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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
Data corrente: |
12/12/2016 |
Data da última atualização: |
16/11/2017 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
RAMOS-GONZÁLEZ, P. L.; CHABI-JESUS, C.; GUERRA-PERAZA, O.; BRETON, M. C.; ARENA, G. D.; NUNES, M. A.; KITAJIMA, E. W.; MACHADO, M. A.; ASTUA, J. de F. |
Afiliação: |
PEDRO LUIS RAMOS-GONZÁLEZ, IAC; CAMILA CHABI-JESUS; ORLENE GUERRA-PERAZA, Instituto Biológico; MICHÈLE CLAIRE BRETON, IAC; GABRIELLA DIAS ARENA, IAC; MARIA ANDREIA NUNES, IAC; ELLIOT WATANABE KITAJIMA, ESALQ; MARCOS ANTONIO MACHADO, IAC; JULIANA DE FREITAS ASTUA, CNPMF. |
Título: |
Phylogenetic and Molecular Variability Studies Reveal a New Genetic Clade of Citrus leprosis virus C. |
Ano de publicação: |
2016 |
Fonte/Imprenta: |
Viruses, v.8, n.153, 2016. |
ISSN: |
1999-4915 |
DOI: |
10.3390/v8060153 |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Citrus leprosis virus C (CiLV-C) causes a severe disease affecting citrus orchards in the Western hemisphere. This study reveals the molecular variability of the virus by analyzing four genomic regions (p29, p15, MP and RNA2-intergenic region) distributed over its two RNAs. Nucleotide diversity () values were relatively low but statistically different over the analyzed genes and subpopulations, indicating their distinct evolutionary history. Values of p29 and MP were higher than those of p15 and RNA2?IR, whereas MP was increased due to novel discovered isolates phylogenetically clustered in a divergent clade that we called SJP. Isolate BR_SP_SJP_01 RNA1 and RNA2 sequences, clade SJP, showed an identity of 85.6% and 88.4%, respectively, with those corresponding to CiLV-C, the type member of the genus Cilevirus, and its RNA2 51-proximal region was revealed as a minor donor in a putative inter-clade recombination event. In addition to citrus, BR_SP_SJP_01 naturally infects the weed Commelina benghalensis and is efficiently transmitted by Brevipalpus yothersi mites. Our data demonstrated that negative selection was the major force operating in the evaluated viral coding regions and defined amino acids putatively relevant for the biological function of cilevirus proteins. This work provides molecular tools and sets up a framework for further epidemiological studies |
Palavras-Chave: |
Plant diseases. |
Thesagro: |
Doença de planta; Fruta cítrica. |
Thesaurus Nal: |
Citrus. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 02197naa a2200289 a 4500 001 2058412 005 2017-11-16 008 2016 bl uuuu u00u1 u #d 022 $a1999-4915 024 7 $a10.3390/v8060153$2DOI 100 1 $aRAMOS-GONZÁLEZ, P. L. 245 $aPhylogenetic and Molecular Variability Studies Reveal a New Genetic Clade of Citrus leprosis virus C.$h[electronic resource] 260 $c2016 520 $aCitrus leprosis virus C (CiLV-C) causes a severe disease affecting citrus orchards in the Western hemisphere. This study reveals the molecular variability of the virus by analyzing four genomic regions (p29, p15, MP and RNA2-intergenic region) distributed over its two RNAs. Nucleotide diversity () values were relatively low but statistically different over the analyzed genes and subpopulations, indicating their distinct evolutionary history. Values of p29 and MP were higher than those of p15 and RNA2?IR, whereas MP was increased due to novel discovered isolates phylogenetically clustered in a divergent clade that we called SJP. Isolate BR_SP_SJP_01 RNA1 and RNA2 sequences, clade SJP, showed an identity of 85.6% and 88.4%, respectively, with those corresponding to CiLV-C, the type member of the genus Cilevirus, and its RNA2 51-proximal region was revealed as a minor donor in a putative inter-clade recombination event. In addition to citrus, BR_SP_SJP_01 naturally infects the weed Commelina benghalensis and is efficiently transmitted by Brevipalpus yothersi mites. Our data demonstrated that negative selection was the major force operating in the evaluated viral coding regions and defined amino acids putatively relevant for the biological function of cilevirus proteins. This work provides molecular tools and sets up a framework for further epidemiological studies 650 $aCitrus 650 $aDoença de planta 650 $aFruta cítrica 653 $aPlant diseases 700 1 $aCHABI-JESUS, C. 700 1 $aGUERRA-PERAZA, O. 700 1 $aBRETON, M. C. 700 1 $aARENA, G. D. 700 1 $aNUNES, M. A. 700 1 $aKITAJIMA, E. W. 700 1 $aMACHADO, M. A. 700 1 $aASTUA, J. de F. 773 $tViruses$gv.8, n.153, 2016.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
