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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pantanal. |
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Data corrente: |
25/10/2023 |
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Data da última atualização: |
25/10/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
DINIZ SOBRINHO, F. de A.; MOURA, J. de O.; BAJAY, M. M.; CASTELO BRANCO, L.; BEZERRA, R. D. S.; ARAÚJO, A. M. de. |
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Afiliação: |
FRANCISCO DE A. DINIZ SOBRINHO, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PIAUÍ, Teresina-PI; JEANE DE O. MOURA, INSTITUTO FEDERAL DO PIAUÍ, Teresina-PI; MIKLOS M. BAJAY, UNIVERSIDADE DO ESTADO DE SANTA CATARINA, Laguna-SC; LEONARDO CASTELO BRANCO, UNIVERSIDADE FEDERAL RURAL DA AMAZÔNIA, Belém-PA; ROOSEVELT D. S. BEZERRA, INSTITUTO FEDERAL DO PIAUÍ, Teresina-PI; ADRIANA MELLO DE ARAUJO, CPAP. |
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Título: |
Capra hircus outliers markers in Brazil: searching for genomic regions under the action of natural selection. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, v. 46, n. 3, e20230084, 2023. |
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ISSN: |
1678-4685 |
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DOI: |
https://doi.org/10.1590/1678-4685-GMB-2023-0084 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Identifying genome regions subject to selection in local breeds of Brazil is an opportunity to elucidate the C. hircus genome plasticity, flowing the colonization history of the country. Using SNP Bead Chip Illumina 50K genotyping of Brazilian Anglo-Nubian (standardized breed) and Marota (local endangered population from the semiarid area of Brazil) to show outliers loci in genome regions subject to selection. After applying data quality control, 45,600 SNPs were included in this investigation. Principal component analysis (PCAdapt) and FDIST2 analysis signalized 14 genomic regions more affected by selection in the Brazilian dry zone environment. The genome study signalized regions that are close to the sequences of genes related to growth and embryonic skeletal development (FGF12, AMPD2, OSTN). In addition, flagged regions close to the genes UTSB2 and SLC5A2 contribute to research on functional adaptation with low water needs and poor nutritive diet to survive. Both genes encode proteins that act on osmotic pathways and avoid cell flooding on stress cell responses. Further studies on the genetic role and involvement of these outliers? genomic regions, building a robust conceptual high-resolution map of natural selection drives, help to achieve hardiness candidate genes linked to the evolutionary history of Capra hircus in the semiarid area of Brazil. |
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Palavras-Chave: |
Candidate genes; Hardiness; Non-neutral loci; Outliers; Seleção natural; Tropical adaptation. |
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Thesagro: |
Capra Hircus; Caprino; Genoma; Seleção. |
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Thesaurus Nal: |
Genome; Natural selection. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1157489/1/gmb-2023.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pantanal (CPAP) |
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| Registros recuperados : 8 | |
| 1. |  | MOURA, J. de O.; CAMPELO, J. E. G.; BAJAY, M. M.; SARMENTO, J. L. R.; ARAUJO, A. M. de. Population genomics and gene introgression in goat herds naturally adapted to Brazil. Revista Ciência Agronômica, Fortaleza, v. 50, n. 3, p. 476-483, jul./set. 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 2. | | NOGUEIRA FILHO, F. P.; BAJAY, M. M.; SOUSA, J. A. de; ARAÚJO, J. D. M.; CORREIA, D. Viabilidade econômica da produção de eucalipto no polo moveleiro de Marco - Ceará. Revista iPecege, Piracicaba, v. 3, n. 4, p. 22-34, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 3. | | DINIZ SOBRINHO, F. de A.; MOURA, J. de O.; BAJAY, M. M.; CASTELO BRANCO, L.; BEZERRA, R. D. S.; ARAÚJO, A. M. de. Capra hircus outliers markers in Brazil: searching for genomic regions under the action of natural selection. Genetics and Molecular Biology, v. 46, n. 3, e20230084, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 4. | | BAJAY, M. M.; ZUCCHI, M. I.; NOBREGA, M. B. de M.; KIIHL, T. A. M.; ZANOTTO, M. D.; PINHEIRO, J. B. Caracterização da diversidade do germoplasma de mamona (ricinus communis l.) utilizando marcadores microssatélites. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 4.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE OLEAGINOSAS ENERGÉTICAS, 1., 2010, João Pessoa. Inclusão social e energia: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 5. | | VIEIRA, M. A. R.; MARQUES, M. O. M.; HABER, L. L.; VIGNA, B. B. Z.; BAJAY, M. M.; SOUZA, A. P.; SEMIR, J.; ZUCCHI, M. I. New loci of Lychnophora ericoides and transferability to Lychnophora pinaster, endangered medicinal species from Brazil Genetics and Molecular Research, v 13, n. 4, p. 878-882, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 6. | | BELINI, C. M. B.; ZUCCHI, M. I.; BAJAY, M. M.; MARQUES, M. O. M.; FACANALI, R.; VIEIRA, M. A. R.; FIGUEIRA, G. M.; HABER, L. L. Medical and aromatic plant collection of Baccharis dracunculifolia DC. germplasm bank. Acta Horticulturae, v. 1125, p. 229-234, 2016. Edition of Proceedings of the Symposia of the V world congress on medicinal and aromatic plants and international symposia on plants, as factories of natural substances, edible and essential oils.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 7. | | RIGOTTI, M.; FACANALI, R.; HABER, L. L.; VIEIRA, M. A. R.; ISOBE, M. T. C.; CAVALLARI, M. M.; BAJAY, M. M.; ZUCCHI, M. I.; PINHEIRO, J. B.; MARQUES, M. O. M. Chemical and genetic diversity of Baccharis dracunculifolia DC. (Asteraceae) from the Cerrado biome. Biochemical Systematics and Ecology, v. 111, dec. 2023, 104735. 8 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 8. | | MOURA, J. O.; CAMPELO, J. E. G.; BAJAY, M. M.; SARMENTO, J. L. R.; BRITTO, F. B.; LEAL, T. M.; COSTA, M. S.; CAVALCANTE, D. H.; CARVALHO, M. D. F.; ARAUJO, A. M. de. Diversidade genética em caprino Marota e manejo genético para rebanhos de conservação. Archivos de Zootecnia, v. 68, n. 261, p. 138-145, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| Registros recuperados : 8 | |
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