOENERGIA E MEIO AMBIENTE, 2010, Salvador. Bancos de germoplasma: descobrir a riqueza, garantir o futuro: anais. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. |
Descrição Física: |
CDR-ROM |
Idioma: |
Português |
Palavras-Chave: |
Puberdade; Recursos Genéticos. |
Thesagro: |
Conservação; Reprodução. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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