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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pantanal. |
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Data corrente: |
25/10/2023 |
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Data da última atualização: |
25/10/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
DINIZ SOBRINHO, F. de A.; MOURA, J. de O.; BAJAY, M. M.; CASTELO BRANCO, L.; BEZERRA, R. D. S.; ARAÚJO, A. M. de. |
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Afiliação: |
FRANCISCO DE A. DINIZ SOBRINHO, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PIAUÍ, Teresina-PI; JEANE DE O. MOURA, INSTITUTO FEDERAL DO PIAUÍ, Teresina-PI; MIKLOS M. BAJAY, UNIVERSIDADE DO ESTADO DE SANTA CATARINA, Laguna-SC; LEONARDO CASTELO BRANCO, UNIVERSIDADE FEDERAL RURAL DA AMAZÔNIA, Belém-PA; ROOSEVELT D. S. BEZERRA, INSTITUTO FEDERAL DO PIAUÍ, Teresina-PI; ADRIANA MELLO DE ARAUJO, CPAP. |
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Título: |
Capra hircus outliers markers in Brazil: searching for genomic regions under the action of natural selection. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, v. 46, n. 3, e20230084, 2023. |
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ISSN: |
1678-4685 |
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DOI: |
https://doi.org/10.1590/1678-4685-GMB-2023-0084 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Identifying genome regions subject to selection in local breeds of Brazil is an opportunity to elucidate the C. hircus genome plasticity, flowing the colonization history of the country. Using SNP Bead Chip Illumina 50K genotyping of Brazilian Anglo-Nubian (standardized breed) and Marota (local endangered population from the semiarid area of Brazil) to show outliers loci in genome regions subject to selection. After applying data quality control, 45,600 SNPs were included in this investigation. Principal component analysis (PCAdapt) and FDIST2 analysis signalized 14 genomic regions more affected by selection in the Brazilian dry zone environment. The genome study signalized regions that are close to the sequences of genes related to growth and embryonic skeletal development (FGF12, AMPD2, OSTN). In addition, flagged regions close to the genes UTSB2 and SLC5A2 contribute to research on functional adaptation with low water needs and poor nutritive diet to survive. Both genes encode proteins that act on osmotic pathways and avoid cell flooding on stress cell responses. Further studies on the genetic role and involvement of these outliers? genomic regions, building a robust conceptual high-resolution map of natural selection drives, help to achieve hardiness candidate genes linked to the evolutionary history of Capra hircus in the semiarid area of Brazil. |
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Palavras-Chave: |
Candidate genes; Hardiness; Non-neutral loci; Outliers; Seleção natural; Tropical adaptation. |
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Thesagro: |
Capra Hircus; Caprino; Genoma; Seleção. |
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Thesaurus Nal: |
Genome; Natural selection. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1157489/1/gmb-2023.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pantanal (CPAP) |
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| Registros recuperados : 231 | |
| 121. |  | COSTA, M. da S.; ARAÚJO, A. M. de; MORAES, J. B. de; CASTELO BRANCO, J. da F.; SILVA, F. L. R. da; IBIAPINA NETO, V. Caracterização genética da raça local Serrana Azul no Estado do Piauí com uso de marcadores de microssatélites de DNA. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2008, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. p. 502.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 122. | | ARAÚJO, A. M. de; MORAES, J. B. de; AZEVÊDO, D. M. M. R.; LEAL, T. M.; RAMOS, A. F.; SOUSA JÚNIOR, A. C. de. Caracterização morfológica e seminal de caprinos locais Marota e Azul do Estado do Piauí. In: SIMPÓSIO DE RECURSOS GENÉTICOS PARA AMÉRICA LATINA Y EL CARIBE, SIRGEALC, 7, 2009, Pucón, Chile. Proceeding... Santiago de Chile: Ministério de Agricultura, Instituto de Investigaciones Agropecuarias, 2009. p. 223-224| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 123. | | COSTA, M. da S.; ALMEIDA, M. J. de O.; ARAUJO, A. M. de; CARVALHO, G. M. C.; PIMENTA FILHO, E. C.; RIBEIRO, M. N. Caracterização morfométrica de caprinos Marota do núcleo de conservação In situ. