02638nam a2200313 a 450000100080000000500110000800800410001910000250006024501450008526001740023030000090040450001430041352014330055665000200198965300230200965300230203265300270205565300230208265300250210565300110213065300240214165300260216565300360219170000210222770000210224870000160226970000220228570000170230721141892019-11-14       2019    bl uuuu     u00u1 u    #d1 aGUIMARÃES, P. de S.  aValidação de retrotransposons ativos em café-efeitos de estresse abiótico e baixa cafeína na expressão gênica.h[electronic resource]  aIn: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória, ES. Pesquisa, inovação e sustentabilidade dos cafés do Brasil. Brasília, DF: Embrapa Caféc2019  a4 p.  aTítulo em inglês: Validation of active retrotransposons in coffee-effects of abiotic stress and low caffeine content on gene expression.  aRESUMO: A identificação de perfis de expressão gênica diferenciais e redes metabólicas é uma ferramenta valiosa para a caracterização genética de caracteres agronômicos. Neste estudo, utilizamos análises de expressão em larga-escala para identificar processos biológicos alterados em plantas com teores reduzidos de cafeína. A expressão diferencial de genes selecionados observada in silico foi então validada em experimentos in vivo. O primeiro passo foi o sequenciamento em larga-escala de RNA extraído de tecidos jovens e em desenvolvimento, de plantas sem cafeína e de plantas com concentrações normais do composto. As sequências obtidas foram agrupadas, a partir de análises in silico, para identificação de genes com expressão diferencial entre os tratamentos e de redes metabólicas associadas aos teores de cafeína. Para a validação das análises in silico, selecionamos 3 genes de famílias de retrotransposons para análises de qRT-PCR em gemas e folhas coletadas de plantas normais (MN) e sem cafeína (AC), tanto em condições normais quanto durante déficit hídrico. O perfil de expressão dos genes estabelecido por qRT-PCR foi distinto do observado nas análises de RNAseq. Além disso, os resultados sugerem que plantas AC possuem uma maior suscetibilidade ao estresse hídrico, uma vez que a expressão de retrotransposons é mais alta em folhas e gemas de plantas AC do que em MN.  aGene expression  aAssisted-selection  aExpressão gênica  aMelhoramento molecular  aMolecular breeding  aPlantas sem cafeína  aRNAseq  aSeleção-assistida  aSequenciamento de RNA  aSequenciamento de transcriptoma1 aSCHENK, J. C. M.1 aGIACHETTO, P. F.1 aPADILHA, L.1 aSILVAROLLA, M. B.1 aMALUF, M. P.