Data corrente: |
10/01/2021 |
Data da última atualização: |
10/01/2021 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Circulação/Nível: |
B - 3 |
Autoria: |
SANTANA, D. S.; PACHECO, E. P.; VALE, W. G.; CHAVES, M. V. S. |
Afiliação: |
EDSON PATTO PACHECO, CPATC. |
Título: |
Modelagem da transferência das pressões aplicadas na superfície de um argissolo do tabuleiros costeiros. |
Ano de publicação: |
2020 |
Fonte/Imprenta: |
Scientific Electronic Archives, v. 13, n.7, jul., 2020. |
ISSN: |
2316-9281 |
DOI: |
http://dx.doi.org/10.36560/1372020960 |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
O horizonte subsuperficial coeso dos Argissolos de Tabuleiros Costeiros, reduz a profundidade efetiva desses solos, comprometendo a produtividade e longevidade das lavouras de culturas perenes. Essa limitação pedogenética pode ser potencializada quando a pressão aplicada na superfície do horizonte Ap, durante o tráfego de máquinas agrícolas é transmitida para horizontes mais profundos, AB ou Bt, em níveis superiores a capacidade de suporte de carga dessas camadas. Objetivou-se com esta pesquisa modelar matematicamente a transferência de pressões aplicadas à superfície do horizonte Ap de um Argissolo para camadas subsuperficiais buscando relacionar a pressão aplicada com a umidade do perfil de solo. Com o experimento desenvolvido no laboratório de Solos e Nutrição de Plantas da Embrapa Tabuleiros Costeiros, concluiu-se que a umidade apresenta efeito de amortecimento sobre a pressão transmitida de camadas superiores para subsuperfície. A pressão transmitida para subsuperfície apresenta comportamento exponencial com correlação negativa em função da profundidade, independente da pressão aplicada na superfície. O aumento da área de contato para aplicação de pressões na superfície do solo, atenua a transmissão de pressão para camadas inferiores, quando é comparado à mesma pressão aplicada em áreas menores. |
Thesagro: |
Alissolo; Análise do Solo; Solo. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/220094/1/Scientific-Electronic-Archives-Modelagem.pdf
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Marc: |
LEADER 02026naa a2200217 a 4500 001 2129163 005 2021-01-10 008 2020 bl uuuu u00u1 u #d 022 $a2316-9281 024 7 $ahttp://dx.doi.org/10.36560/1372020960$2DOI 100 1 $aSANTANA, D. S. 245 $aModelagem da transferência das pressões aplicadas na superfície de um argissolo do tabuleiros costeiros.$h[electronic resource] 260 $c2020 520 $aO horizonte subsuperficial coeso dos Argissolos de Tabuleiros Costeiros, reduz a profundidade efetiva desses solos, comprometendo a produtividade e longevidade das lavouras de culturas perenes. Essa limitação pedogenética pode ser potencializada quando a pressão aplicada na superfície do horizonte Ap, durante o tráfego de máquinas agrícolas é transmitida para horizontes mais profundos, AB ou Bt, em níveis superiores a capacidade de suporte de carga dessas camadas. Objetivou-se com esta pesquisa modelar matematicamente a transferência de pressões aplicadas à superfície do horizonte Ap de um Argissolo para camadas subsuperficiais buscando relacionar a pressão aplicada com a umidade do perfil de solo. Com o experimento desenvolvido no laboratório de Solos e Nutrição de Plantas da Embrapa Tabuleiros Costeiros, concluiu-se que a umidade apresenta efeito de amortecimento sobre a pressão transmitida de camadas superiores para subsuperfície. A pressão transmitida para subsuperfície apresenta comportamento exponencial com correlação negativa em função da profundidade, independente da pressão aplicada na superfície. O aumento da área de contato para aplicação de pressões na superfície do solo, atenua a transmissão de pressão para camadas inferiores, quando é comparado à mesma pressão aplicada em áreas menores. 650 $aAlissolo 650 $aAnálise do Solo 650 $aSolo 700 1 $aPACHECO, E. P. 700 1 $aVALE, W. G. 700 1 $aCHAVES, M. V. S. 773 $tScientific Electronic Archives$gv. 13, n.7, jul., 2020.
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Embrapa Tabuleiros Costeiros (CPATC) |
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