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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
Data corrente: |
29/09/2016 |
Data da última atualização: |
12/03/2019 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
MUDADU, M. de A.; PORTO NETO, L. R.; MOKRY, F. B.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; TULLIO, R. R.; NASSU, R. T.; NICIURA, S. C. M.; THOLON, P.; ALENCAR, M. M. de; HIGA, R. H.; ROSA, A. do N.; FEIJO, G. L. D.; FERRAZ, A. L. J.; SILVA, L. O. C. da; MEDEIROS, S. R. de; LANNA, D. P. D.; NASCIMENTO, M. L. do; CHAVES, A. S.; SOUZA, A. R. D. L.; PACKER, I. U.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; SIQUEIRA, F.; MOURAO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REVERTER, A.; REGITANO, L. C. de A. |
Afiliação: |
MAURICIO DE ALVARENGA MUDADU, CNPTIA; Laercio Ribeiro Porto Neto, Commonwealth Scientific and Industrial Research Organization - Agriculture; Fabiana Barichello Mokry, UFSCar; Polyana Cristine Tizioto, UFSCar; Priscila Silva Neubern de Oliveira, UFSCar; RYMER RAMIZ TULLIO, CPPSE; RENATA TIEKO NASSU, CPPSE; SIMONE CRISTINA MEO NICIURA, CPPSE; PATRICIA THOLON, CPPSE; MAURICIO MELLO DE ALENCAR, CPPSE; ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; ANTONIO DO NASCIMENTO FERREIRA ROSA, CNPGC; GELSON LUIS DIAS FEIJO, CNPGC; André Luiz Julien Ferraz, UEMS; LUIZ OTAVIO CAMPOS DA SILVA, CNPGC; SERGIO RAPOSO DE MEDEIROS, CNPGC; Dante Pazzanese Duarte Lanna, USP; Michele Lopes do Nascimento, USP; Amália Saturnino Chaves, USP; Andréa Roberto Duarte Lopes Souza, USP; Irineu Umberto Packer, USP; ROBERTO AUGUSTO DE A TORRES JUNIOR, CNPGC; FABIANE SIQUEIRA, CNPGC; Gerson Barreto Mourão, USP; Luiz Lehmann Coutinho, USP; Antonio Reverter, Commonwealth Scientific and Industrial Research Organization - Agriculture; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
Título: |
Genomic structure and marker-derived gene networks for growth and meat quality traits of brazilian nelore beef cattle. |
Ano de publicação: |
2016 |
Fonte/Imprenta: |
BMC Genomics, v. 17, n. 235, p. 1-16, 2016. |
DOI: |
10.1186/s12864-016-2535-3 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Nelore is the major beef cattle breed in Brazil with more than 130 million heads. Genome-wide association studies (GWAS) are often used to associate markers and genomic regions to growth and meat quality traits that can be used to assist selection programs. An alternative methodology to traditional GWAS that involves the construction of gene network interactions, derived from results of several GWAS is the AWM (Association Weight Matrices)/PCIT (Partial Correlation and Information Theory). With the aim of evaluating the genetic architecture of Brazilian Nelore cattle, we used high-density SNP genotyping data (~770,000 SNP) from 780 Nelore animals comprising 34 half-sibling families derived from highly disseminated and unrelated sires from across Brazil. The AWM/PCIT methodology was employed to evaluate the genes that participate in a series of eight phenotypes related to growth and meat quality obtained from this Nelore sample. |
Palavras-Chave: |
AWM; GWAS; PCIT. |
Thesaurus Nal: |
genotyping. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/147957/1/mudadu-bmcgenomics-2016.pdf
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Marc: |
LEADER 02333naa a2200493 a 4500 001 2053714 005 2019-03-12 008 2016 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1186/s12864-016-2535-3$2DOI 100 1 $aMUDADU, M. de A. 245 $aGenomic structure and marker-derived gene networks for growth and meat quality traits of brazilian nelore beef cattle.$h[electronic resource] 260 $c2016 520 $aNelore is the major beef cattle breed in Brazil with more than 130 million heads. Genome-wide association studies (GWAS) are often used to associate markers and genomic regions to growth and meat quality traits that can be used to assist selection programs. An alternative methodology to traditional GWAS that involves the construction of gene network interactions, derived from results of several GWAS is the AWM (Association Weight Matrices)/PCIT (Partial Correlation and Information Theory). With the aim of evaluating the genetic architecture of Brazilian Nelore cattle, we used high-density SNP genotyping data (~770,000 SNP) from 780 Nelore animals comprising 34 half-sibling families derived from highly disseminated and unrelated sires from across Brazil. The AWM/PCIT methodology was employed to evaluate the genes that participate in a series of eight phenotypes related to growth and meat quality obtained from this Nelore sample. 650 $agenotyping 653 $aAWM 653 $aGWAS 653 $aPCIT 700 1 $aPORTO NETO, L. R. 700 1 $aMOKRY, F. B. 700 1 $aTIZIOTO, P. C. 700 1 $aOLIVEIRA, P. S. N. de 700 1 $aTULLIO, R. R. 700 1 $aNASSU, R. T. 700 1 $aNICIURA, S. C. M. 700 1 $aTHOLON, P. 700 1 $aALENCAR, M. M. de 700 1 $aHIGA, R. H. 700 1 $aROSA, A. do N. 700 1 $aFEIJO, G. L. D. 700 1 $aFERRAZ, A. L. J. 700 1 $aSILVA, L. O. C. da 700 1 $aMEDEIROS, S. R. de 700 1 $aLANNA, D. P. D. 700 1 $aNASCIMENTO, M. L. do 700 1 $aCHAVES, A. S. 700 1 $aSOUZA, A. R. D. L. 700 1 $aPACKER, I. U. 700 1 $aTORRES JUNIOR, R. A. de A. 700 1 $aSIQUEIRA, F. 700 1 $aMOURAO, G. B. 700 1 $aCOUTINHO, L. L. 700 1 $aREVERTER, A. 700 1 $aREGITANO, L. C. de A. 773 $tBMC Genomics$gv. 17, n. 235, p. 1-16, 2016.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Registros recuperados : 39 | |
