BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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1.Imagem marcado/desmarcadoCAMINHA, I. P.; FALCAO, P. R. K. Estudos estruturais das enzimas envolvidas com o mecanismo de produção de ácidos orgânicos da bactéria G. Diazotrophicus utilizando métodos computacionais. Campinas: EMBRAPA-CNPTIA, 2009. Trabalho apresentado na V Mostra de Trabalhos de Estagiários e Bolsistas, Campinas, out. 2009.

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2.Imagem marcado/desmarcadoFALCÃO, P. R. K.; GIACHETTO, P. F. Multilab bioinformática: laboratório avançado multiusuário de bioinformática da Embrapa. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 1 folder.

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3.Imagem marcado/desmarcadoMORETTI, L.; FALCÃO, P. R. K. Incorporação do Redmine como ferramenta de gestão dos processos do Laboratório Multiusuário de Bioinformática da Embrapa. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 10., 2014, Campinas. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2014. p. 13-16.

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4.Imagem marcado/desmarcadoFALCÃO, P. R. K.; HERAI, R. H. FOC-Control. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 1 CD-ROM.

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5.Imagem marcado/desmarcadoFALCÃO, P. R. K.; HERAI, R. H. Foc-Web. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 1 CD-ROM.

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6.Imagem marcado/desmarcadoRIBEIRO, C.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G.; SANTORO, M. Serine proteases analysis based on phylogenetic trees constructed from the sequence and structure alignments. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster I-48. Na publicação: Paula Kuser.

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7.Imagem marcado/desmarcadoFALCAO, P. R. K.; TEIXEIRA, K. R. dos. Evaluation of point mutation in genes related to ketogluconic acid production by Gluconacetobacter diazotrophicus. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 4., 2008, Salvador. Proceedings... Salvador: AB³C, 2008. Não paginado. X-Meeting 2008.

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8.Imagem marcado/desmarcadoFALCÃO, P. R. K.; TEIXEIRA, K. R. dos S. Evaluation of point mutation in genes related to ketogluconic acid production by Gluconacetobacter diazotrophicus. X-MEETING INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C , 4., 14 a 16 de setembro de 2008, Salvado, BA. Resumos... Salvador, BA, 2008.

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9.Imagem marcado/desmarcadoBRANDÃO, M. M.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G. Structural parameters to filter crucial catalytic site aminoacids from fructose 1,6-bisphosphate aldolase. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster I-21. Na publicação: Paula R. Kuser.

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10.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, E. H. dos; FALCÃO, P. R. K.; NESHICH, G. VPRO - um identificador de padrões de seqüências. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2007. 6 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 81). Acesso em: 28 maio 2008.

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11.Imagem marcado/desmarcadoGIACHETTO, P. F.; FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B. An approach based on gene co-expression in searching for genes involved in bovine tick-resistance. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Abstracts book... Angra dos Reis: ABBCB, 2009. Não paginado. X-Meeting 2009.

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12.Imagem marcado/desmarcadoBAMBINI, M. D.; GIACHETTO, P. F.; FALCAO, P. R. K.; OLIVEIRA, F. S. de. Emerging biotechnologies: bioinformatics services applied to agriculture. In: CONGRESSO LATINO-IBEROAMERICANO DE GESTÃO DA TECNOLOGIA, 16., 2015, Porto Alegre. Inovação para além da tecnologia: anais. Porto Alegre: Universidade Federal do Rio Grande do Sul, 2015. Não paginado. Altec 2015.

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13.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; FALCÃO, P. R. K.; VIEIRA, F. D.; HERAI, R. H. An indirect evidence of the Fibonacci String model for DNA repetitive sequence growth. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 3., 2007, São Paulo. Proceedings... Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2007. p. 58. X-Meeting 2007.

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14.Imagem marcado/desmarcadoMANCINI, A. L.; HIGA, R. H.; FALCÃO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; NESHICH, G. Cálculo de possíveis contatos atômicos internos a uma proteína ou entre proteínas no software SMS. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2003. 8 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado Técnico, 59). Acesso em: 30 maio 2008.

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15.Imagem marcado/desmarcadoJESUS, K. R. E. de; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G. The Cry 1Ac protein from Bacillus thuringiensis and its structure stability centers. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. Na publicação: Paula Kuser. Poster I-47. ISMB, X-MEETING 2006.

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16.Imagem marcado/desmarcadoJESUS, K. R. E. de; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G. Structural analyses of CRY 1Ac protein from Bacillus thuringiensis. In: X-MEETING INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 1., 2005, Caxambu/MG. Presented posters. Caxambu/MG: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2005. p. 133.

