01721nam a2200313 a 450000100080000000500110000800800410001910000160006024501080007626000550018430000100023949000680024952007390031765000150105665000200107165000330109165000250112465000260114965300250117565300390120065300230123965300080126265300260127070000210129670000240131770000210134170000260136270000190138818836232024-02-26       2010    bl uuuu     u0uu1 u    #d1 aHIGA, R. H.  aAnálise de agrupamento de dados de expressão gênica na Rede Genômica Animal.h[electronic resource]  aCampinas: Embrapa Informática Agropecuáriac2010  a11 p.  a(Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 101).  aO objetivo deste trabalho é apresentar a análise de agrupamento de dados de expressão gênica, conforme realizada no escopo da ?Rede Genômica Animal?. Na seção 2, são apresentados conceitos básicos sobre análises de agrupamento. Em particular, os algoritmos de agrupamento utilizados nessas análises compreendem aqueles mais conhecidos, como k-means, SOM e agrupamento hierárquico. A plataforma de análise escolhida para realização das análises de agrupamento na ?Rede Genômica Animal? é o ambiente de análise estatística R (R DEVELOPMENT CORE TEAM, 2010) e o projeto Bioconductor (GENTLEMAN et al., 2004). Assim, na seção 3 é apresentado um exemplo completo de análise de agrupamento e seu respectivo script R.  aAlgorithms  aGene expression  aPrincipal component analysis  aStatistical analysis  aAnálise Estatística  aAgrupamento de dados  aAnálise de componentes principais  aExpressão gênica  aPCA  aRede Genômica Animal1 aGIACHETTO, P. F.1 aYAMAGISHI, M. E. B.1 aIBELLI, A. M. G.1 aREGITANO, L. C. de A.1 aCARDOSO, F. F.