01594nam a2200217 a 450000100080000000500110000800800410001910000160006024500290007626000550010530000140016052010120017465000140118665000350120065300290123565300330126465300130129770000210131070000190133170000260135019186992012-03-14 2011 bl uuuu u0uu1 u #d1 aHIGA, R. H. aRPaternity. Versão 1.0. aCampinas: Embrapa Informática Agropecuáriac2011 c1 CD-ROM. aO RPaternity implementa um método para exclusão de paternidade utilizando como marcadores polimorfismos de base única. Ele é escrito em linguagem R e pressupõe que a genotipagem foi feita por meio da plataforma Illumina Beadchip. O método implementado pode ser encontrado na referência [1] e consiste no cálculo da probabilidade de exclusão, baseado em inconsistências mendelianas entre os genótipos do suposto pai (e mãe) e filho e as frequencias alélicas verificadas na população. Considera-se nos cálculos a particular situação em que o possível pai pode ser um parente próximo do pai verdadeiro, o que constitui uma necessidade no caso de análises de dados de melhoramento animal. Dado uma população genotipada, o software permite que sejam selecionados o conjunto de marcadores mais informativos para a realização de testes de exclusão de paternidade e, a partir deste conjunto de marcadores, realizar testes em batch (lista de supostos pais x lista de filhos, todos x todos). aPaternity aSingle nucleotide polymorphism aExclusão de paternidade aPolimorfismos de base única aSoftware1 aMUDADU, M. de A.1 aTIZIOTO, P. C.1 aREGITANO, L. de A. C.