02711nam a2200325 a 450000100080000000500110000800800410001902000220006010000180008224501110010026001980021130000160040950000540042552015470047965000140202665000130204065000140205365000350206765300460210265300310214865300090217965300400218865300150222865300420224365300240228570000200230970000170232970000160234670000230236220833732020-01-21 2017 bl uuuu u00u1 u #d a978-85-85783-75-41 aVIEIRA, F. D. aBDGFbum sistema web para recuperação de informação de genótipos e fenótipos.h[electronic resource] aIn: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROINFORMÁTICA, 11., 2017, Campinas. Ciência de dados na era da agricultura digital: anais. Campinas: Editora da Unicamp: Embrapa Informática Agropecuáriac2017 ap. 429-438. aSBIAgro 2017. Na publicação: Adhemar Zerlotini. aNos últimos anos, o uso de genotipagem em grande escala de dezenas ou centenas de milhares de polimorfismos de nucleotídeo único (SNP) para estimar o perfil genômico de animais permitiu o desenvolvimento de estudos de associação genótipo-fenótipo em escala genômica (GWAS) e a introdução da tecnologia de seleção genômica em programas de melhoramento genético. No entanto, esta situação implica na necessidade de armazenamento de grande volume de dados de genotipagem, fenotipagem e pedigree de um elevado número de animais. Para integrar esse volume de dados distintos, é primordial utilizar uma estrutura de armazenamento robusta, como um SGBD. Assim, uma questão importante a considerar é o equilíbrio entre normalização e desempenho durante o estágio de modelagem de banco de dados, pois isso terá um impacto direto na usabilidade e na experiência do usuário. Buscando resolver esse problema de armazenamento eficiente e consultas rápidas num grande volume de dados, este trabalho apresenta o sistema BDGF (Banco de Dados de Genótipos e Fenótipos). Seu modelo de dados permite a implementação do tipo JSON em campos de tabelas relacionadas a fenótipos e do tipo texto em campos da tabela genótipos. BDGF foi projetado para dar suporte a projetos de criação de animais da Embrapa, mas pode ser facilmente ajustado para armazenar dados de diversas fontes, tais como dados de plantas. Além disso, o sistema implementa políticas de acesso e segurança para fenótipos, genótipos e pedigree dos animais. aDatabases aGenotype aPhenotype aSingle nucleotide polymorphism aBanco de Dados de Genótipos e Fenótipos aJavaScript Object Notation aJSON aPolimorfismo de nucleotídeo único aPostgreSQL aSistema Gerenciador de Banco de Dados aTecnologias Java EE1 aMOURA, D. G. de1 aSILVA, D. F.1 aHIGA, R. H.1 aZERLOTINI NETO, A.