5. | | MACIEL, S. de A.; BITTENCOURT, D. M. de C.; RAPOSO, A. Efeito das auxinas 2,4-D e TDZ na indução da embriogênese somática em Uncaria tomentosa a partir de ápice caulinar. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FLORICULTURA E PLANTAS ORNAMENTAIS, 17.; CONGRESSO BRASILEIRO DE CULTURA DE TECIDOS DE PLANTAS, 4., 2009, Aracaju. Ciência, inovação e sustentabilidade: anais. Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2009. 1 CD-ROM. (Embrapa Tabuleiros Costeiros. Documentos, 150).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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7. | | MACIEL, S. de A.; BITTENCOURT, D. M. de C.; RAPOSO, A. Embriogênese somática em Uncaria tomentosa a partir de folhas imaturas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FLORICULTURA E PLANTAS ORNAMENTAIS, 17.; CONGRESSO BRASILEIRO DE CULTURA DE TECIDOS DE PLANTAS, 4., 2009, Aracaju. Ciência, inovação e sustentabilidade: anais. Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2009. 1 CD-ROM. (Embrapa Tabuleiros Costeiros. Documentos, 150).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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12. | | PROSDOCIMI, F.; BITTENCOURT, D. M. de C.; SILVA, F. R. D.; MOTTA, P. C.; RECH FILHO, E. L. Molecular, behavioral and anatomical sophistication in spider webs: insights from spinning gland RNA-seq experiments in primitive and modern spiders. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 6., 2010, Ouro Preto. Abstracts... [S.l.: s.n.], 2010. p. 67.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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15. | | SILVA, F. R. da; BITTENCOURT, D. M. de C.; LACORTE, C. C.; ANDRADE, A. C.; VERZA, N. C.; RECH FILHO, E. L. BioPol: an integrated resource for spider EST sequences abundant on brazilian biodiversity. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 17., 2009, San Diego, CA. [Proceedings...]. [S. l.: s.n.], 2009. p784Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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16. | | BITTENCOURT, D. M. de C.; LOPES, R.; CUNHA, R. N. V. da; ROCHA, R. N. C. da; TEIXEIRA, P. C.; LIMA, W. A. A. de. Correlação entre características avaliadas em germoplasma de dendezeiro tipo dura. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS; WORKSHOP EM BIOPROSPECÇÃO E CONSERVAÇÃO DE PLANTAS NATIVAS DO SEMI-ÁRIDO, 3.; WORKSHOP INTERNACIONAL SOBRE BIOENERGIA E MEIO AMBIENTE, 2010, Salvador. Bancos de germoplasma: descobrir a riqueza, garantir o futuro: anais. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. p. 284. 1 CD-ROM. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 304).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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17. | | SIQUEIRA, V. K. S.; LIMA, W. A. A. de; BITTENCOURT, D. M. de C.; HANADA, R. E.; FAUSTO, A. M. C.; NOGUEIRA, E. L. Identificação de fungos em sementes de híbrido interespecífico BRS-Manicoré. Informativo ABRATES, Londrina, v. 21, n. 2, ago. 2011. CD-ROM. Edição dos Anais do XVII Congresso Brasileiro de Sementes, Natal, 2011.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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18. | | LACERDA, V. A. M. L.; SOUSA, G. P. de; ROSINHA, G. M. S.; RECH FILHO, E. L.; ALMEIDA, J. R. M. de; BITTENCOURT, D. M. de C. Comparativo metodológico na produção de espidroínas sintéticas de aranhas da biodiversidade brasileira em bactérias. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 7., 2023, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2023. p. 88-92.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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19. | | LACERDA, V. A. M. L.; SOUSA, G. P. de; ROSINHA, G. M. S.; RECH FILHO, E. L.; ALMEIDA, J. R. M. de; BITTENCOURT, D. M. de C. Comparativo metodológico na produção de espidroínas sintéticas de aranhas da biodiversidade brasileira em bactérias. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 7., 2023, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2023. p. 88-92.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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