01858nam a2200205 a 450000100080000000500110000800800410001910000160006024500980007626000160017430000110019050001970020152011440039865000150154265000140155765300240157165300140159565300120160965300310162115798482010-04-22 2009 bl uuuu m 00u1 u #d1 aHIGA, R. H. aPredição de regiões de interface proteína-proteína baseada em informações estruturais. a2009.c2009 a134 p. aTese (Doutorado em Engenharia Elétrica. Área de concentração Engenharia de Computação) - Faculdade de Engenharia Elétrica e de Computação, Universidade Estadual de Campinas, Campinas. aEste trabalho aborda o problema de predição de regiões de interface proteína-proteína, baseado em medidas de propriedades físico-químicas e estruturais. A abordagem considera os aminoácidos da superfície da proteína como unidades básicas para classificação, o que elimina a restrição de uso de patches, considerada por preditores do mesmo tipo. Este preditor é complementado por um segundo preditor, que identifica, dentre os aminoácidos da interface, os mais relevantes do ponto de vista de energia de ligação proteína-proteína, conhecidos como hot spots. A abordagem apresentada permite a utilização dos classificadores de forma independente na predição dos aminoácidos de interface e de hot spots. Diferente de outras abordagens encontradas na literatura para predição de hot spots, que a predição de hot spots seja realizada em complemento à predição dos aminoácidos da interface. O desempenho alcançado pelo preditor na identificação de hot spots é superior ao obtido por outros preditores descritos na literatura e que utilizam o mesmo conjunto de dados e critério de avaliação de desempenho. aPrediction aProteína aPattern recognition aPrevisão aProtein aReconhecimento de padrões