01448nam a2200181 a 450000100080000000500110000800800410001910000180006024500940007826001140017252008670028665300090115365300170116265300250117970000210120470000190122570000220124419042642014-10-07       2011    bl uuuu     u00u1 u    #d1 aGUERRA, R. L.  aUm software para extração de ESTs, CONTIGS e SINGLETS do CAFEST.h[electronic resource]  aIn: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 7., 2011, Araxá. Anais... Brasília, DF: Embrapa Caféc2011  aUma das dificuldades encontrada atualmente para os usuários da base de dados do Projeto Brasileiro do Genoma Café (CafEST) é a dificuldade em extrair manualmente todas as sequências armazenadas em seus projetos, no sistema Gene Projects. A partir dessa necessidade, foi desenvolvido um software para fazer a automatização do processo. Desta forma, o usuário do CafEST passa a dispor da comodidade de apenas informar ao programa quais projetos ele deseja que tenham as ESTs, contigs ou singlets extraídos. O programa consiste em dois scripts, um para fazer a extração das ESTs e outro para fazer a extração dos contigs e dos singlets. Os dois scripts retiram do CafEST apenas as ESTs, os contigs e singlets e salvam cada um desses em um arquivo do tipo FASTA. Isto facilita o uso dos mesmos em outras bases de dados e/ou ferramentas de bioinformática  aESTs  aGenoma café  aProgramação Script1 aALVARENGA, S. M.1 aCAIXETA, E. T.1 aGOULART, C. de C.