BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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1.Imagem marcado/desmarcadoFALCÃO, P. R. K.; HERAI, R. H. FOC-Control. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 1 CD-ROM.

Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária.

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2.Imagem marcado/desmarcadoFALCÃO, P. R. K.; HERAI, R. H. Foc-Web. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 1 CD-ROM.

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3.Imagem marcado/desmarcadoCAMINHA, I. P.; FALCAO, P. R. K. Estudos estruturais das enzimas envolvidas com o mecanismo de produção de ácidos orgânicos da bactéria G. Diazotrophicus utilizando métodos computacionais. Campinas: EMBRAPA-CNPTIA, 2009. Trabalho apresentado na V Mostra de Trabalhos de Estagiários e Bolsistas, Campinas, out. 2009.

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4.Imagem marcado/desmarcadoMORETTI, L.; FALCÃO, P. R. K. Incorporação do Redmine como ferramenta de gestão dos processos do Laboratório Multiusuário de Bioinformática da Embrapa. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 10., 2014, Campinas. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2014. p. 13-16.

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5.Imagem marcado/desmarcadoFALCÃO, P. R. K.; GIACHETTO, P. F. Multilab bioinformática: laboratório avançado multiusuário de bioinformática da Embrapa. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 1 folder.

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6.Imagem marcado/desmarcadoFALCAO, P. R. K.; TEIXEIRA, K. R. dos. Evaluation of point mutation in genes related to ketogluconic acid production by Gluconacetobacter diazotrophicus. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 4., 2008, Salvador. Proceedings... Salvador: AB³C, 2008. Não paginado. X-Meeting 2008.

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7.Imagem marcado/desmarcadoFALCÃO, P. R. K.; TEIXEIRA, K. R. dos S. Evaluation of point mutation in genes related to ketogluconic acid production by Gluconacetobacter diazotrophicus. X-MEETING INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C , 4., 14 a 16 de setembro de 2008, Salvado, BA. Resumos... Salvador, BA, 2008.

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8.Imagem marcado/desmarcadoRIBEIRO, C.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G.; SANTORO, M. Serine proteases analysis based on phylogenetic trees constructed from the sequence and structure alignments. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster I-48. Na publicação: Paula Kuser.

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9.Imagem marcado/desmarcadoBRANDÃO, M. M.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G. Structural parameters to filter crucial catalytic site aminoacids from fructose 1,6-bisphosphate aldolase. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster I-21. Na publicação: Paula R. Kuser.

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10.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, E. H. dos; FALCÃO, P. R. K.; NESHICH, G. VPRO - um identificador de padrões de seqüências. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2007. 6 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 81). Acesso em: 28 maio 2008.

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11.Imagem marcado/desmarcadoMANCINI, A. L.; HIGA, R. H.; FALCÃO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; NESHICH, G. Cálculo de possíveis contatos atômicos internos a uma proteína ou entre proteínas no software SMS. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2003. 8 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado Técnico, 59). Acesso em: 30 maio 2008.

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12.Imagem marcado/desmarcadoJESUS, K. R. E. de; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G. The Cry 1Ac protein from Bacillus thuringiensis and its structure stability centers. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster I-47. Na publicação: Paula Kuser.

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13.Imagem marcado/desmarcadoGIACHETTO, P. F.; FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B. An approach based on gene co-expression in searching for genes involved in bovine tick-resistance. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Abstracts book... Angra dos Reis: ABBCB, 2009. Não paginado. X-Meeting 2009.

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14.Imagem marcado/desmarcadoBAMBINI, M. D.; GIACHETTO, P. F.; FALCAO, P. R. K.; OLIVEIRA, F. S. de. Emerging biotechnologies: bioinformatics services applied to agriculture. In: CONGRESSO LATINO-IBEROAMERICANO DE GESTÃO DA TECNOLOGIA, 16., 2015, Porto Alegre. Inovação para além da tecnologia: anais. Porto Alegre: Universidade Federal do Rio Grande do Sul, 2015. Não paginado. Altec 2015.

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15.Imagem marcado/desmarcadoJESUS, K. R. E. de; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G. Structural analyses of CRY 1Ac protein from Bacillus thuringiensis. In: X-MEETING INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 1., 2005, Caxambu/MG. Presented posters. Caxambu/MG: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2005. p. 133.

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16.Imagem marcado/desmarcadoCAMINHA, I. P.; FALCAO, P. R. K.; TEIXEIRA, K. R. dos S. Structural studies gluconate 5-dehydrogenase from gluconacetobacter diazotrophicus. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Abstracts book... Angra dos Reis: ABBCB, 2009. Não paginado. X-Meeting 2009.

Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia.

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17.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; FALCÃO, P. R. K.; VIEIRA, F. D.; HERAI, R. H. An indirect evidence of the Fibonacci String model for DNA repetitive sequence growth. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 3., 2007, São Paulo. Proceedings... Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2007. p. 58. X-Meeting 2007.

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18.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, M. T.; FERRAZ, L. F. C.; REIS, F. C.; FALCÃO, P. R. K.; NESHICH, G.; OTTOBONI, L. M. M. Análise estrutural e funcional da proteína CMP quinase de Acidithiobacillus ferrooxidans. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 51., 2005, Águas de Lindóia. Resumos... Águas de Lindóias: SBG, 2005. p. 1075. Na publicação: Falcão, PK.

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19.Imagem marcado/desmarcadoGUELFI, A.; CHABREGAS, S. M.; FALCO, M. C.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G.; AZEVEDO, R. A. Molecular dynamics analysis of glutathione transferases sugarcane mutants and their interactions with atrazine. In: X-MEETING; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 1., 2005, Caxambu. [Proceedings...]. [S.l.]: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2005. p. 94. X-meeting 2005. Presented posters.

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20.Imagem marcado/desmarcadoSIMÕES, M.; BAHIA, D.; TORRES, K.; ZERLOTINI NETO, A.; ARTIGUENAVE, F.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G.; OLIVEIRA, G. SNP identification in Schistosoma mansoni expressed genes. In: X-MEETING; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 1., 2005, Caxambu. [Proceedings...]. [S.l.]: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2005. p. 131. X-meeting 2005. Presented Posters. Na publicação: Paula Kuser.

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Registro Completo

Biblioteca(s):  Embrapa Informática Agropecuária.
Data corrente:  25/04/2006
Data da última atualização:  17/01/2020
Tipo da produção científica:  Resumo em Anais de Congresso
Autoria:  SIMÕES, M.; BAHIA, D.; TORRES, K.; ZERLOTINI NETO, A.; ARTIGUENAVE, F.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G.; OLIVEIRA, G.
Afiliação:  MARIANA SIMÕES, Fiocruz; DIANA BAHIA, Fiocruz; KLEIDER TORRES, Fiocruz; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; FRANÇOIS ARTIGUENAVE, Fiocruz; PAULA REGINA KUSER FALCAO, CNPTIA; GORAN NESIC, CNPTIA; GUILHERME OLIVEIRA, Fiocruz.
Título:  SNP identification in Schistosoma mansoni expressed genes.
Ano de publicação:  2005
Fonte/Imprenta:  In: X-MEETING; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 1., 2005, Caxambu. [Proceedings...]. [S.l.]: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2005.
Páginas:  p. 131.
Idioma:  Inglês
Notas:  X-meeting 2005. Presented Posters. Na publicação: Paula Kuser.
Conteúdo:  Schistosomes are parasitic platyhelminths that cause a chronic. often debilitating disease afflicting over 200 million people worldwide. The study of genetic polymorphisms in Schistosomes is important for vaccine and drug development, in addition to the understanding of the genetic structure of populations. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) are the most frequent form of DNA variation, they are abundant and have low mutation rates. SNPs are thought to be the next generation of genetic markers that can be used in many of important biological, genetic, pharmacological and medical applications (Thiel et al, 2004). The aim of this project is to identify in silico SNPs (Useche et al, 2001) in ESTs of Schistosoma mansoni, verify their presence in vaccine and drug target candidates and validate putative SNPs using the cathepsin B gene as a model. The S mansoni cathepin B is a proteolytic enzyme that has been evaluated for development of vaccines and new drugs. It is expressed in the parasite gut and it is believed to function in the digestion of haemoglobin, the main nutrient source for the parasite (Sajid and McKerrow, 2002.) The source of ESTs were 61.002 ESTs generated by Minas Gerais Genome Network, all with quality files base called by Phred (Ewing and Green et al, 2004). The sequences were clustered using Phrap, followed by the identification of putative SNPs applying a novel detection algorithm written by our group, cSNPer. A pre-selection of candidate sequence polymorph... Mostrar Tudo
Palavras-Chave:  Bioinformática; Polimorfismo de nucleotídeo único.
Thesagro:  Schistosoma mansoni.
Thesaurus NAL:  Bioinformatics; Single nucleotide polymorphism.
Categoria do assunto:  X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Informática Agropecuária (CNPTIA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status
CNPTIA11156 - 2UPCPC - DD570.285XME2006.00009
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