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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
26/11/2009 |
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Data da última atualização: |
15/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
SALIM, J. A.; MAZONI, I.; MANCINI, A. L.; MORAES, F. R.; JARDINE, J. G.; NESHICH, I. P.; NESHICH, G. |
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Afiliação: |
JOSÉ AUGUSTO SALIM, Estagiário/CNPTIA; IVAN MAZONI, CNPTIA; ADAUTO LUIZ MANCINI, CNPTIA; FABIO ROGERIO DE MORAES, Bolsista/CNPTIA; JOSE GILBERTO JARDINE, CNPTIA; IZABELLA PENA NESHICH, Estagiária/CNPTIA; GORAN NESHICH, CNPTIA. |
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Título: |
MSSP: a web-based application for analysis of selected parameter from multiple structures in a graphical manner. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Abstracts book... Angra dos Reis: ABBCB, 2009. |
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Páginas: |
Não paginado. |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
X-Meeting 2009. |
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Conteúdo: |
The Blue Star Sting?s module Multiples Structures Selected Parameter (MSSP) is software developed in Java and Perl programming languages. It allows comparing, in a graphical manner, a selected parameter out of a total of 150 parameters in a different protein structures previously aligned in a simple intuitive plot. From a local database containing more than 60,000 proteins structures users can choose a single protein structure or a set of them. First, the structures are aligned using a specific algorithm and than MSSP does a XY plot, where X represents the residues position and Y the selected parameter values for selected aligned structures. The structural alignment is obtained with the Matching Molecular Models Obtained from Theory (MAMMOTH) software using the version able to align multiples structures called MAMMOTH-mult. Observing the alignments in MSSP plot for a selected parameter is possible see how good an alignment is by observation of the incidence of peaks and valleys in the graphic, and so an insertion of gaps can improve the alignment to optimist incidences of this peaks and valleys. Of course a statistical computation is needed to optimize insertion of gaps and an analysis of a set of parameters is also needed. However with a good alignment algorithm and MSSP it is possible to create a more efficient algorithm to make optimized structural alignments. |
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Palavras-Chave: |
Bioinformática; Estruturas de proteínas; MAMMOTH; Matching Molecular Models Obtained from Theory (MAMMOTH). |
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Thesaurus Nal: |
Bioinformatics; Molecular dynamics; Protein structure. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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500 $aX-Meeting 2009.
520 $aThe Blue Star Sting?s module Multiples Structures Selected Parameter (MSSP) is software developed in Java and Perl programming languages. It allows comparing, in a graphical manner, a selected parameter out of a total of 150 parameters in a different protein structures previously aligned in a simple intuitive plot. From a local database containing more than 60,000 proteins structures users can choose a single protein structure or a set of them. First, the structures are aligned using a specific algorithm and than MSSP does a XY plot, where X represents the residues position and Y the selected parameter values for selected aligned structures. The structural alignment is obtained with the Matching Molecular Models Obtained from Theory (MAMMOTH) software using the version able to align multiples structures called MAMMOTH-mult. Observing the alignments in MSSP plot for a selected parameter is possible see how good an alignment is by observation of the incidence of peaks and valleys in the graphic, and so an insertion of gaps can improve the alignment to optimist incidences of this peaks and valleys. Of course a statistical computation is needed to optimize insertion of gaps and an analysis of a set of parameters is also needed. However with a good alignment algorithm and MSSP it is possible to create a more efficient algorithm to make optimized structural alignments.
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700 1 $aNESHICH, G.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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Data corrente: |
03/01/2017 |
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Data da última atualização: |
17/05/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
MARTINS, T. P.; BONFIM, J. M.; MARTINS CASTRO, S. M.; SILVA, B. E. B. e; NOBRE, C. O. R.; MARTINS, L. S.; SOUZA, V. de; VASCONCELOS, A. M. de. |
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Afiliação: |
THAYS PAULINA MARTINS; JOICE MELO BONFIM; SAMIRES MARTINS CASTRO; BENEDITA ELIOMARA BRITO E SILVA; CLAUDELICE OLIVEIRA ROSA NOBRE; LARA SENA MARTINS; VIVIANE DE SOUZA, CNPC; ANGELA MARIA DE VASCONCELOS, Universidade Estadual Vale do Acaraú (UVA) - Sobral, CE, Brasil. |
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Título: |
Concentração séricas de selênio em cabras suplementadas com selênio orgânico durante a estação de monta. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
Arquivos Latinoamericanos de Produção Animal, v. 24, supl. 1, p. 1004-1005, 2016. Resumo 318-1. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Edición de las Memorias de la 25a. Reunión de la Asociación Latinoamericana de Producción Animal (ALPA), 2016, Recife, Brasil. |
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Palavras-Chave: |
Cabras leiteira; Levedura; Supplementary feeding. |
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Thesagro: |
Antioxidante; Caprino; Microelemento; Selênio; Suplemento alimentar; Suplemento mineral. |
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Thesaurus NAL: |
Antioxidants; Goats; Trace elements. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/152697/1/cnpc-2016-Concentracao-sericas.pdf
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Marc: |
LEADER 01161nam a2200337 a 4500
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008 2016 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aMARTINS, T. P.
245 $aConcentração séricas de selênio em cabras suplementadas com selênio orgânico durante a estação de monta.$h[electronic resource]
260 $aArquivos Latinoamericanos de Produção Animal, v. 24, supl. 1, p. 1004-1005, 2016. Resumo 318-1.$c2016
500 $aEdición de las Memorias de la 25a. Reunión de la Asociación Latinoamericana de Producción Animal (ALPA), 2016, Recife, Brasil.
650 $aAntioxidants
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700 1 $aVASCONCELOS, A. M. de
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Registro original: |
Embrapa Caprinos e Ovinos (CNPC) |
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