01678nam a2200229 a 450000100080000000500110000800800410001910000170006024501510007726000350022850001000026352009040036365000190126765000130128665300200129965300190131965300140133865300130135265300460136565300130141170000240142416611182010-10-19       2009    bl uuuu     u00u1 u    #d1 aHERAI, R. H.  aUma ferramenta WEB para identificação e visualização de sequências repetitivas em lócus gênico de animais e plantas.h[electronic resource]  aCampinas: EMBRAPA-CNPTIAc2009  aTrabalho apresentado na V Mostra de Trabalhos de Estagiários e Bolsistas, Campinas, out. 2009.  aSequências repetitivas (SR) em lócus gênico de animais e plantas podem estar envolvidas em diversos fenômenos biológicos, como interferência por RNAi (Fire et al., 1998) e trans-splicing (Di Segni et al., 2008). A maioria das SR localiza-se em regiões de introns e, usualmente, seus estudos envolvem apenas sequências de mRNA, sendo necessário a estrutura intron-exon dos genes. Desta forma, é preciso realizar um mapeamento dos genes em seu respectivo genoma de referência para identificação de quatro tipos de SR: repetição reversa e complementar, repetição direta e complementar, repetição reversa e repetição direta. Este trabalho apresenta uma ferramenta WEB, chamada RepGraph, a qual integra algoritmos e ferramentas de bioinformática para identificar os pares que formam cada tipo de SR e uma representação gráfica para ilustrar sua relação em dois lócus gênicos.  aBioinformatics  aGenomics  aBioinformática  aFerramenta Web  aGenômica  aRepGraph  aSequências repetitivas em lócus gênico  aWeb tool1 aYAMAGISHI, M. E. B.