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17.Imagem marcado/desmarcadoCAMINHA, I. P.; FALCAO, P. R. K.; TEIXEIRA, K. R. dos S. Structural studies gluconate 5-dehydrogenase from gluconacetobacter diazotrophicus. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Abstracts book... Angra dos Reis: ABBCB, 2009. Não paginado. X-Meeting 2009.

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18.Imagem marcado/desmarcadoSIMÕES, M.; BAHIA, D.; TORRES, K.; ZERLOTINI NETO, A.; ARTIGUENAVE, F.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G.; OLIVEIRA, G. SNP identification in Schistosoma mansoni expressed genes. In: X-MEETING; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 1., 2005, Caxambu. [Proceedings...]. [S.l.]: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2005. p. 131. X-meeting 2005. Presented Posters. Na publicação: Paula Kuser.

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19.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, M. T.; FERRAZ, L. F. C.; REIS, F. C.; FALCÃO, P. R. K.; NESHICH, G.; OTTOBONI, L. M. M. Análise estrutural e funcional da proteína CMP quinase de Acidithiobacillus ferrooxidans. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 51., 2005, Águas de Lindóia. Resumos... Águas de Lindóias: SBG, 2005. p. 1075. Na publicação: Falcão, PK.

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20.Imagem marcado/desmarcadoGUELFI, A.; CHABREGAS, S. M.; FALCO, M. C.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G.; AZEVEDO, R. A. Molecular dynamics analysis of glutathione transferases sugarcane mutants and their interactions with atrazine. In: X-MEETING; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 1., 2005, Caxambu. [Proceedings...]. [S.l.]: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2005. p. 94. X-meeting 2005. Presented posters.

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Biblioteca(s):  Embrapa Informática Agropecuária.
Data corrente:  20/04/2006
Data da última atualização:  17/01/2020
Tipo da produção científica:  Resumo em Anais de Congresso
Autoria:  GUELFI, A.; CHABREGAS, S. M.; FALCO, M. C.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G.; AZEVEDO, R. A.
Afiliação:  Esalq/USP; Centro de Tecnologia Canavieira, Piracicaba; Centro de Tecnologia Canavieira, Piracicaba; PAULA REGINA KUSER FALCAO, CNPTIA; GORAN NESIC, CNPTIA; Esalq/USP.
Título:  Molecular dynamics analysis of glutathione transferases sugarcane mutants and their interactions with atrazine.
Ano de publicação:  2005
Fonte/Imprenta:  In: X-MEETING; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 1., 2005, Caxambu. [Proceedings...]. [S.l.]: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2005.
Páginas:  p. 94.
Idioma:  Inglês
Notas:  X-meeting 2005. Presented posters.
Conteúdo:  The glutathione transferases (GSTs; EC 2.5.1.18) consist of soluble and dimeric proteins, which are important in the metabolism of drugs and xenobiotics. GSTs have been found in virtually all plants, vertebrates, insects, yeasts and bacteria. These enzymes, with approximately 50 kDa, catalyze the conjugation of glutathione (GSH; gamma-Glu-Cys-Gly) with a broad variety of electrophilic compounds. The active site of these enzymes consists of two domains, the G-site where glutathione is attached and the H-site, the hydrophobic binding pocket. In crops, many herbicide families are susceptible to glutathione conjugation like triazinones, sulfonylureas and thiocarbamates. This conjugation is one of the major mechanisms of resistance found in plants, which protects plants from the presence of herbicides. One example is the accelerated atrazine detoxifícation via GSH conjugation in the resistant biotype of some weeds, due to enhanced kcat for GST activity. The knowledge of the mechanisms of resistance is important for the development of resistant varieties of commercial crops. Therefore, the present work aimed to characterize the ligand pocket of sugarcane GST I, propose mutants and analyze the interactions with the herbicide atrazine. The molecular modelings of mutants GST were carried out with Modeller 7v7. The program Gromacs 3.2 was used for energy minimization and molecular dynamics. STING was used for GST characterization and LPC software for GST-atrazine interactions of the p... Mostrar Tudo
Palavras-Chave:  Bioinformática.
Thesagro:  Atrazina.
Thesaurus NAL:  Atrazine; Bioinformatics; Glutathione transferase.
Categoria do assunto:  X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Informática Agropecuária (CNPTIA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status
CNPTIA11132 - 2UPCPC - DD570.285XME2006.00009
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