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 9., 2012, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBMA, 2012. 3 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 124. | | MENDES, R. R.; LIMA, B.; CARDOSO, J. P. B.; CAMPELO, J. E. G.; CARVALHO, G. M. C.; ARAUJO, A. M. de. Caracteristicas fenotípicas de galinhas caipiras (Gallus gallus domesticus) criadas no Maranhão. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA MEIO-NORTE, 2., 2016, Teresina. Anais da II Jornada Científica da Embrapa Meio-Norte. Teresina: Embrapa Meio-Norte, 2016. p. 86-88.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 125. | | IBIAPINA NETO, V.; PIRES, L. C.; ARAUJO, A. M. de; SILVA, F. J. V. da; COSTA, M. da S.; CAMPELO, J. E. G. Divergência genética de grupos de galinhas caipira da região meio-norte do brasil com base em marcadores biométricos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS; WORKSHOP EM BIOPROSPECÇÃO E CONSERVAÇÃO DE PLANTAS NATIVAS DO SEMI-ÁRIDO, 3.; WORKSHOP INTERNACIONAL SOBRE BIOENERGIA E MEIO AMBIENTE, 2010, Salvador. Bancos de germoplasma: descobrir a riqueza, garantir o futuro: anais. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 126. | | PIRES, L. C.; BARBOSA, A. D. de H.; MACHADO, T. M. M.; CARNEIRO, P. L. S.; ARAUJO, A. M. de; NOVAES, M. A. S. Diversidade fenotípica entre populações caprinas nordestinas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS; WORKSHOP EM BIOPROSPECÇÃO E CONSERVAÇÃO DE PLANTAS NATIVAS DO SEMI-ÁRIDO, 3.; WORKSHOP INTERNACIONAL SOBRE BIOENERGIA E MEIO AMBIENTE, 2010, Salvador. Bancos de germoplasma: descobrir a riqueza, garantir o futuro: anais. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 127. | | GOMES, L. P.; AZEVEDO, H. N. de; MENDONÇA, M. S. de; ARAÚJO, A. M. de; SANTOS, V. B. dos; LIMA, S. R.; MARINHO, J. T. de S. Divergência genética entre acessos de feijão-caupi por meio de análise multivariada. In: CONGRESSO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 4., 2016, Sorriso, MT. Feijão-caupi: avanços e desafios tecnológicos e de mercado: resumos. Brasília, DF : Embrapa, 2016. p. 170.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 128. | | ARAUJO, A. M. de; BEFFA, L. M.; ALMEIDA, M. J. de O.; ABREU, U. G. P. de; CAVALCANTE, D. H.; LEAL, T. M.; PAIVA, S. R. Crescimento e mortalidade em um rebanho de conservação de caprinos Marota no Brasil. Revista Científica de Produção Animal, v. 11, n. 2, p. 103-109, 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 129. | | ARAUJO, A. M. de; BEFFA, L. M.; ALMEIDA, M. J. de O.; ABREU, U. G. P. de; CAVALCANTE, D. H.; LEAL, T. M.; PAIVA, S. R. Crescimento e mortalidade em um rebanho de conservação de caprinos Marota no Brasil. Revista Científica de Produção Animal, v. 11, n. 2, p. 103-109, 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 130. | | SANTOS, A. da S.; SILVA, F. L. R. da; MEDEIROS, H. R. de; ARAÚJO, A. M. de; BEZERRA, F. G. S. Desempenho produtivo de raças nativas Moxotó e Canindé no semi-árido nordestino do Brasil. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 5.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE ALIMENTAÇÃO DE RUMINANTES, 11.; SIMPÓSIO SERGIPANO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 1., 2008, Aracaju. Anais... Aracaju: Sociedade Nordestina de Produção Animal; Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2008. 3 f.1 CD ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 131. | | SANTOS, A. da S.; SILVA, F. L. R. da S.; MEDEIROS, H. R. de; ARAÚJO, A. M. de; BEZERRA, F. G. S. Desempenho produtivo de raças nativas Moxotó e Canindé no semi-árido nordestino do Brasil. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 5.