02271naa a2200217 a 450000100080000000500110000800800410001902200140006010000230007424501300009726000090022752016010023665000230183765300200186065300120188065300080189270000210190070000240192170000190194577300890196416550062023-06-28       2008    bl uuuu     u00u1 u    #d  a0100-29451 aOLIVEIRA, E. J. de  aIdentificação de microssatélites para o mamoeiro por meio da exploração do banco de dados de DNA.h[electronic resource]  c2008  aOs marcadores microssatélites são ferramentas úteis em diversas análises genéticas em plantas. No caso do mamoeiro (Carica papya L.), poucos locos de microssatélites foram descritos até o momento. Assim, o objetivo deste trabalho foi explorar a base de dados do GenBank/NCBI (National Center of Biotechnology Information) à procura de microssatélites de mamoeiro, visando a seu futuro uso em estudos genéticos e moleculares aplicados ao melhoramento genético. As sequências foram obtidas no GenBank/NCBI, no formato FASTA, e analisadas para a presença de microssatélites com um mínimo de 20; 7 e 5 repetições dos motivos de mono-, di- e trinucleotídeos, respectivamente, e acima de 4 repetições para tetra- e pentanucleotídeos. Sequências com mais de 90% de similaridade foram consideradas redundantes e, portanto, eliminadas das análises. Foram analisadas 44.591 sequências, das quais 3.180 foram não-redundantes e apresentaram 3.947 microssatélites. Desse total, 3.587 foram classificados como microssatélites perfeitos, 8 imperfeitos, 65 interrompidos, 239 compostos-perfeitos, 8 compstos-imperfeitos e 40 compostos-interrompidos. As repetições de di- e trinucleotídeos representaram 65,7 e 14,4% do total de sequências analisadas, respectivamente. Somente os motivos do tipo AT/TA representaram 44,1% dos microssatélites encontrados. Os motivos mais comuns de tri-, tetra- e pentanucleotídeos foram AAT, AATT e TTTAA, respectivamente. Observou-se que, nas sequências disponíveis, o genoma do mamoeiro apresenta, me média, um microssatélite a cada 5,65 Kb.  aMarcador Molecular  aCarica papaya L  aGenBank  aSSR1 aDANTAS, J. L. L.1 aCASTELLEN, M. da S.1 aMACHADO, M. D.  tRevista Brasileira de Fruticultura, Jaboticabalgv. 30, n. 3, p. 841-845, set. 2008.