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE ALIMENTAÇÃO DE RUMINANTES, 11.; SIMPÓSIO SERGIPANO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 1., 2008, Aracaju. Anais... Aracaju: Sociedade Nordestina de Produção Animal: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2008. 3 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 132. | | CASTRO, M. F. de; HERNANDES, M. S. P.; GUEDES, K. M. R.; PERES, I. A. H. F. S.; ARAUJO, A. M. de. Desempenho de Ovinos Pantaneiros oriundos da fazenda Nhumirim- Embrapa Pantanal, Corumbá- MS. In: EVENTO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DO PANTANAL, 9., 2022, Corumbá. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2022. p. 15. Evinci 2022.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 133. | | SANTOS, N. P. da S.; BRANCO, J. da F. C.; CAMPELO, J. E. G.; SARMENTO, J. L. R.; ARAUJO, A. M. de; MACHADO, T. M. M. Descrição da caprinocultura em sistema extensivo de criação no Estado do Piauí. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 47., 2010, Salvador. Empreendedorismo e progresso científicos na zootecnia brasileira de vanguarda: anais. Salvador: SBZ, 2010. 3 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 134. | | SILVA JÚNIOR, M. S. F. S. da; BORGES, A. A. de S.; SANTOS, S. R. N.; MOURA, V. G. de; SILVA, G. R. da; ARAUJO, A. M. de. Eficiência de protocolos para extração de DNA com bulbos e sangue de galinhas caipiras. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA MEIO-NORTE, 4., 2018, Teresina, PI. Anais da IV Jornada Científica da Embrapa Meio-Norte. Brasília, DF: Embrapa, 2018. p. 36.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 135. | | PIRES, L. C.; MACHADO, T. M. M.; SANTOS, L. G. dos; EUCLYDES, R. F.; ARAUJO, A. M. de; CHAKIR, M.; ESPECHIT, C. J. B. Método do vizinho mais próximo no discernimento de populações caprinas. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 45., 2008, Lavras. Biotecnologia e sustentabilidade: anais dos resumos. Lavras: Sociedade Brasileira de Zootecnia: UFLA, 2008. 5 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 136. | | SILVA, F. A. S. e; BRANCO, J. da F. C.; ARAUJO, A. M. de; CAMPELO, J. E. G.; MACHADO, T. M. M.; COSTA, M. da S. Variabilidade fenotípica em caprinos do grupo naturalizado Nambi, no Estado do Piauí. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS; WORKSHOP EM BIOPROSPECÇÃO E CONSERVAÇÃO DE PLANTAS NATIVAS DO SEMI-ÁRIDO, 3.; WORKSHOP INTERNACIONAL SOBRE BIOENERGIA E MEIO AMBIENTE, 2010, Salvador. Bancos de germoplasma: descobrir a riqueza, garantir o futuro: anais. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 137. | | COSTA, M. da S.; PIRES, L. C.; ARAUJO, A. M. de; MACHADO, T. M. M.; CAMPELO, J. E. G.; BRANCO, J. da F. C. Variabilidade fenotípica em populações caprinas do Estado do Piauí. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS; WORKSHOP EM BIOPROSPECÇÃO E CONSERVAÇÃO DE PLANTAS NATIVAS DO SEMI-ÁRIDO, 3.; WORKSHOP INTERNACIONAL SOBRE BIOENERGIA E MEIO AMBIENTE, 2010, Salvador. Bancos de germoplasma: descobrir a riqueza, garantir o futuro: anais. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 138. | | ARAUJO, A. M. de; SILVA, F. L. R. D.; MOTTA, M. M.; MACHADO, T. M. M.; SANTOS, D. O.; CARVALHO, G. M. C. Taxa de nascimento no rebanho de conservação de caprinos Moxotó. In: SIMPOSIO DE RECURSOS GENÉTICOS PARA AMÉRICA LATINA Y EL CARIBE, SIRGEALC, 5., 2005, Montevideo, Uruguay. Resúmenes... Montevideo: Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria: Universidad de la República, Facultad de Agronomía, 2005. n. 299, p. 103| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 140. | | PIRES, L. C.; COSTA, M. da S.; MACHADO, T. M. M.; ARAUJO, A. M. de; BRANCO, J. da F. C.; PACHECO, R. de O. Variabilidade morfológica das populações caprinas por meio da análise de componentes principais. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS; WORKSHOP EM BIOPROSPECÇÃO E CONSERVAÇÃO DE PLANTAS NATIVAS DO SEMI-ÁRIDO, 3.; WORKSHOP INTERNACIONAL SOBRE BIOENERGIA E MEIO AMBIENTE, 2010, Salvador. Bancos de germoplasma: descobrir a riqueza, garantir o futuro: anais. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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